Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_D11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  68311261

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   

This is table  4  of  226  ( 27070 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1225903--1225944
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18
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1229486--1229510
12
2.1
12
100
0
50
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32
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1.84
1234395--1234435
18
2.3
18
86
0
55
29
17
34
19
1.94
1234403--1234465
18
3.5
18
76
8
56
26
14
41
17
1.88
1242435--1242479
23
2.0
22
82
4
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53
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6
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2
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2.0
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87
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1245120--1245191
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1.30
1265986--1266033
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12
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0
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0
35
1.23
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2.4
11
100
0
52
0
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2.0
21
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18
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2
0
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2.2
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28
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3.7
18
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17
64
60
13
0
26
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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52
1
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1.11
1301797--1301855
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19
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3
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18
2.5
19
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16
62
34
0
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1.15
1323401--1323479
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1326259--1326301
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19
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23
11
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1.25
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19
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52
32
0
6
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1.23
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0
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0
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31
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1348896--1348961
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2.2
30
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3
4
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1.33
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0
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2
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10
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1
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1.32
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21
2.1
21
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8
56
57
2
11
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1.45
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21
4.0
20
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9
29
1.36
1371131--1371408
91
3.1
89
82
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30
7
21
40
1.81
1376017--1376068
19
2.7
21
77
16
60
32
7
1
57
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4
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6
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2.2
12
100
0
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53
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2.0
122
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0
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25
17
27
1.98
1412884--1412950
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2.3
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2
109
41
11
0
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0
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0
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1.30
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2.9
27
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22
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16
1.96
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27
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0
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16
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0
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6
6
1.24
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2
10
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22
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14
82
10
59
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0
1
33
1.05
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1.9
25
84
12
64
67
14
4
14
1.37
1439417--1439461
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60
0
0
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0.97
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2.5
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22
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20
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3.3
24
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22
36
12
1.91
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1.93
1461151--1461336
72
2.6
72
83
0
255
27
23
34
13
1.93
1473241--1473305
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72
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15
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1
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1.05
1475425--1475547
62
2.0
62
96
0
228
42
21
5
30
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1476836--1476936
12
8.8
12
70
26
51
77
5
12
3
1.10
1476858--1476900
18
2.4
18
76
0
50
76
6
13
2
1.08
1476829--1476908
10
8.6
9
72
10
54
78
7
11
2
1.04
1476903--1476936
14
2.4
14
90
0
50
82
0
11
5
0.83
1476851--1476936
34
2.4
34
83
13
93
77
4
12
4
1.07
1476884--1476925
21
2.0
21
90
0
66
83
2
7
7
0.89
1477355--1477400
15
2.9
15
90
6
65
86
4
8
0
0.68
1477736--1477930
107
1.8
108
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277
26
17
9
46
1.78
1478415--1478529
44
2.6
44
90
0
167
26
15
25
32
1.96
1478538--1479081
132
4.1
134
93
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895
27
19
24
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1.99
1478657--1479013
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7.9
46
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13
170
26
19
25
28
1.99
1478576--1479101
268
2.0
262
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4
795
27
20
23
27
1.99
1479086--1479652
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82
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0
902
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25
20
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1.97
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10
2.7
10
100
0
54
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0
0
22
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5
1
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2.4
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14
85
16
5
1
76
1.04
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56
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1
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9
0
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17
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56
52
0
2
44
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11
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11
95
0
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17
5
25
51
1.67
1498602--1498649
9
5.2
9
85
10
62
20
10
29
39
1.86
1498614--1498648
17
2.1
17
94
0
61
22
11
31
34
1.90
1500450--1500526
29
2.6
30
75
2
75
35
20
3
40
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1500861--1500927
11
6.5
11
76
10
61
79
0
20
0
0.74
1500872--1500933
16
3.8
17
79
10
67
80
0
19
0
0.71
1500867--1500936
12
5.6
11
78
21
68
82
0
17
0
0.66
1501086--1501146
24
2.5
25
86
5
88
29
40
24
4
1.76
1501236--1501261
9
2.9
9
100
0
52
80
0
19
0
0.71
1501700--1501739
17
2.3
18
86
4
55
40
12
7
40
1.71
1501670--1501766
41
2.4
38
81
10
95
38
10
8
43
1.69
1501720--1501762
22
2.0
22
95
0
77
39
11
6
41
1.68
1501743--1501842
35
2.7
36
80
14
98
32
9
9
50
1.65
1501817--1501873
21
2.8
20
75
17
62
35
12
8
43
1.73
1502647--1502686
3
13.3
3
100
0
80
32
0
0
67
0.91
1507797--1507860
29
2.2
28
78
13
67
32
7
4
54
1.50
1518348--1518389
18
2.3
19
87
4
59
57
4
0
38
1.20
1523207--1523343
69
2.0
69
98
0
265
50
6
8
34
1.59
1523819--1523867
3
16.3
3
95
0
89
34
34
0
30
1.58
1528094--1528204
58
1.9
56
80
10
127
40
2
0
55
1.20
1537311--1537373
32
2.0
32
100
0
126
36
9
12
41
1.76
1541624--1541663
16
2.5
16
84
8
55
42
0
2
55
1.13
1541650--1541700
26
2.0
26
96
0
93
60
1
0
37
1.08
1542309--1542343
14
2.3
16
90
9
56
40
0
0
60
0.97
1549540--1549566
14
1.9
14
100
0
54
62
0
0
37
0.95
1552847--1552904
27
2.3
25
80
16
66
43
1
3
51
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1553849--1553973
40
3.2
39
72
12
112
24
17
26
32
1.97
1555656--1555771
60
2.0
58
82
3
142
41
10
11
37
1.75
1558579--1558680
41
2.5
41
88
0
141
40
20
14
24
1.90
1563302--1563339
16
2.3
17
81
9
51
2
31
0
65
1.06
1569838--1569881
21
2.2
20
84
8
54
63
4
4
27
1.33
1570394--1570472
19
4.2
19
72
15
67
43
2
2
51
1.28
1576229--1576531
150
2.0
150
96
1
554
31
11
29
27
1.92
1582727--1582761
17
2.1
17
88
0
52
17
0
0
82
0.66
1583098--1583142
22
2.0
22
100
0
90
26
28
17
26
1.98
1586149--1586189
21
2.0
20
85
9
55
14
19
21
43
1.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226