Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: NW_019168048.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_3, whole genome shotgun sequence Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 33276047

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   

This is table  2  of  190  ( 22769 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
105773--105840
34
2.0
34
97
0
127
45
0
14
39
1.45
107740--107804
34
1.9
34
96
0
121
44
4
9
41
1.57
107750--107811
18
3.6
18
68
16
58
43
6
8
41
1.60
107559--107982
215
2.0
215
83
3
541
41
8
8
41
1.67
107774--108519
181
4.1
177
78
6
610
39
9
10
40
1.72
109967--110338
181
2.1
180
84
2
485
39
8
9
41
1.69
110483--111163
169
3.9
172
75
12
527
39
7
10
42
1.67
110645--111242
181
3.3
178
80
6
625
38
8
9
43
1.68
111291--115329
181
22.2
182
71
13
1637
40
8
9
41
1.68
112135--112260
67
1.9
67
91
0
207
42
7
12
37
1.72
112280--112601
165
2.0
163
81
5
384
38
9
9
42
1.70
112440--115329
181
16.2
180
76
9
2074
40
8
9
41
1.68
112440--116876
362
12.5
359
72
12
2535
40
8
9
41
1.68
112440--116876
714
6.3
703
73
13
2389
40
8
9
41
1.68
115334--116870
181
8.6
179
75
7
1167
40
8
9
41
1.68
115334--116876
361
4.3
358
76
8
1312
40
8
9
41
1.68
115511--116837
712
1.9
708
81
5
1635
39
8
9
42
1.67
118856--118888
14
2.2
16
89
10
52
69
9
6
15
1.34
119088--119372
140
2.0
140
89
1
437
36
21
8
33
1.84
119341--119597
44
5.9
43
78
5
228
45
15
10
28
1.79
119348--119590
88
2.8
87
77
3
272
46
14
9
28
1.77
119857--119927
33
2.2
33
84
0
88
40
19
9
29
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120755--120848
27
3.3
27
64
21
66
36
17
7
39
1.77
120753--121048
60
5.0
58
88
4
394
33
14
8
43
1.75
121080--121144
11
5.9
11
75
23
57
75
0
9
15
1.04
121075--121143
17
4.2
17
77
7
70
76
1
7
14
1.06
121063--121143
12
6.7
11
72
16
54
76
1
6
16
1.05
121166--121198
4
8.0
4
93
6
57
75
0
0
24
0.80
121894--121942
15
3.5
14
84
10
57
73
4
4
18
1.15
121889--121964
22
3.4
24
79
12
74
67
6
6
19
1.36
122062--122165
6
17.3
6
78
16
58
75
0
5
18
0.99
122078--122122
10
4.3
10
86
13
56
80
0
0
20
0.72
122078--122127
23
2.2
23
89
7
75
80
0
0
20
0.72
122061--122173
22
5.0
22
71
20
74
76
0
6
17
0.99
122090--122165
6
14.6
5
84
15
77
76
0
5
18
0.97
122355--122770
42
10.0
41
88
6
495
37
20
17
24
1.93
122355--122748
41
9.5
40
87
6
454
36
21
17
24
1.94
122355--122748
83
4.7
83
85
4
485
36
21
17
24
1.94
124461--124519
8
6.8
8
87
11
64
11
8
0
79
0.93
124461--124520
29
2.1
27
90
6
93
11
8
0
80
0.92
124461--124511
8
5.4
10
90
9
65
9
9
0
80
0.91
124477--124511
11
3.3
11
92
8
63
8
8
0
82
0.83
124461--124523
27
2.3
28
84
12
87
12
9
0
77
0.98
124461--124549
38
2.4
36
83
7
97
11
12
0
76
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
124461--124549
29
3.1
28
80
13
85
11
12
0
76
1.02
129083--129232
58
2.5
60
91
3
241
36
16
7
40
1.76
129682--129722
20
2.1
19
86
4
55
17
17
21
43
1.87
130167--130215
21
2.2
24
85
10
68
63
8
8
20
1.48
130270--130420
6
24.8
6
76
17
84
70
1
2
25
1.07
130268--130450
12
15.2
12
75
17
123
71
1
3
23
1.09
130268--130449
18
10.4
17
74
19
112
71
1
3
23
1.09
130338--130450
46
2.4
46
88
4
156
76
0
3
19
0.92
130339--130450
6
19.3
6
82
7
124
77
0
3
18
0.91
130533--130704
79
2.2
79
91
0
272
36
22
6
34
1.81
131298--131337
17
2.4
17
82
0
53
10
15
0
75
1.05
131290--131397
25
4.5
25
76
10
82
12
12
0
74
1.08
131309--131365
18
3.2
18
83
14
73
8
10
0
80
0.90
131333--131389
22
2.6
22
81
10
64
10
14
0
75
1.05
131277--131390
