Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_D01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  62811768

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   

This is table  50  of  211  ( 25234 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13432707--13432963
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6.0
43
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3
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1.97
13432703--13432924
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2.6
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2
275
21
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32
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1.96
13432722--13432963
85
2.8
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82
3
274
22
19
29
27
1.98
13432896--13433190
162
1.8
162
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1
493
22
21
23
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13433201--13433244
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2.0
22
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20
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0
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0
0
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0
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0
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0
0
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1.00
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0
0
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2.1
23
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61
2
0
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1.08
13446878--13447152
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45
5
0
50
1.23
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12
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42
6
0
51
1.26
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30
2.4
30
82
8
87
47
4
1
46
1.30
13451987--13452058
20
3.6
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47
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47
1.30
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3.0
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54
38
36
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1.56
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2.8
21
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33
0
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21
1.64
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2.3
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81
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33
40
2
22
1.67
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1.9
40
91
0
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17
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1.95
13454042--13454088
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5.2
9
87
7
69
63
2
0
34
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13454059--13454113
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1
0
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1.01
13459240--13459320
26
3.1
25
85
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108
55
0
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37
1.28
13459240--13459320
27
3.1
25
85
8
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55
0
7
37
1.28
13463554--13463746
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11
117
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21
19
1.92
13463789--13464041
65
3.9
65
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4
271
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20
18
24
1.95
13483692--13483899
27
7.8
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2
186
20
15
19
43
1.88
13483692--13483909
54
4.1
53
77
3
215
20
15
20
44
1.87
13487974--13487998
13
1.9
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0
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1.76
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1.9
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100
0
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25
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19
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23
28
1.99
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2.5
12
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20
16
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1.95
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2.4
88
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2
281
30
20
17
32
1.95
13527256--13527318
25
2.5
25
82
5
74
31
20
28
19
1.97
13527286--13527362
24
3.2
23
77
14
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38
20
23
16
1.92
13527273--13527461
25
7.6
26
68
18
66
36
18
25
19
1.94
13529471--13529577
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2.7
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153
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20
26
23
1.99
13529582--13529727
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3.5
42
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170
22
17
24
35
1.95
13538490--13538543
22
2.4
23
75
3
56
74
3
7
14
1.18
13543793--13543836
21
2.2
20
91
4
70
31
22
15
29
1.95
13543797--13543842
21
2.2
21
84
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58
36
21
13
28
1.91
13544263--13544296
16
2.1
16
88
0
50
50
14
17
17
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
21
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0
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1.98
