Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019168048.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_3, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  33276047

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  7  of  190  ( 22769 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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G
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2
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1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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0
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29
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58
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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0
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0
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1.03
739160--739224
16
4.5
15
72
18
57
66
1
0
32
1.01
746455--746514
25
2.3
25
82
8
66
56
0
0
43
0.99
747066--747100
2
17.5
2
93
0
61
0
54
0
45
0.99
747726--747757
3
10.7
3
93
0
55
28
0
3
68
1.04
751439--751503
32
2.0
32
93
0
112
23
10
24
41
1.86
751807--751876
28
2.5
28
85
0
95
45
30
2
21
1.66
755534--755620
43
2.0
43
97
0
165
40
10
20
28
1.85
757491--757517
2
13.5
2
100
0
54
0
51
0
48
1.00
764438--764462
5
5.0
5
100
0
50
40
0
0
60
0.97
771868--771911
13
3.3
13
78
6
52
47
0
22
29
1.51
780480--780545
27
2.4
27
97
0
123
54
7
18
19
1.67
781346--781370
1
25.0
1
100
0
50
0
100
0
0
0.00
784797--784832
11
3.3
11
88
0
54
41
0
2
55
1.14
800849--801001
76
2.0
76
90
0
243
40
17
15
26
1.89
800983--801293
161
1.9
161
88
1
471
33
20
13
32
1.92
803651--803697
18
2.4
21
82
13
64
65
4
0
29
1.11
804131--804173
20
2.2
20
86
0
59
48
0
4
46
1.22
805798--805824
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
806244--806275
2
17.0
2
87
12
50
50
0
0
50
1.00
806244--806275
15
2.1
15
94
0
55
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
806619--806654
6
6.0
6
93
0
63
63
0
0
36
0.94
809870--809913
2
22.0
2
95
0
79
52
0
0
47
1.00
810258--810307
5
10.0
5
100
0
100
40
0
0
60
0.97
814288--814601
141
2.3
136
83
10
376
31
9
8
50
1.65
816130--816484
164
2.2
163
88
4
518
40
13
7
38
1.74
816606--816660
26
2.1
27
86
6
78
43
9
5
41
1.59
816728--816779
14
3.6
14
84
7
61
75
5
0
19
1.01
817025--817059
11
3.2
11
87
0
52
0
31
0
68
0.90
817871--818053
41
4.4
41
82
7
192
46
18
11
24
1.81
817995--818107
58
1.9
58
85
3
156
45
21
11
22
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190