Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167937.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_2, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  35885061

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  144  of  195  ( 23297 repeats found )

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Table Explanation

Indices
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Copy
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Percent
Indels
Score
A
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Period
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Copy
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Score
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1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
A
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23
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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13
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24418037--24418536
87
5.7
87
93
0
775
17
7
45
30
1.74
24418295--24418377
36
2.3
37
80
12
93
14
7
49
28
1.70
24418381--24418613
36
6.0
36
71
15
124
20
7
43
28
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24418468--24418613
39
3.9
39
84
7
160
22
7
43
26
1.80
24419828--24419868
19
2.2
19
86
8
57
58
19
9
12
1.61
24424763--24424829
9
7.3
9
82
11
75
82
0
7
10
0.85
24424762--24424843
17
4.5
18
72
18
71
79
0
10
9
0.94
24424781--24424849
10
7.1
10
80
16
67
79
0
10
10
0.93
24424763--24424849
19
4.6
19
77
12
90
79
0
10
10
0.94
24425333--24425371
19
2.1
19
90
0
60
56
2
25
15
1.52
24426355--24426771
40
10.3
40
81
7
362
26
11
18
44
1.83
24426322--24426771
80
5.5
79
81
7
458
26
10
18
43
1.83
24426355--24426771
120
3.4
120
85
4
520
26
11
18
44
1.83
24426885--24426918
17
1.9
17
94
5
59
88
8
2
0
0.62
24429489--24429532
23
1.9
23
90
0
70
22
13
15
47
1.81
24429660--24429696
10
3.6
10
92
3
56
86
0
13
0
0.57
24429698--24429727
3
10.0
3
100
0
60
66
0
0
33
0.92
24429881--24430207
44
7.2
43
78
12
275
40
17
13
28
1.87
24430024--24430253
48
4.8
48
82
5
241
42
18
11
28
1.84
24429942--24430253
96
3.4
97
80
9
260
40
17
12
28
1.86
24441954--24441980
11
2.5
11
100
0
54
55
0
0
44
0.99
24444586--24444643
26
2.1
28
84
6
75
51
1
1
44
1.21
24446027--24446058
6
5.3
6
92
0
55
15
50
0
34
1.45
24446183--24446219
2
18.5
2
94
0
65
45
0
2
51
1.15
24447815--24447848
11
2.9
12
86
8
52
23
2
8
64
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24447821--24447848
11
2.5
11
100
0
56
21
0
7
71
1.09
24450812--24450888
26
2.9
25
83
9
100
53
0
0
46
1.00
24450849--24450900
15
3.3
16
74
12
54
55
0
0
44
0.99
24450812--24450894
25
3.2
26
86
6
107
53
0
0
46
1.00
24450857--24450943
15
5.5
15
73
20
70
52
0
0
47
1.00
24450883--24450955
19
3.9
19
74
17
73
53
0
0
46
1.00
24450864--24450965
34
2.9
35
78
9
95
55
0
0
44
0.99
24450910--24450965
15
3.5
15
75
17
58
62
0
0
37
0.95
24450980--24451054
15
4.9
15
75
16
73
37
0
4
58
1.17
24450971--24451053
11
6.9
11
75
17
60
36
0
3
60
1.14

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195