Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_D11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  68311261

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   

This is table  39  of  226  ( 27070 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13476540--13476581
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0
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1.13
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2.9
15
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0
0
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1.00
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0
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260
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16
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0
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0
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0
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0
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2.0
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1.9
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1.32
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5.5
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239
23
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21
28
1.99
13503468--13503707
100
2.3
103
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20
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1.99
13515660--13515702
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18
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0
0
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26
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22
2.1
22
88
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40
2
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25
1.68
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1.9
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84
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25
1.64
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1.9
17
88
11
50
66
0
9
24
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13522076--13522131
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1.9
29
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1.54
13523607--13523672
29
2.2
29
83
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50
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1.74
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100
0
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0
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23
14
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1.93
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11
211
27
23
14
33
1.94
13532888--13532935
21
2.3
21
89
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27
4
6
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1.38
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62
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13536175--13536346
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1.9
90
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229
20
22
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19
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106
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3.8
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1.95
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5
0
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176
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20
24
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1.9
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92
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46
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0
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20
25
1.99
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19.3
3
100
0
116
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0
0
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0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.5
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19
30
1.98
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4.0
41
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20
28
1.99
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82
2.1
82
86
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235
23
27
20
28
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1.9
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0
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0
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1
13
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1.37
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21
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13
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17
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10
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60
1
20
17
1.42
13605661--13605863
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0
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1.37
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0
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18
1.40
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18
1.45
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82
62
0
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1.37
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52
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1.51
13606310--13606380
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56
52
0
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1.47
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24
1.29
13606419--13606474
21
2.6
22
85
2
69
64
1
7
26
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13606456--13606507
5
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5
85
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61
0
19
19
1.35
13606471--13606507
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3.4
11
89
10
58
56
0
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18
1.41
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19
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10
0
20
1.17
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57
14
3
24
1.53
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2.3
20
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58
19
2
6
71
1.18
13615102--13615518
208
2.0
208
100
0
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14
28
1.82
13617603--13617660
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2.1
28
100
0
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13
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1.9
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100
0
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1.56
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2.0
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55
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0
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0
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30
17
17
34
1.93
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45
0
0
54
0.99
13630342--13630509
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46
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120
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0
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1
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1.38
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23
90
0
70
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2
31
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13640148--13640193
11
4.1
11
81
15
58
63
2
2
32
1.19
13651298--13651397
48
2.1
48
96
0
182
41
11
19
29
1.85
13653484--13653546
30
2.1
30
90
0
99
57
12
3
26
1.51
13664779--13664816
20
1.9
20
88
0
58
50
2
2
44
1.30
13665278--13665353
40
1.9
40
83
0
98
34
22
3
39
1.73
13670835--13670885
26
1.9
27
84
11
70
45
3
3
47
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13671792--13671848
2
28.5
2
96
0
105
52
0
0
47
1.00
13673201--13673233
16
2.0
17
88
5
50
30
12
0
57
1.35
13673325--13673356
17
1.9
17
93
6
57
53
0
0
46
1.00
13673311--13673355
23
1.9
24
86
4
65
48
0
2
48
1.13
13674374--13674426
21
2.5
21
78
9
54
26
1
5
66
1.25
13676611--13676647
15
2.5
15
86
0
56
51
5
5
37
1.48
13676727--13676755
10
2.9
10
100
0
58
37
0
0
62
0.96
13678789--13678841
19
2.8
19
97
0
97
39
20
26
13
1.89
13679360--13679407
17
2.8
16
75
12
51
43
16
0
39
1.48
13685689--13685722
16
2.1
17
88
5
52
52
5
0
41
1.25
13687462--13687493
5
6.4
5
100
0
64
40
21
0
37
1.54
13695137--13695237
50
2.0
50
100
0
202
29
21
16
31
1.96
13695482--13695520
19
2.0
20
85
9
55
41
2
7
48
1.45
13696812--13696867
16
3.3
17
79
13
53
8
14
5
71
1.29
13696826--13696868
19
2.4
19
88
7
63
9
13
4
72
1.26
13697643--13697675
4
8.2
4
100
0
66
24
0
24
51
1.48
13702930--13703290
180
2.0
181
92
0
607
44
9
13
32
1.77
13707353--13707382
7
4.3
7
91
0
51
26
3
13
56
1.52
13712855--13712880
4
6.5
4
100
0
52
0
76
0
23
0.78
13730846--13730889
3
14.7
3
95
0
79
0
31
2
65
1.05
13734502--13734552
17
3.0
17
100
0
102
29
11
0
58
1.33
13740812--13740870
30
2.0
29
83
9
75
42
8
3
45
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13741607--13741641
3
11.7
3
100
0
70
0
34
0
65
0.93
13742862--13742978
40
2.9
40
92
0
189
34
16
29
20
1.94
13742926--13743517
112
5.3
112
94
0
979
25
19
29
26
1.98
13744025--13744050
12
2.2
12
100
0
52
38
7
34
19
1.80
13744436--13744636
84
2.4
83
91
4
330
32
19
17
29
1.95
13745620--13745659
11
3.7
11
90
3
64
35
10
27
27
1.89
13746831--13746882
21
2.5
21
77
0
59
30
19
48
1
1.60
13746844--13746901
21
2.8
21
81
0
62
34
18
43
3
1.68
13747225--13747514
42
6.9
42
85
1
195
28
21
20
29
1.98
13747227--13747552
126
2.6
125
86
1
357
27
21
20
29
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226