Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_D11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  68311261

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   

This is table  64  of  226  ( 27070 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20724338--20724382
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12
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133
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14
9
52
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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9
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1.58
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2.3
26
88
0
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40
11
15
33
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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2.0
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18
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1.67
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1.61
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5.4
23
70
21
100
44
25
0
28
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20971740--20971822
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2
26
1.66
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1.20
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0
0
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0
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0
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22
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22
63
65
2
1
31
1.13
20980023--20980070
15
3.0
15
76
23
53
66
0
0
33
0.92
20980274--20980335
30
2.1
29
82
11
72
58
0
0
41
0.98
20980469--20980546
29
2.7
29
76
13
79
35
1
2
60
1.19
20980473--20980628
53
2.9
51
80
15
190
33
1
3
61
1.23
20980563--20980604
23
1.9
22
85
9
59
30
0
0
69
0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20981732--20981836
53
2.0
53
88
0
156
28
9
14
47
1.75
20986451--20986480
3
10.0
3
100
0
60
66
0
0
33
0.92
20992867--20992905
21
1.9
19
85
10
51
61
10
10
17
1.55
20994354--20994412
19
3.1
19
80
4
66
54
0
0
45
0.99
20994365--20994389
12
2.1
12
100
0
50
52
0
0
48
1.00
20994873--20994898
11
2.4
11
100
0
52
38
7
0
53
1.30
20994866--20995006
41
3.4
40
87
7
203
33
3
0
62
1.17
20997413--20997450
20
1.9
20
88
0
58
50
13
7
28
1.69
20997399--20997465
34
1.9
35
87
3
100
47
13
7
31
1.70
21002477--21002526
23
2.2
23
81
0
55
40
12
16
32
1.84
21002484--21002527
23
1.9
23
90
0
70
36
13
18
31
1.90
21002999--21003047
24
2.0
24
88
7
73
30
0
4
65
1.11
21002984--21003054
34
2.2
32
82
14
83
32
0
4
63
1.14
21003000--21003046
16
2.9
16
79
17
53
27
0
4
68
1.08
21012598--21012648
21
2.4
21
96
0
93
25
7
37
29
1.84
21017816--21017852
16
2.2
17
90
4
58
40
2
51
5
1.39
21021133--21021293
42
3.8
42
84
10
186
36
2
0
61
1.09
21021147--21021294
53
2.8
51
81
9
129
36
2
0
60
1.11
21021200--21021256
30
1.9
30
82
7
71
35
1
0
63
1.05
21021189--21021293
12
9.9
11
72
19
80
39
1
0
59
1.09
21021189--21021268
23
3.7
22
67
17
60
37
2
0
60
1.11
21024129--21024180
26
2.0
25
85
3
68
63
7
5
23
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21026777--21026823
21
2.2
22
92
3
78
21
38
19
21
1.94
21030152--21030202
25
2.0
25
96
0
93
37
11
25
25
1.90
21034857--21034917
24
2.4
26
81
5
81
21
24
22
31
1.98
21056165--21056195
15
2.1
15
100
0
62
35
19
0
45
1.51
21058439--21058465
11
2.5
11
100
0
54
22
7
18
51
1.70
21059866--21060060
93
2.1
92
88
4
286
44
4
4
47
1.41
21060093--21060126
17
2.0
17
94
0
59
44
5
0
50
1.26
21060093--21060131
17
2.4
16
87
8
53
43
5
0
51
1.24
21060097--21060136
17
2.3
18
83
12
57
47
5
0
47
1.24
21060216--21060267
15
3.6
15
80
12
56
44
0
1
53
1.11

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226