Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr8
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  70076365

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   

This is table  18  of  210  ( 25174 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6015248--6015278
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2.1
15
100
0
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61
12
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0
0
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0
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0
0
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0.76
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2
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0
0
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0
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79
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9
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64
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0
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0
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2.1
216
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17
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8
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26
17
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4.5
51
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10
223
27
26
17
27
1.97
6030885--6031168
102
2.8
100
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4
365
28
27
16
27
1.97
6030826--6031151
51
6.5
50
74
7
180
28
26
16
28
1.97
6030826--6031168
153
2.3
149
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6
352
28
26
16
27
1.97
6032302--6032360
14
4.4
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12
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71
0
0
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6032302--6032360
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2.2
27
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3
66
71
0
0
28
0.87
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30
2.7
29
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9
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41
2
0
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0
0
50
1.00
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2
0
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1.14
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0
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2.0
22
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1.8
194
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16
2.1
16
100
0
66
30
0
6
63
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6061484--6061524
21
2.0
21
100
0
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36
9
9
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1.71
6061783--6061837
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3
92
7
94
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0
0
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1.9
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0
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1.06
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2.1
19
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56
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2
40
1.13
6064578--6064620
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20
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58
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2.0
26
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2.0
414
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22
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2.1
50
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2.1
31
100
0
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20
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2.9
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16
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2.0
216
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0
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10
100
0
52
19
7
0
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1.07
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2.1
42
97
0
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22
11
18
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2.2
15
89
10
50
21
6
0
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1.05
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2.0
21
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4
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0
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1.20
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2.6
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13
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40
2
6
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1.41
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120
2.0
120
97
0
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20
22
22
1.97
6134968--6135026
30
2.0
30
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6
75
49
3
13
33
1.59
6135760--6135800
19
2.0
21
86
9
59
70
2
24
2
1.11
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20
1.9
20
88
0
58
60
0
0
39
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6157578--6158535
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479
99
0
1909
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10
8
40
1.71
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2.0
25
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46
24
0
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2.0
395
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1
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15
17
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2.3
13
100
0
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6
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2.6
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10
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4
12
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1.58
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20
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4
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0
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2.2
43
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20
4
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1.71
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43
2.0
44
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2
167
29
20
5
43
1.75
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144
2.0
144
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1
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18
27
1.97
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32
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1.00
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6232920--6233111
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2.3
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2
280
23
17
25
34
1.96
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44
2.3
44
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0
170
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18
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2
99
0
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0
0
49
1.03
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13.7
3
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10
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69
0
0
30
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14
3.4
14
85
11
69
70
2
0
27
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6234080--6234118
17
2.3
17
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69
0
0
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3
100
0
50
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36
0
32
1.58
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2.0
20
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0
60
38
0
0
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0.96
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2.1
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98
0
283
40
10
14
34
1.80
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2.2
30
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13
82
37
3
7
51
1.46
6251596--6251898
106
2.8
106
83
1
374
33
17
17
32
1.93
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2.3
19
80
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54
34
0
0
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0.93
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24
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38
1.44
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15
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19
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33
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30
1.88
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15
2.9
18
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16
63
31
11
23
33
1.91
6265860--6265919
31
1.9
31
86
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3
45
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1.9
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0
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48
0
22
1.51
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16
3.1
16
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55
33
0
0
66
0.92
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44
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3
135
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15
1.92
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12
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12
50
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0
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60
1.18
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30
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54
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5
33
1.49
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0
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22
27
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12
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54
54
0
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0
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20.7
3
79
0
70
59
4
0
35
1.19
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17
2.6
17
74
0
52
43
4
6
45
1.51
6361468--6361666
9
23.8
9
73
16
178
46
23
0
29
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6361448--6361675
25
8.8
25
82
11
235
46
23
0
29
1.58
6361440--6361662
16
13.5
16
75
13
145
46
22
0
30
1.58
6361482--6361664
82
2.2
83
89
5
282
46
22
0
29
1.56
6365184--6365624
216
2.0
216
93
0
758
31
19
19
29
1.96
6373510--6373534
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
6376960--6377211
9
30.3
9
73
16
224
46
23
1
29
1.62
6377023--6377215
25
7.8
25
84
6
227
46
22
2
29
1.63
6376932--6377218
41
6.8
42
79
12
241
45
22
1
29
1.62
6376932--6377202
16
17.5
16
74
16
191
45
22
1
29
1.63
6385899--6386003
35
3.1
35
65
27
91
48
1
1
47
1.23
6386592--6386635
17
2.6
17
74
0
52
43
4
6
45
1.51
6388340--6388383
17
2.6
17
74
0
52
43
4
6
45
1.51
6406263--6406331
31
2.2
31
78
0
75
24
18
21
34
1.96
6411142--6411168
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
6420118--6420172
21
2.7
21
83
11
69
34
1
5
58
1.32
6424538--6424602
22
2.9
22
74
17
62
44
3
3
49
1.33
6424980--6425019
21
1.9
21
85
10
55
55
0
2
42
1.13
6427134--6427184
15
3.5
15
72
20
54
33
1
5
58
1.33
6427122--6427182
28
2.2
28
93
0
104
29
1
4
63
1.24
6445755--6445792
15
2.6
14
88
12
58
55
2
0
42
1.14
6447330--6447371
5
8.4
5
94
0
75
59
0
2
38
1.10
6447369--6447427
28
2.2
25
88
11
82
66
11
6
15
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6452547--6452588
21
2.0
21
85
0
57
45
11
4
38
1.62
6455786--6456164
131
2.9
131
95
0
670
25
21
20
31
1.98
6459870--6459910
15
2.5
17
88
7
59
43
4
7
43
1.53
6460745--6460801
2
29.0
2
92
3
98
49
0
1
49
1.11
6464500--6464554
1
55.0
1
88
0
65
1
0
7
90
0.51
6464499--6464551
27
1.9
28
92
3
90
1
0
9
88
0.58
6464500--6464561
31
2.0
30
90
3
97
3
0
9
87
0.66
6464503--6464588
38
2.3
38
83
0
100
5
3
10
80
1.00
6467514--6467697
100
1.8
99
82
3
235
33
15
15
35
1.89
6469407--6469466
30
1.9
32
86
6
88
43
6
8
41
1.61

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210