Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_D11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  68311261

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   

This is table  97  of  226  ( 27070 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30269769--30269862
27
3.5
27
86
2
127
24
27
27
20
1.99
30269943--30269979
11
3.5
11
88
7
58
70
0
29
0
0.88
30270006--30270045
20
2.0
21
85
5
55
25
0
10
65
1.24
30270387--30270417
12
2.6
12
94
0
53
19
0
19
61
1.35
30276790--30276909
5
24.6
5
75
17
60
0
31
0
68
0.90
30276835--30276980
4
36.0
4
73
16
97
0
32
0
67
0.91
30276786--30276979
44
4.6
43
76
16
185
0
33
0
66
0.92
30276790--30276980
82
2.3
81
84
10
235
0
33
0
66
0.92
30276766--30276940
92
1.9
89
82
14
216
0
31
0
68
0.90
30276951--30276989
16
2.5
16
83
4
53
0
38
0
61
0.96
30277013--30277079
27
2.5
27
92
0
107
13
26
29
29
1.94
30277029--30277089
27
2.3
27
82
0
77
16
29
26
27
1.97
30277147--30277216
26
2.6
27
88
4
106
50
0
8
41
1.33
30279263--30279294
11
2.9
11
90
0
55
34
12
0
53
1.39
30282329--30282454
28
4.5
28
70
15
82
28
23
16
30
1.96
30292923--30292988
32
2.1
32
100
0
132
46
34
3
15
1.61
30294824--30294947
44
2.8
44
83
6
142
58
4
26
9
1.50
30300343--30300440
28
3.5
27
78
9
108
30
12
28
28
1.93
30301376--30301497
22
5.3
22
73
18
86
29
12
13
44
1.81
30301377--30301588
47
4.5
47
85
4
250
28
13
15
42
1.85
30301390--30301568
25
7.6
24
73
18
135
26
13
15
43
1.85
30302224--30302308
28
3.0
28
84
3
100
28
21
22
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30304965--30305132
27
6.2
27
84
3
214
45
20
18
16
1.86
30304965--30305132
54
3.1
54
87
1
239
45
20
18
16
1.86
30305522--30305604
28
3.0
28
85
3
114
25
21
24
28
1.99
30309461--30309548
30
3.0
28
80
9
95
26
26
13
34
1.93
30309458--30309551
10
9.4
10
70
19
54
25
24
12
37
1.91
30311918--30312048
12
10.9
12
70
12
54
67
2
18
12
1.33
30311929--30311975
11
4.3
11
78
8
51
72
2
14
10
1.21
30311940--30312044
6
17.2
6
70
6
50
70
2
17
9
1.26
30312030--30312078
18
2.7
18
78
12
64
63
0
18
18
1.32
30319301--30319326
13
2.0
13
100
0
52
38
15
15
30
1.88
30323982--30324109
43
3.0
43
68
21
104
29
28
17
25
1.97
30340589--30340765
27
6.6
27
83
5
214
27
14
28
29
1.95
30348533--30348709
27
6.6
27
84
2
212
27
14
28
29
1.95
30348533--30348709
54
3.3
55
85
4
234
27
14
28
29
1.95
30353070--30353121
27
1.9
27
84
0
68
26
23
23
26
2.00
30356739--30356790
26
2.0
26
100
0
104
46
15
11
26
1.80
30357133--30357178
24
2.0
24
84
16
62
54
17
10
17
1.70
30357211--30357277
27
2.5
27
85
0
80
28
23
19
28
1.98
30357383--30357438
27
2.1
27
86
6
78
33
28
16
21
1.95
30365025--30365265
44
5.2
45
69
15
152
27
19
19
34
1.96
30364986--30365280
142
2.1
142
92
0
491
26
18
19
34
1.95
30365187--30365289
44
2.3
44
83
3
127
25
25
20
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30390003--30390472
44
10.7
44
67
16
213
30
17
25
26
1.97
30389993--30390629
132
4.8
132
92
0
1015
30
17
24
26
1.97
30392316--30392508
72
2.7
72
76
15
166
35
7
3
53
1.47
30392471--30392508
12
3.2
12
82
14
51
39
2
2
55
1.28
30392636--30392700
18
3.7
18
73
6
53
36
10
3
49
1.53
30392637--30392675
16
2.4
16
91
0
60
35
7
2
53
1.43
30410904--30410928
13
1.9
13
100
0
50
32
8
24
36
1.84
30411996--30412048
26
2.0
26
92
0
88
18
20
33
26
1.96
30413452--30413506
23
2.4
23
93
0
92
5
16
29
49
1.68
30413452--30413553
23
4.3
24
74
6
75
11
15
25
47
1.80
30424548--30424579
16
2.0
16
100
0
64
56
0
6
37
1.25
30441226--30441259
3
11.3
3
100
0
68
67
0
0
32
0.91
30441948--30441989
20
2.2
19
86
4
57
52
9
2
35
1.47
30450721--30450797
30
2.6
30
75
10
77
35
10
11
42
1.76
30473362--30473440
37
