Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  70731513

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   

This is table  3  of  222  ( 26535 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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100
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20
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1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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17
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0
0
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2
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0
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3
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2
4
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0
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3
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2.0
17
88
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52
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0
0
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2.1
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15
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2.2
29
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2.0
230
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0
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0
0
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3.0
236
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18
30
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.9
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0
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28
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0
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17
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2.3
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1039006--1039060
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29
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2
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2
2
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28
41
30
0
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1097615--1097693
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10
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2.1
16
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0
50
50
14
17
17
1.79
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20
2.5
19
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64
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0
0
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0
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10
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10
51
37
0
0
62
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2.1
20
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12
61
27
6
0
65
1.18
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2.3
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12
164
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3
1
62
1.23
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2.9
21
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0
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20
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1.74
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2.5
17
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13
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1.86
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2.2
24
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1.55
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22
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0
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1.32
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27
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0
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24
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21
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19
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27
3
0
68
1.06
1133670--1133710
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1137358--1137599
127
1.9
128
86
3
344
48
14
11
25
1.77
1148353--1148509
78
2.0
78
96
0
287
19
17
14
47
1.82
1150956--1151005
19
2.6
19
84
9
57
26
2
4
68
1.18
1151035--1151082
19
2.4
22
83
16
68
27
8
0
64
1.22
1151037--1151080
20
2.2
20
88
12
63
27
6
0
65
1.17
1151090--1151134
22
2.0
24
87
12
69
31
2
0
66
1.04
1151141--1151196
20
2.6
21
80
11
60
26
3
3
66
1.25
1153741--1153776
16
2.1
16
90
10
54
55
0
0
44
0.99
1154595--1154629
18
2.0
17
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5
61
42
0
0
57
0.99
1155790--1155843
12
4.5
12
92
0
90
53
12
7
25
1.65
1157210--1157271
31
1.9
32
87
6
90
20
24
24
30
1.99
1157385--1157529
43
3.4
43
79
7
127
20
19
24
36
1.95
1157502--1157624
43
2.9
43
88
2
149
29
29
19
21
1.98
1157517--1157722
43
4.7
42
82
10
229
30
30
18
20
1.97
1157558--1157723
89
1.9
89
85
7
230
30
28
18
21
1.97
1158029--1158140
21
5.3
21
84
0
125
3
42
17
35
1.67
1158117--1158258
66
2.2
66
85
5
189
14
26
19
40
1.89
1158151--1158281
66
2.0
66
86
3
183
15
23
19
41
1.89
1161610--1161670
27
2.2
29
79
5
72
62
1
1
34
1.15
1161752--1161903
8
17.6
9
67
21
69
29
3
0
65
1.15
1161739--1161778
17
2.4
17
87
4
55
32
2
0
65
1.06
1161741--1161856
18
6.4
18
72
19
73
32
3
0
62
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1161813--1161858
19
2.4
19
89
10
76
28
8
0
63
1.24
1163698--1163731
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
1168337--1168370
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
1169109--1169351
128
1.9
129
87
2
355
48
14
11
25
1.77
1177333--1177376
19
2.4
19
84
3
54
27
2
4
65
1.23
1177348--1177602
9
27.0
9
65
15
72
29
4
3
62
1.31
1177411--1177458
19
2.4
22
83
16
68
27
8
0
64
1.22
1177413--1177456
20
2.2
20
88
12
63
27
6
0
65
1.17
1177466--1177510
22
2.0
24
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12
69
31
2
0
66
1.04
1180115--1180150
16
2.1
16
90
10
54
55
0
0
44
0.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222