Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr8 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 70076365

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   

This is table  82  of  210  ( 25174 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28467767--28467880
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18
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1.96
28468830--28469640
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1016
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20
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0
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20
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0
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4.2
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144
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14
16
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28522780--28523058
140
2.0
141
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463
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13
17
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18
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18
2.3
19
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12
59
43
9
0
46
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10
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28
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19
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28
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2.1
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7.7
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100
0
92
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34
15
0
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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13
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127
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0
728
25
21
19
25
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28638355--28638553
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22
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17
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0
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185
0
16
0
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0.66
28639726--28639870
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19
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19
164
0
17
0
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0
17
0
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2.1
28
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0
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11
15
1.49
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2.2
14
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36
0
0
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11
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0
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16
23
24
1.95
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0
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0
25
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15
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10
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0
8
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1.29
28693956--28694261
157
1.9
156
80
5
348
36
13
11
38
1.80
28708360--28708403
19
2.2
20
92
4
72
27
11
11
50
1.72
28715901--28715942
22
2.0
22
86
13
61
64
2
11
21
1.38
28715908--28716156
116
2.1
116
100
0
498
60
3
6
29
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28716121--28716171
14
3.6
14
80
17
52
62
0
9
27
1.26
28716769--28716808
20
2.0
21
90
5
64
37
5
5
52
1.45
28717530--28718526
143
7.0
143
87
0
1404
26
22
20
29
1.98
28717758--28718286
44
11.3
45
63
17
137
26
21
21
30
1.98
28726133--28726190
30
1.9
30
89
0
89
41
3
24
31
1.71
28726894--28727082
46
4.4
45
82
14
238
34
14
22
28
1.93
28726858--28726997
36
3.8
36
72
10
131
37
12
20
28
1.90
28729200--28729232
16
2.0
17
94
5
59
42
15
0
42
1.46
28730942--28731328
73
5.3
73
99
0
765
40
1
2
55
1.23
28734505--28734542
15
2.6
15
95
4
69
28
0
34
36
1.58
28734675--28734729
14
4.0
14
73
20
53
18
0
45
36
1.49
28735558--28735628
35
2.0
36
97
2
135
23
11
8
56
1.62
28735832--28735869
3
12.7
3
89
10
60
31
0
2
65
1.06
28735963--28735996
2
17.0
2
93
0
59
50
2
0
47
1.16
28738293--28738323
9
3.4
9
90
0
53
25
12
22
38
1.90
28738377--28738413
9
4.1
9
86
13
58
45
10
10
32
1.74
28742069--28742156
42
2.1
42
80
4
97
25
12
26
36
1.91
28743419--28743492
37
2.0
37
97
0
139
33
5
9
51
1.57
28744632--28744689
25
2.4
24
77
5
62
15
31
17
36
1.91
28749844--28749882
16
2.6
14
84
8
51
56
7
0
35
1.28
28751183--28751214
3
10.7
3
100
0
64
34
0
0
65
0.93
28753512--28753573
31
2.0
31
100
0
124
25
19
6
48
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28757888--28757920
6
5.7
6
96
3
59
54
0
33
12
1.37
28759094--28759129
9
3.9
9
96
3
63
33
0
8
58
1.28
28759094--28759129
19
1.9
18
94
5
63
33
0
8
58
1.28
28759202--28759239
19
1.9
20
89
10
60
18
2
7
71
1.23
28759201--28759248
21
2.3
21
79
13
55
22
2
6
68
1.23
28760324--28760373
23
2.1
24
85
3
66
74
18
0
8
1.06
28761182--28761272
45
2.0
45
85
2
121
27
6
28
37
1.82
28767895--28767934
19
2.0
20
85
4
55
40
0
2
57
1.12
28770892--28770934
3
14.7
3
80
4
52
30
4
2
62
1.28
28770835--28770934
9
10.9
9
71
15
53
32
7
3
58
1.40

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210