Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_D11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  68311261

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   

This is table  33  of  226  ( 27070 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11467884--11468125
50
4.7
50
86
4
297
26
24
29
19
1.99
11467884--11468133
100
2.4
103
88
6
364
26
24
29
20
1.99
11470943--11471191
50
4.8
50
85
4
284
20
29
24
26
1.99
11470942--11471191
100
2.4
104
88
6
357
20
29
24
26
1.99
11471286--11471317
13
2.5
13
94
0
55
56
12
0
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1.37
11479570--11479644
15
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15
84
15
115
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6
12
46
1.67
11479557--11479622
25
2.6
25
97
0
123
33
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13
45
1.72
11498376--11498479
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100
0
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35
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11503705--11503737
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52
12
0
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15
1.12
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3
93
0
57
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3
0
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100
0
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39
0
0
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6
100
0
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32
0
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403
2.0
403
97
0
1528
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17
25
34
1.95
11525573--11525694
42
2.9
42
76
7
129
28
22
18
29
1.98
11525731--11525825
32
3.1
30
79
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109
46
14
7
31
1.72
11529634--11529707
9
7.9
9
74
14
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32
4
2
60
1.29
11529805--11529882
34
2.3
35
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10
99
37
1
1
60
1.13
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50
5.7
50
81
3
273
24
26
21
27
1.99
11535867--11536117
50
4.9
50
82
5
281
23
28
20
27
1.99
11541295--11541361
26
2.6
25
77
13
73
16
20
25
37
1.93
11541344--11541391
23
2.1
23
84
0
60
16
31
22
29
1.96
11541325--11541467
73
1.9
74
81
6
175
19
22
22
35
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11541724--11541772
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16
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18
50
44
0
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1.48
11542648--11542698
5
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5
79
12
57
37
0
1
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1.08
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25
2.6
25
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33
26
22
17
1.96
11548365--11548432
25
2.8
24
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12
59
38
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22
20
1.94
11551822--11551948
50
2.5
51
82
3
141
23
18
26
30
1.98
11558037--11558121
42
2.0
42
100
0
170
49
22
16
11
1.78
11562784--11562829
20
2.2
21
88
3
67
69
6
4
19
1.28
11562874--11562979
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77
18
90
62
1
0
35
1.06
11562889--11563057
10
17.6
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70
16
108
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1
31
1.21
11562883--11563058
40
4.5
38
74
18
132
61
3
1
32
1.21
11562826--11563057
9
24.6
9
67
19
109
60
3
1
33
1.25
11563451--11563502
9
5.6
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50
28
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1
67
1.12
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2.8
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9
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24
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0
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0.98
11563487--11563524
11
3.5
11
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51
18
5
0
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0.97
11566737--11566777
21
2.0
21
100
0
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31
24
4
39
1.76
11567980--11568025
24
1.9
24
100
0
92
50
4
8
36
1.53
11569016--11569079
8
6.9
9
80
13
60
67
4
0
28
1.11
11569032--11569075
11
4.2
11
82
11
65
70
2
0
27
0.99
11569022--11569067
22
2.2
22
84
7
60
71
6
0
21
1.08
11569032--11569075
10
4.3
10
86
13
63
70
2
0
27
0.99
11569033--11569087
20
2.8
20
70
22
53
67
1
0
30
1.01
11569189--11569243
13
4.6
11
76
14
56
27
3
3
65
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11574749--11574812
31
2.1
31
100
0
128
45
15
14
25
1.83
11578652--11578690
18
2.2
18
90
0
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35
12
7
43
1.72
11589276--11589326
21
2.4
21
80
0
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17
17
25
39
1.92
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9
10.4
9
89
0
125
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24
8
24
1.82
11589735--11589828
27
3.5
27
91
0
152
42
24
8
24
1.82
11589936--11589978
18
2.4
18
88
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11
2
44
41
1.53
11596242--11596282
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2.5
16
88
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55
60
0
2
36
1.10
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3.0
20
74
18
61
57
0
3
38
1.15
11597927--11597964
17
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18
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26
15
0
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1.38
11604643--11604700
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2.2
26
96
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13
