Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167937.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_2, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  35885061

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          193   194   195   

This is table  173  of  195  ( 23297 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
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Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
A
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165
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1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Indels
Score
A
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Entropy
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Period
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Score
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1.06
Indices
Period
Size
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Number
Consensus
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A
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(0-2)
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11
74
17
62
75
1
3
19
1.02
29060186--29060285
6
15.7
6
73
15
51
75
2
2
21
1.01
29060448--29060486
18
2.2
18
90
0
60
5
0
5
89
0.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29060571--29061135
42
13.4
42
89
4
831
36
22
16
23
1.94
29060576--29061135
83
6.7
82
89
4
859
36
22
17
23
1.94
29060569--29061135
211
2.7
211
94
0
990
37
22
16
23
1.94
29066333--29066525
56
3.4
56
86
13
243
35
10
8
45
1.69
29067556--29067628
29
2.4
30
84
9
94
53
1
10
34
1.45
29071618--29071654
18
2.1
18
90
5
58
83
2
5
8
0.88
29071618--29071696
20
4.0
19
76
12
70
81
1
3
13
0.90
29072827--29072892
12
5.4
12
74
3
60
62
13
1
22
1.40
29073539--29073604
27
2.5
27
97
2
125
33
16
10
39
1.83
29080621--29080664
24
2.0
22
83
16
56
43
4
6
45
1.51
29086545--29086585
19
2.1
20
86
4
57
14
0
63
21
1.30
29086560--29086651
38
2.4
40
87
5
127
14
2
61
21
1.43
29086886--29086923
20
2.0
20
89
5
60
34
0
5
60
1.19
29087149--29087197
25
1.9
26
91
4
82
46
2
10
40
1.49
29090590--29090638
6
8.2
6
76
0
53
24
2
42
30
1.66
29090590--29090636
18
2.6
18
80
6
60
25
2
42
29
1.67
29090983--29091107
18
6.9
18
72
13
105
32
36
4
27
1.78
29090987--29091029
21
2.0
21
95
0
77
25
44
2
27
1.66
29091007--29091108
33
3.0
33
84
5
141
34
33
4
27
1.78
29091488--29091515
6
4.7
6
100
0
56
46
0
0
53
1.00
29092897--29093004
54
2.0
54
90
0
171
33
7
36
23
1.83
29093763--29093792
16
1.9
15
93
6
51
53
0
0
46
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29093845--29093875
16
1.9
16
93
0
53
58
6
3
32
1.40
29095502--29095540
8
4.9
8
87
0
60
25
23
10
41
1.86
29102658--29102709
27
1.9
27
88
0
77
25
23
15
36
1.93
29108686--29110563
644
3.0
614
91
3
2898
28
13
20
37
1.91
29109889--29109955
30
2.2
30
100
0
134
46
11
20
20
1.82
29112503--29112556
8
6.8
8
84
0
72
25
18
12
42
1.86
29112503--29112571
16
4.3
16
81
0
66
26
18
13
42
1.87
29112503--29112571
24
2.9
24
95
0
120
26
18
13
42
1.87
29118808--29118833
13
2.0
13
100
0
52
30
30
7
30
1.85
29122380--29122421
2
21.0
2
100
0
84
50
0
50
0
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          193   194   195