8
14.2
8
69
18
60
11
15
0
72
1.11
135622--135724
51
2.0
51
84
3
136
25
16
5
52
1.66
137115--137149
13
2.5
14
90
9
54
68
8
5
17
1.35
137197--137233
12
3.2
11
88
11
56
78
0
0
21
0.75
137392--140060
180
14.9
181
76
8
1922
40
8
9
41
1.68
137410--143762
718
9.0
711
73
11
3123
40
8
9
41
1.68
139898--140184
157
1.8
158
81
5
357
40
5
11
42
1.64
139898--140217
157
2.0
158
79
4
342
39
6
11
42
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
140056--141762
180
9.5
177
74
8
1059
40
8
10
41
1.69
140116--141757
359
4.6
354
74
10
827
40
8
10
41
1.69
141821--142458
331
1.9
331
81
3
769
42
7
9
39
1.67
142141--143697
181
8.7
181
75
7
1164
40
8
9
41
1.68
142988--143682
179
3.9
181
75
7
459
38
8
9
43
1.69
142142--143423
537
2.4
529
80
6
1346
40
7
9
42
1.66
142142--143499
530
2.5
529
79
6
1410
40
7
9
41
1.66
143700--143832
70
1.9
71
90
4
216
36
5
9
49
1.57
144981--145457
180
2.6
180
80
7
493
43
10
8
37
1.70
145526--145938
181
2.3
179
78
6
399
42
8
7
40
1.64
145898--146035
67
2.1
67
92
0
231
36
10
7
44
1.69
145984--147448
181
8.2
180
74
8
1048
40
10
8
40
1.70
145585--146362
424
1.8
426
81
4
973
41
9
8
40
1.68
146458--146496
18
2.1
18
85
4
51
46
10
7
35
1.67
146015--147044
361
2.9
358
79
7
969
41
10
7
40
1.68
147475--153746
180
35.4
177
73
9
3413
40
10
8
39
1.70
147475--150756
181
18.4
179
75
8
2146
40
10
8
40
1.69
150614--150900
160
1.8
158
81
8
359
43
8
7
40
1.64
150771--159687
539
16.8
539
70
13
2269
41
10
8
39
1.69
152590--155734
182
17.9
178
68
15
567
42
9
8
39
1.68
153819--155752
181
10.9
179
75
7
1311
43
9
7
39
1.66
153919--154702
361
2.2
357
79
6
802
43
9
7
39
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
155855--159687
181
21.3
180
76
5
2851
41
9
7
40
1.67
158270--158318
18
2.8
18
78
12
57
38
14
6
40
1.71
155855--158773
361
8.1
360
73
9
812
42
9
7
40
1.67
159632--159752
64
1.9
64
82
3
154
54
0
4
39
1.28
159957--159989
18
1.9
17
88
11
50
33
6
6
54
1.50
159697--160222
179
2.9
176
79
9
498
41
10
6
41
1.65
159307--160110
423
1.9
424
83
4
1059
43
8
6
41
1.62
159697--160201
180
2.8
176
78
9
479
42
9
6
41
1.64
160238--160789
181
3.1
180
81
3
610
42
9
7
41
1.64
160451--161093
326
2.0
325
83
3
828
41
8
8
41
1.65
160800--161622
179
4.6
180
77
7
660
41
8
8
40
1.66
163335--163537
43
4.7
43
81
1
219
42
17
13
27
1.86
163335--163538
87
2.4
86
81
3
232
42
17
13
26
1.86
163926--163979
17
3.1
17
72
2
54
31
16
18
33
1.93
164123--164164
17
2.5
17
88
0
57
42
7
14
35
1.73
164123--164215
34
2.7
34
76
12
93
39
8
17
34
1.80
164384--164444
24
2.7
23
70
14
54
40
14
8
36
1.76
164384--164585
46
4.6
46
67
16
122
39
15
8
36
1.79
165907--165954
14
3.2
14
82
8
51
6
12
0
81
0.87
168341--168381
16
2.6
16
100
0
82
48
7
19
24
1.74
170730--171416
182
3.8
178
78
8
656
41
9
7
41
1.65
170794--171468
359
1.9
362
80
3
795
42
9
8
40
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
172949--173962
180
5.6
180
82
3
1076
41
8
9
41
1.67
174022--174941
182
5.1
181
75
5
547
40
9
10
39
1.72
175040--178671
181
20.5
179
72
12
1645
40
8
9
41
1.67
175527--175943
182
2.3
180
80
5
446
40
6
9
44
1.62
175813--176103
160
1.8
160
82
3
379
39
7
12
40
1.70
176591--176623
16
2.1
16
88
5
50
24
0
0
75
0.80
176338--176650
174
1.8
173
82
7
411
39
8
8
43
1.66
177480--177777
163
1.8
163
89
1
472
39
6
10
43
1.64
178128--178160
17
2.0
17
88
5
50
51
0
9
39
1.34
177651--178671
363
2.8
356
80
6
1085
39
8
8
42
1.66

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190