Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_D11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  68311261

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   

This is table  53  of  226  ( 27070 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17446755--17447156
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38
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26
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
(0-2)
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17515201--17515270
29
2.4
28
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60
2
2
34
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17517891--17517949
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20
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2.1
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17558411--17558463
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5.2
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67
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3
28
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0
4
35
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26
0
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1.09
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18
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92
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0
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68
1.11
17580854--17580903
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52
0
0
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17580846--17580903
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2.0
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1
0
48
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
(0-2)
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21
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1
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17581459--17581527
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120
24
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37
36
1.65
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2.0
45
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121
27
6
28
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1.82
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0
0
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5
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6
2
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2.0
30
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0
35
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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38
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17
1.92
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2.0
129
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18
26
1.97
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25
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25
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2.3
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7
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1
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1.76
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14
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64
0
1
33
1.01
17635130--17635193
28
2.3
29
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5
87
65
0
0
34
0.93
17635276--17635326
19
2.6
20
84
3
68
66
0
3
29
1.09
17653872--17653910
19
2.1
18
85
4
51
51
7
15
25
1.70
17659215--17659292
40
2.0
40
100
0
156
38
15
10
35
1.81
17667732--17667830
27
3.7
27
78
8
112
38
20
11
30
1.87
17669382--17669587
37
5.6
37
86
2
265
19
12
28
38
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17674222--17674335
41
2.8
41
90
1
174
24
28
21
25
1.99
17681870--17681983
41
2.8
41
90
1
174
24
28
21
25
1.99
17683925--17684164
120
2.0
120
97
0
453
23
18
15
42
1.89
17689465--17689541
22
3.4
22
67
19
68
36
25
2
35
1.70
17689452--17689546
46
2.1
46
100
0
190
41
23
2
33
1.66
17694035--17694111
22
3.4
22
67
19
68
36
25
2
35
1.70
17694022--17694116
46
2.1
46
100
0
190
41
23
2
33
1.66
17700878--17700972
29
3.3
29
95
4
167
36
13
0
49
1.43
17701497--17701557
19
3.3
18
76
4
59
42
8
0
49
1.32
17701505--17701557
18
2.9
18
75
11
54
41
9
0
49
1.35
17702044--17702108
25
2.5
27
72
22
66
60
3
0
36
1.13
17702642--17702670
2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
17702931--17702965
18
2.0
18
88
5
54
11
8
14
65
1.46
17706928--17706973
3
16.0
3
77
8
51
30
0
4
65
1.12
17707298--17707433
40
3.3
40
75
6
121
65
0
2
30
1.13
17707390--17707415
11
2.4
11
100
0
52
53
0
7
38
1.30
17707331--17707423
30
3.2
28
83
11
107
62
0
3
34
1.11
17712157--17712217
4
15.8
4
88
6
63
49
32
1
16
1.56
17721172--17721364
98
2.0
98
93
0
332
27
10
24
36
1.88
17726116--17726163
25
1.9
25
95
0
87
62
2
33
2
1.18
17731568--17731689
45
2.7
45
83
13
162
27
21
26
25
1.99
17731407--17731689
44
6.5
44
74
13
171
27
20
25
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17731393--17731923
217
2.5
212
83
7
617
27
21
23
27
1.99
17731750--17731902
40
3.7
41
73
7
148
26
23
22
26
2.00
17731701--17731906
84
2.5
84
91
1
306
28
21
22
27
1.99
17731442--17731906
44
10.8
43
70
11
287
27
21
23
27
1.99
17731701--17731932
84
2.8
83
84
5
238
28
22
21
27
1.99
17734018--17734210
98
2.0
98
93
0
332
28
10
24
36
1.89
17743909--17744094
46
4.0
46
89
2
266
30
25
10
33
1.89
17745309--17745345
17
2.2
17
90
0
56
51
18
2
27
1.60
17750285--17750470
46
4.0
46
90
0
291
30
25
8
35
1.86
17756295--17756388
45
2.1
45
91
0
152
30
23
19
26
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226