Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167937.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_2, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  35885061

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          193   194   195   

This is table  136  of  195  ( 23297 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
28
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2
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5
5
32
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
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26
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186
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0
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5
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0
2
35
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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1.00
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18
80
9
82
8
12
1
77
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
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0
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15
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0
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39
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12
118
77
2
5
14
1.06
22978704--22978781
11
6.7
11
75
21
54
79
2
3
14
0.98
22978812--22978851
4
9.8
4
94
5
71
75
0
0
25
0.81
22979400--22979424
10
2.5
10
100
0
50
60
24
0
16
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22979930--22979973
11
3.8
12
82
11
56
72
4
0
22
1.02
22979907--22979981
25
3.1
25
81
7
75
68
5
5
21
1.30
22980127--22980160
16
2.2
15
89
5
50
5
0
2
91
0.51
22980188--22980548
42
8.6
42
89
4
518
36
22
16
24
1.94
22980204--22980548
83
4.1
83
92
1
539
36
22
16
24
1.94
22980188--22980548
125
2.9
125
91
2
557
36
22
16
24
1.94
22985758--22986207
59
7.7
57
86
5
578
35
14
7
43
1.72
22985753--22986206
176
2.6
174
86
7
609
35
14
7
42
1.73
22986235--22986319
6
16.4
5
79
13
61
76
2
4
16
1.06
22986257--22986378
4
29.0
4
71
23
58
72
4
2
21
1.14
22986226--22986373
44
3.3
44
77
10
115
72
4
3
19
1.17
22986257--22986378
17
7.2
17
71
21
64
72
4
2
21
1.14
22986238--22986319
11
6.8
11
73
20
58
76
2
4
15
1.06
22986237--22986334
50
2.0
50
84
11
130
74
2
5
18
1.10
22987320--22987365
21
2.1
22
84
4
58
69
4
4
21
1.24
22987448--22987491
11
3.8
12
82
11
56
72
4
0
22
1.02
22987425--22987499
25
3.1
25
81
7
75
68
5
5
21
1.30
22992039--22992073
3
11.7
3
100
0
70
0
0
31
68
0.90
22999354--22999399
21
2.1
21
84
4
56
60
28
0
10
1.30
23001726--23001780
25
2.2
25
86
0
83
56
7
10
25
1.59
23001877--23001920
18
2.4
18
81
11
54
20
15
0
63
1.31
23003242--23003287
12
3.7
12
80
11
56
4
17
2
76
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23003308--23003337
11
2.7
11
89
0
51
0
16
0
83
0.65
23006177--23006237
30
2.0
30
87
0
86
40
3
24
31
1.71
23006206--23006361
38
4.1
37
75
8
136
33
7
22
36
1.83
23006560--23006603
20
2.2
20
84
11
56
6
0
15
77
0.97
23007315--23007357
17
2.5
17
85
11
52
34
4
4
55
1.41
23007390--23007442
20
2.5
22
80
20
60
54
11
7
26
1.62
23007889--23007940
24
2.2
24
92
0
86
38
7
3
50
1.50
23008350--23008391
18
2.4
18
84
4
50
19
4
38
38
1.73
23008362--23008502
7
21.7
7
71
15
88
19
1
34
44
1.59
23008361--23008515
13
12.0
13
73
13
101
19
1
34
44
1.59

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195