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43
1.86
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2.5
25
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27
9
20
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1.84
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19
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31
0
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50
1.65
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22
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44
0
2
52
1.18
11609217--11609422
110
1.9
106
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301
44
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3
50
1.27
11609415--11609466
26
2.0
26
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68
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1
50
1.31
11609588--11609693
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18
126
35
30
4
29
1.78
11609608--11609695
46
2.0
46
90
4
144
38
29
5
26
1.79
11609675--11609711
16
2.3
16
100
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21
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37
1.77
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0
0
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0.57
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0
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0.48
11629051--11629099
20
2.5
20
86
0
71
51
0
4
44
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11629110--11629196
33
2.7
32
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7
95
50
17
4
27
1.65
11640695--11640732
17
2.2
18
85
4
51
63
2
23
10
1.39
11640714--11640768
12
4.6
12
73
15
51
63
0
23
12
1.29
11648061--11648092
16
2.0
16
93
0
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12
21
0
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1.25
11655775--11655813
18
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17
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53
33
0
20
46
1.51
11655932--11655960
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3.6
8
100
0
58
24
13
27
34
1.93
11656047--11656119
23
3.2
23
92
0
128
23
21
24
30
1.99
11659831--11659860
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5.0
6
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0
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50
3
46
0
1.18
11666556--11666611
24
2.4
24
85
8
71
35
0
17
46
1.49
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2.0
28
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10
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16
10
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1.44
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2.0
35
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2
124
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30
1.74
11680674--11680740
33
2.0
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100
0
134
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0
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50
1.39
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39
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147
29
15
15
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11
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11
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0
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1.64
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18
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0
96
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28
1.97
11758330--11758360
11
2.8
11
95
0
53
29
3
48
19
1.64
11761398--11761429
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5.3
6
100
0
64
18
46
34
0
1.49
11761389--11761428
18
2.2
18
86
0
53
22
47
27
2
1.64
11761398--11761439
18
2.3
18
87
0
57
21
45
30
2
1.65
11762445--11762496
16
3.2
16
94
0
86
28
0
36
34
1.58
11762477--11762586
45
2.6
43
80
9
129
33
5
29
31
1.80
11762708--11762762
25
2.2
25
84
9
69
52
1
0
45
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11762903--11763116
88
2.4
88
83
9
279
46
4
3
45
1.38
11762937--11763076
44
3.2
43
67
16
115
47
2
2
47
1.29
11767089--11767169
40
2.0
40
100
0
162
37
17
12
33
1.87
11768774--11768832
26
2.3
27
82
11
70
69
3
6
20
1.26
11768850--11768909
28
2.1
28
84
6
77
48
0
6
45
1.29
11770116--11770146
9
3.4
9
90
0
53
25
12
22
38
1.90
11770202--11770244
9
4.8
9
97
0
68
44
16
11
27
1.82
11770296--11770353
30
1.9
31
89
6
93
18
41
3
36
1.68
11770457--11770516
30
2.0
31
86
3
86
20
40
0
40
1.52
11770889--11770959
18
3.9
17
70
14
52
39
2
0
57
1.13
11771679--11771728
12
4.1
12
78
2
55
16
22
2
60
1.46
11771679--11771727
18
2.7
18
87
3
62
16
22
2
59
1.47
11773081--11773249
77
2.2
77
96
2
311
27
19
12
40
1.88
11773663--11773788
54
2.3
54
79
2
137
25
25
26
22
2.00
11778860--11778975
61
2.0
60
86
8
166
50
5
3
41
1.42
11778860--11779042
61
2.9
58
77
17
163
49
5
4
40
1.46
11779017--11779060
18
2.6
17
78
7
54
45
0
4
50
1.22
11780745--11780778
4
8.5
4
93
0
59
23
2
0
73
0.97
11785230--11785284
11
5.2
11
75
14
53
45
0
1
52
1.11
11785230--11785284
22
2.6
21
83
11
60
45
0
1
52
1.11
11792252--11792298
18
2.6
18
86
0
58
27
8
25
38
1.85
11799196--11799242
22
2.1
22
100
0
94
34
17
14
34
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11820744--11820770
11
2.5
11
100
0
54
25
0
0
74
0.83
11825603--11825656
3
19.0
3
74
11
51
64
3
1
29
1.21
11828511--11828551
19
2.0
21
86
9
59
12
26
17
43
1.84
11829150--11829183
18
1.9
17
88
5
50
32
0
14
52
1.42
11829433--11829658
123
1.9
123
85
3
323
41
14
18
26
1.88
11831351--11831409
3
19.3
3
85
3
82
28
1
0
69
0.98
11831630--11831690
26
2.2
27
82
11
79
27
3
6
62
1.36
11831863--11831895
15
2.2
15
94
0
57
24
0
12
63
1.28
11832169--11832365
98
2.0
98
96
0
367
28
10
23
37
1.88
11833218--11833263
22
2.1
22
83
0
56
28
28
23
19
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226