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14
2.1
14
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0
51
30
0
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16
1.44
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16
2.1
17
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52
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2
14
73
1.19
13574340--13574379
21
1.9
21
89
0
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10
1.71
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2.1
17
100
0
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5
25
17
1.67
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12
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102
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19
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1.97
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28
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30
31
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15
1.95
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17
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37
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0
0
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0
40
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28
5
4
62
1.36
13618585--13618759
35
5.1
34
64
16
85
28
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4
62
1.36
13620943--13621177
51
4.7
51
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363
28
24
15
31
1.96
13623678--13623747
23
3.0
24
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101
34
24
18
22
1.96
13623966--13624004
18
2.2
17
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46
20
0
33
1.51
13625244--13625512
68
3.8
68
87
9
380
27
7
4
61
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13625239--13625512
139
1.9
145
91
5
461
27
7
4
61
1.40
13625234--13625512
71
3.9
72
89
7
444
26
7
4
62
1.40
13625240--13625552
139
2.3
139
86
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383
24
8
4
62
1.42
13629483--13629552
35
2.0
35
100
0
140
57
11
11
20
1.64
13629484--13629564
35
2.4
32
90
10
119
58
9
11
20
1.61
13633832--13633893
21
2.9
21
82
2
70
27
22
9
40
1.85
13635163--13635192
12
2.5
12
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0
51
46
3
0
50
1.18
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4.2
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177
30
27
18
24
1.98
13638582--13638739
84
1.9
84
82
5
203
30
27
18
24
1.98
13638926--13638955
14
2.1
14
93
0
51
50
13
6
30
1.67
13643541--13643592
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2.5
21
74
0
50
40
38
0
21
1.53
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14
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15
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12
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42
28
0
28
1.56
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29
2.4
31
80
13
89
43
40
0
16
1.48
13643790--13643861
15
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15
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53
43
40
0
16
1.48
13644277--13644509
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41
82
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265
34
25
21
18
1.96
13644277--13644509
123
1.9
121
83
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299
34
25
21
18
1.96
13644742--13644884
69
2.0
70
82
5
173
30
10
11
46
1.74
13645520--13646483
114
8.4
114
83
7
1220
34
18
21
25
1.96
13645517--13646483
227
4.2
227
84
8
1278
35
18
21
24
1.96
13645520--13646596
227
4.7
226
82
9
1028
34
19
21
24
1.96
13646071--13646596
114
4.6
110
81
6
470
34
18
21
25
1.95
13646978--13647026
7
7.0
7
81
9
55
10
0
44
44
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13646978--13647026
21
2.3
21
85
0
62
10
0
44
44
1.37
13649040--13649143
45
2.3
44
85
11
131
32
6
18
42
1.76
13649085--13649109
10
2.5
10
100
0
50
28
8
20
44
1.79
13649529--13649601
21
3.3
21
67
23
60
30
5
4
60
1.38
13649550--13649587
14
2.8
13
88
11
58
34
0
0
65
0.93
13650295--13650852
9
65.4
9
64
20
132
44
17
1
35
1.61
13650297--13650847
25
22.0
25
71
13
200
44
17
1
35
1.60
13650465--13650547
43
1.9
43
82
4
105
46
20
0
32
1.51
13650484--13650645
41
3.9
41
87
1
189
43
16
3
37
1.64
13650572--13650605
16
2.1
16
88
0
50
41
14
5
38
1.70
13650725--13650763
16
2.4
17
83
12
55
48
25
0
25
1.51
13650751--13650839
16
5.7
16
72
22
73
49
15
0
34
1.45
13655744--13655796
21
2.5
21
84
6
63
30
11
45
13
1.78
13656217--13656348
45
3.0
43
80
8
140
31
19
28
21
1.97
13656179--13656351
44
3.9
42
77
10
150
31
19
26
23
1.98
13660131--13660164
17
2.1
16
88
5
50
23
32
17
26
1.97
13662564--13662624
29
2.1
29
81
0
68
18
32
36
13
1.89
13676095--13676438
133
2.6
133
86
2
460
28
21
24
25
1.99
13676313--13676523
88
2.4
88
91
0
323
27
20
23
27
1.99
13676179--13676466
44
6.5
43
71
13
235
27
22
23
26
2.00
13676180--13676517
44
7.7
44
69
10
176
27
21
23
26
1.99
13682542--13682567
7
3.7
7
100
0
52
88
0
11
0
0.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13682536--13682572
14
2.6
14
82
0
56
81
5
8
5
0.99
13683487--13683521
14
2.5
14
85
0
52
71
0
14
14
1.15
13684719--13685037
131
2.4
131
93
0
539
30
21
24
23
1.99
13685134--13685249
44
2.7
43
85
4
128
24
20
26
28
1.99
13686390--13686475
25
3.7
23
80
13
95
30
3
3
62
1.28
13691469--13691610
9
15.0
9
68
16
74
38
0
16
45
1.52
13691469--13691691
30
7.5
30
83
11
291
38
0
15
45
1.50
13691720--13691808
9
9.9
9
74
4
81
37
1
17
43
1.57
13691943--13691985
19
2.2
20
83
4
52
60
0
2
37
1.10
13692654--13692698
21
2.1
21
91
0
72
48
13
26
11
1.75

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211