Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_D11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  68311261

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   

This is table  76  of  226  ( 27070 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24239674--24239720
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2.5
19
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10
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1
0
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1.08
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26
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1.34
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28
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24
17
28
28
1.98
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3.4
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1.96
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2.8
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150
27
25
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1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.7
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30
22
20
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630
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1.97
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21
23
23
1.98
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28
2.1
28
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29.4
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20
1
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1.9
22
85
4
59
44
4
20
30
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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19
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0
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2.2
16
100
0
72
38
36
0
25
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24393659--24393734
23
3.3
23
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21
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1.98
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20
27
24
1.99
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24
22
1.97
24396474--24396543
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2.8
25
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32
22
27
17
1.96
24396474--24396557
25
3.3
25
78
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89
32
22
27
17
1.97
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1.9
20
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15
53
53
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0
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1.39
24400984--24401061
25
3.1
25
80
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81
24
19
24
32
1.98
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13
2
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1.9
137
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22
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1.94
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2.2
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84
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13
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45
1.74
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17
2.8
17
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2
21
1.03
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16
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20
1.04
24425831--24426298
120
3.9
120
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1.41
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45
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28
6
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1.82
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16
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16
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120
36
37
1
24
1.65
24426517--24426585
33
2.1
32
94
2
120
36
37
1
24
1.65
24427926--24428232
89
3.5
88
87
4
431
36
23
9
30
1.87
24428296--24428341
18
2.4
20
79
20
62
54
0
2
43
1.12
24428564--24428632
29
2.4
29
87
4
95
31
7
2
57
1.40
24428590--24428630
19
2.2
18
86
4
55
29
4
2
63
1.28
24428608--24428697
19
4.8
20
75
13
59
31
3
0
65
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24428629--24428688
8
6.7
9
76
16
54
28
3
0
68
1.05
24428629--24428701
37
1.9
38
83
8
96
32
2
0
64
1.08
24429903--24429932
15
2.0
15
100
0
60
40
13
6
40
1.71
24430046--24430135
40
2.3
40
82
5
103
23
26
15
34
1.95
24432128--24432170
21
2.0
23
81
9
54
32
11
11
44
1.77
24434268--24434311
8
5.1
8
89
10
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38
0
0
61
0.96
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12
3.8
12
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12
53
24
0
4
71
1.03
24435891--24435954
26
2.5
24
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28
0
3
68
1.04
24452676--24452729
19
2.6
21
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17
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31
0
12
55
1.38
24468951--24468998
19
2.5
20
80
19
57
66
2
6
25
1.26
24469182--24469249
19
3.5
19
74
9
66
29
1
4
64
1.21
24469222--24469262
21
2.0
21
90
4
66
24
0
4
70
1.06
24469786--24469856
27
2.8
25
73
21
67
43
1
5
49
1.35
24477866--24477902
14
2.7
14
95
4
67
59
0
0
40
0.97
24478179--24478235
28
2.0
28
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18
66
49
7
5
38
1.53
24478308--24478351
18
2.4
18
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0
52
52
4
0
43
1.22
24487209--24487244
16
2.2
16
95
0
63
25
0
33
41
1.55
24487481--24487515
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
24487439--24487511
27
2.7
27
76
8
76
52
2
0
45
1.15
24487624--24487658
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
24487400--24487670
143
1.9
148
92
4
471
46
3
2
47
1.35
24487642--24487824
53
3.1
58
67
22
153
49
6
2
42
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24487614--24487898
119
2.4
119
94
2
484
50
4
2
43
1.35
24487726--24487778
16
3.4
17
73
21
53
56
0
0
43
0.99
24487652--24487838
60
3.1
59
66
13
157
49
6
2
41
1.42
24487714--24487897
59
3.1
58
66
12
149
52
3
2
41
1.29
24491604--24491660
30
1.9
30
82
13
73
54
3
1
40
1.28
24494515--24494587
25
2.9
25
82
8
78
20
19
20
39
1.92
24496580--24496615
16
2.2
16
100
0
72
25
0
36
38
1.56
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2.0
17
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54
0
0
45
0.99
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3.2
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64
14
198
47
3
3
46
1.34
24496745--24497054
157
2.0
157
94
0
539
44
2
4
48
1.37

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226