Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_D11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  68311261

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   

This is table  198  of  226  ( 27070 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
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17
11
46
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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100
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2.0
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3
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0
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36
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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82
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60
0
37
2
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59663326--59663751
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20
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1.9
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42
1.80
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1.33
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10
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52
1
5
40
1.35
59717429--59717459
16
2.0
16
93
6
55
35
0
0
64
0.94
59739560--59739607
13
3.8
13
79
15
57
37
0
10
52
1.36
59740476--59740531
23
2.4
23
91
5
87
28
5
3
62
1.34
59743810--59743864
22
2.5
23
77
14
62
60
0
5
34
1.20
59744351--59744387
9
4.1
9
92
0
65
29
10
13
45
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59744441--59744471
9
3.4
9
90
0
53
38
22
12
25
1.90
59756288--59756325
5
7.6
5
96
0
67
39
2
0
57
1.12
59757295--59757340
23
2.0
23
100
0
92
26
13
21
39
1.90
59760504--59760537
10
3.4
10
87
0
50
20
2
23
52
1.60
59767612--59767645
3
11.3
3
93
0
59
70
0
29
0
0.87
59775402--59775446
24
2.0
24
82
8
58
15
8
0
75
1.03
59777088--59777122
14
2.3
16
85
14
56
34
2
17
45
1.63
59777351--59777388
18
2.2
17
86
9
51
44
15
7
31
1.75
59778011--59778065
21
2.6
21
82
0
65
41
3
27
27
1.72
59783780--59783833
26
2.1
26
96
0
99
40
20
18
20
1.91
59784809--59784846
7
5.6
7
84
6
51
68
0
0
31
0.90
59790444--59790624
86
2.1
86
98
1
355
40
4
7
47
1.52
59790691--59790793
51
2.0
50
94
5
181
45
18
7
28
1.77
59790739--59790849
33
3.4
34
82
10
115
43
17
8
31
1.78
59793964--59793998
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
59793873--59794256
120
3.2
120
95
2
716
44
2
5
47
1.40
59794205--59794239
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
59794403--59794493
45
2.0
45
85
2
121
37
28
6
27
1.82
59794474--59794542
16
4.2
16
92
3
120
36
37
1
24
1.65
59794474--59794542
33
2.1
32
94
2
120
36
37
1
24
1.65
59796216--59796262
24
2.0
23
84
12
60
57
14
14
12
1.66
59796617--59796676
21
2.9
21
76
0
66
5
43
16
35
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59796617--59796688
21
3.4
21
77
7
65
6
40
16
36
1.76
59796653--59796840
87
2.2
87
92
0
304
12
28
18
40
1.87
59798571--59798729
41
3.9
40
78
8
151
33
28
18
19
1.96
59798664--59798743
41
2.0
41
82
0
97
31
30
18
20
1.96
59798571--59798729
82
1.9
82
83
5
205
33
28
18
19
1.96
59798983--59799057
37
2.0
37
94
0
132
38
4
30
26
1.75
59804329--59804368
21
1.9
21
89
0
62
25
12
30
32
1.92
59808677--59808770
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3.6
26
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16
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28
1.50
59809592--59809622
15
2.1
15
94
5
55
77
0
12
9
0.99
59829237--59829282
14
3.4
14
77
22
53
76
0
0
23
0.79

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226