2.1
37
88
4
115
25
30
18
25
1.98
30473558--30473734
48
3.7
48
96
3
313
29
30
9
30
1.88
30477781--30477872
35
2.5
37
82
8
107
36
14
18
30
1.90
30481568--30481630
28
2.3
27
81
10
74
57
1
1
39
1.18
30484308--30484352
11
4.1
11
80
11
56
17
31
4
46
1.68
30484295--30484349
22
2.5
22
87
3
74
20
27
3
49
1.65
30484294--30484368
33
2.2
33
77
13
82
21
29
2
46
1.65
30486248--30486287
7
5.9
7
85
14
57
47
0
0
52
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30486319--30486417
21
4.6
22
81
7
123
44
29
0
26
1.55
30486401--30486427
8
3.4
8
100
0
54
51
33
0
14
1.43
30486318--30486417
43
2.3
44
86
8
143
44
29
0
27
1.55
30486382--30486452
32
2.1
33
84
10
90
49
29
0
21
1.50
30486410--30486458
24
2.0
25
84
8
64
48
34
0
16
1.46
30489571--30490009
125
3.5
125
90
3
672
29
21
17
31
1.97
30490142--30490182
21
1.9
22
85
5
57
51
34
0
14
1.43
30493613--30493652
14
2.9
13
88
7
53
22
12
0
65
1.26
30495772--30495815
15
2.9
16
86
13
74
18
4
6
70
1.27
30497908--30497958
25
2.0
25
96
0
93
29
7
3
58
1.44
30499515--30499554
21
1.9
21
94
0
71
25
30
20
25
1.99
30504911--30505023
37
3.1
37
77
11
99
40
1
5
52
1.35
30509187--30509214
14
2.0
14
100
0
56
35
0
7
57
1.26
30511670--30511704
16
2.2
16
89
0
52
74
2
0
22
0.95
30512170--30512214
23
2.0
23
91
4
74
40
17
4
37
1.70
30512170--30512227
19
2.8
20
84
10
64
39
17
6
36
1.76
30512841--30513218
44
8.7
44
75
9
282
27
22
20
29
1.99
30512756--30513217
44
10.6
44
74
13
239
27
22
20
29
1.99
30512965--30513176
84
2.5
84
80
12
236
27
23
20
28
1.99
30512841--30513086
133
1.9
129
81
11
304
26
24
20
28
1.99
30512794--30513234
217
2.0
219
91
1
717
26
23
20
29
1.99
30513252--30513433
50
3.6
50
70
0
166
24
24
23
27
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30513226--30513448
100
2.2
100
93
0
374
24
22
21
30
1.99
30513409--30513488
40
2.0
40
97
0
151
22
18
20
38
1.93
30513309--30513588
140
2.0
140
92
1
463
23
21
21
33
1.97
30513450--30513620
50
3.4
49
64
6
128
23
21
22
32
1.98
30513449--30513658
100
2.1
99
88
3
314
23
21
22
31
1.98
30513226--30513673
240
1.9
240
90
0
727
23
22
22
31
1.98
30513752--30513846
50
1.9
50
86
0
136
24
25
22
28
1.99
30513751--30513858
50
2.2
50
81
0
126
25
24
21
29
1.99
30514011--30514483
44
10.7
44
88
2
657
30
25
16
26
1.97
30515723--30515753
9
3.4
9
100
0
62
9
0
9
80
0.90
30520676--30520722
23
2.0
23
84
8
60
72
4
6
17
1.22
30521529--30521586
22
2.6
22
81
7
64
44
17
1
36
1.59
30524246--30524351
15
7.1
15
67
11
74
45
6
22
25
1.76
30524242--30524351
30
3.7
30
96
0
193
46
6
22
24
1.75
30528942--30529017
15
5.1
15
67
10
57
46
6
22
25
1.76
30528938--30529017
30
2.7
30
94
0
133
47
6
22
23
1.74
30531462--30531493
15
2.1
15
94
0
55
15
6
9
68
1.36
30542013--30542056
22
2.0
21
83
12
54
40
0
0
59
0.98
30543546--30543578
17
2.0
16
94
5
57
60
0
0
39
0.97
30546434--30546614
62
2.9
63
78
14
203
40
3
3
51
1.36
30555803--30555841
17
2.4
16
87
8
60
15
2
0
82
0.79
30556992--30557050
29
2.0
29
86
0
82
35
6
11
45
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30572589--30572619
15
2.1
15
100
0
62
38
6
32
22
1.80
30576909--30576939
15
2.1
15
100
0
62
38
6
32
22
1.80
30578751--30578846
35
2.7
36
75
18
94
44
2
3
50
1.29
30578765--30578843
15
5.5
15
73
21
55
45
1
2
50
1.23
30579425--30579479
23
2.4
24
75
9
60
38
1
5
54
1.34
30583014--30583211
43
4.9
42
75
15
177
24
15
25
34
1.95
30583102--30583211
41
2.6
43
77
13
113
22
17
26
33
1.96
30584492--30584539
24
2.0
24
83
0
60
4
20
27
47
1.68
30588872--30589077
103
2.0
103
88
0
304
31
16
16
35
1.91
30594944--30594986
20
2.2
20
91
0
68
18
20
13
46
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226