Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167937.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_2, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  35885061

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          193   194   195   

This is table  164  of  195  ( 23297 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
5
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1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
129
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113
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3.6
17
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8
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1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
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(0-2)
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130
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19
13
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2.5
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5
1
73
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27328804--27328836
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17
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2.0
25
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145
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14
13
39
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34
1.39
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18
2.3
17
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51
10
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1.36
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24
2.4
24
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34
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106
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10
4
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1.53
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21
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21
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10
55
52
7
7
32
1.58
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129
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33
1.50
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32
1.49
27341985--27342053
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2.2
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31
1.45
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1.50
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2
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2
32
1.47
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2
33
1.45
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1.45
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20
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20
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2
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1.45
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2.5
12
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0
51
70
13
0
16
1.18
27346959--27347006
20
2.5
19
76
6
51
56
2
2
39
1.23
27347480--27347518
14
2.8
14
88
0
60
71
2
0
25
0.98
27348397--27348426
14
2.1
14
100
0
60
73
0
0
26
0.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27348462--27348494
12
2.8
12
95
0
57
69
3
9
18
1.28
27348460--27348498
6
6.5
6
81
0
51
66
2
10
20
1.33
27354766--27354796
8
3.9
8
95
0
53
83
0
3
12
0.75
27355629--27355693
27
2.4
28
84
7
80
40
4
1
53
1.31
27355696--27355737
15
2.6
16
81
7
50
52
0
0
47
1.00
27355713--27355760
21
2.3
21
82
10
62
60
0
0
39
0.97
27355713--27355760
11
4.6
10
77
10
51
60
0
0
39
0.97
27356018--27356061
22
2.0
22
95
0
79
22
15
18
43
1.88
27357981--27358086
51
2.1
52
85
1
142
30
16
16
35
1.92
27360241--27360503
60
4.4
63
83
8
225
34
11
7
45
1.70
27360389--27360429
17
2.4
18
80
12
50
43
0
4
51
1.23
27360281--27360524
60
4.1
61
86
4
282
33
11
8
46
1.70
27360591--27360629
17
2.3
17
86
0
51
79
2
5
12
1.00
27360539--27360642
11
9.2
11
75
14
63
75
2
4
16
1.09
27360579--27360642
32
2.0
30
82
14
76
76
3
4
15
1.08
27361213--27361237
10
2.5
10
100
0
50
60
24
0
16
1.36
27361675--27361735
11
5.5
11
75
14
54
77
1
3
18
0.99
27361658--27361735
30
2.6
31
79
16
85
76
1
3
17
1.00
27361672--27361799
33
4.0
32
72
17
86
75
3
5
16
1.12
27361664--27361737
26
2.8
26
80
10
78
78
1
2
17
0.94
27361718--27361763
24
1.9
24
86
8
67
78
4
2
15
1.01
27361667--27361766
36
2.8
36
80
10
105
77
3
3
17
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27361988--27362586
42
14.1
42
85
4
740
37
21
16
25
1.93
27361988--27362586
86
7.1
84
85
4
733
37
21
16
25
1.93
27362834--27362883
21
2.5
21
93
6
86
36
14
16
34
1.88
27363822--27363898
22
3.5
22
75
5
59
9
16
0
74
1.07
27364759--27364836
23
3.4
24
80
15
69
19
3
2
74
1.09
27364777--27364841
23
2.9
22
82
11
78
16
6
3
73
1.16
27367010--27367042
17
2.0
17
88
5
50
51
12
0
36
1.39
27367110--27367134
12
2.1
12
100
0
50
16
0
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76
1.02
27370283--27370328
11
4.2
11
94
0
74
86
0
10
2
0.64
27370293--27370361
8
8.9
8
85
9
63
81
0
13
5
0.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195