Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: D02 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 70731513

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   

This is table  60  of  222  ( 26535 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18076667--18077174
140
3.6
140
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1
606
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17
21
33
1.96
18080096--18080288
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14
176
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17
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21
16
17
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1.88
18080093--18080378
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3.9
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10
262
22
18
17
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1.89
18080283--18080396
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3.0
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126
26
14
14
44
1.83
18085243--18085297
9
5.9
9
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4
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21
34
3
40
1.71
18085243--18085289
10
4.9
10
92
2
62
23
34
2
40
1.67
18085253--18085297
10
4.8
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5
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2
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1.68
18085483--18085521
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5
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0
0
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3
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15
27
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18089275--18089455
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2.2
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238
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15
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1.96
18091048--18091250
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5.1
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10
207
25
23
27
23
2.00
18091047--18091231
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2.3
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9
220
24
23
27
24
2.00
18091099--18091264
79
2.1
79
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26
24
2.00
18099237--18099440
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5.1
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184
25
23
26
24
2.00
18099237--18099421
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2.3
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82
9
220
25
23
27
24
2.00
18117158--18117200
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2.2
20
100
0
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13
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15
2.1
15
94
0
55
50
12
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31
1.65
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2.0
45
81
0
104
45
11
19
23
1.83
18131859--18131930
30
2.3
31
76
9
76
77
2
4
15
1.03
18138880--18139004
43
2.9
43
92
0
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32
24
17
26
1.97
18139119--18139201
31
2.7
30
79
3
94
42
18
9
30
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18145806--18145840
17
2.1
17
100
0
70
34
22
17
25
1.96
18148464--18148498
19
1.9
17
88
11
52
40
2
5
51
1.40
18150438--18150486
24
2.0
24
84
7
64
42
2
6
48
1.39
18150454--18150494
20
2.1
19
86
4
55
41
0
9
48
1.36
18154830--18154897
35
1.9
35
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5
84
27
30
13
27
1.94
18156132--18156179
25
1.9
25
86
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4
25
33
1.75
18157236--18157445
102
2.1
102
95
0
375
35
23
5
36
1.77
18160946--18161009
30
2.1
30
100
0
128
28
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31
34
1.82
18163014--18163095
30
2.7
30
100
0
164
28
6
14
51
1.66
18167004--18167072
25
2.8
25
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77
30
23
23
23
1.99
18168273--18168385
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1.9
60
94
3
201
21
21
34
23
1.97
18170826--18170870
20
2.2
20
88
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65
22
24
26
26
2.00
18177040--18177097
22
2.6
22
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0
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15
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18
1.91
18177022--18177104
22
3.8
22
80
0
76
38
16
27
16
1.91
18186349--18186390
21
2.0
22
90
4
68
26
4
9
59
1.48
18194137--18194224
30
2.9
30
83
3
106
23
30
28
17
1.97
18201956--18202005
19
3.0
17
78
18
52
78
2
16
4
1.00
18221141--18221187
24
1.9
25
86
4
69
44
0
2
53
1.12
18221757--18221809
9
5.9
9
82
6
63
73
3
15
7
1.20
18221757--18221809
18
2.9
18
88
0
79
73
3
15
7
1.20
18223069--18223115
22
2.0
23
84
8
60
0
12
25
61
1.31
18233564--18233597
17
2.0
17
88
0
50
55
2
14
26
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18238548--18238576
13
2.1
14
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6
51
10
6
13
68
1.37
18245539--18245901
47
7.6
47
93
1
564
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9
30
28
1.88
18246020--18246098
37
2.1
37
86
4
106
26
18
29
25
1.98
18247975--18248048
29
2.6
29
82
4
87
27
14
31
27
1.95
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4.6
40
83
8
203
24
22
27
25
2.00
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1
403
31
9
30
27
1.89
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2.1
37
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115
25
18
30
25
1.98
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15
9
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2.7
13
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10
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28
21
28
22
1.99
18268531--18268718
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1.8
103
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2
297
26
20
30
22
1.98
18272620--18272674
24
2.3
24
96
0
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300
24
28
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24
1.99
18286975--18287203
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322
24
28
22
24
1.99
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276
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31
27
1.89
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17
224
31
18
22
27
1.97
18313194--18313298
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1.9
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135
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18
22
28
1.97
18313170--18313525
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2.5
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17
21
28
1.96
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2.1
26
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18
20
38
1.93
18321350--18321757
54
7.6
54
82
2
392
44
17
13
25
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18321357--18321716
27
13.3
27
82
0
342
44
17
13
24
1.85
18321357--18321757
81
5.0
78
77
8
331
43
17
13
25
1.85
18321350--18321757
27
15.1
27
76
10
163
44
17
13
25
1.85
18328329--18328416
27
3.3
26
88
4
115
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19
11
23
1.83
18330510--18330535
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2.2
12
100
0
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50
1.60
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2.5
10
100
0
50
0
20
0
80
0.72
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10
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5
76
51
12
0
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1.40
18338630--18338679
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2.4
21
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3
75
50
14
0
36
1.43
18348679--18349659
27
36.4
26
78
10
835
43
19
17
20
1.89
18348648--18349659
81
12.5
80
79
8
930
42
19
17
20
1.89
18348921--18349011
28
3.3
27
76
11
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20
13
17
1.81
18350045--18350217
28
6.2
28
86
5
226
24
23
22
29
1.99
18350045--18350217
84
2.1
85
88
2
260
24
23
22
29
1.99
18350883--18350927
20
2.1
21
84
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56
33
8
20
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1.83
18353411--18353511
47
2.2
45
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103
33
18
14
32
1.92
18355072--18355114
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1.9
23
85
4
61
34
11
13
39
1.82
18355827--18355894
36
1.9
34
85
5
91
32
17
19
30
1.95
18359039--18359068
16
1.9
15
93
6
51
46
16
10
26
1.78
18381920--18382146
43
5.4
42
77
9
212
35
25
15
22
1.94
18381920--18382147
85
2.7
85
88
3
318
35
25
15
22
1.94
18399109--18399156
20
2.4
20
78
0
51
8
29
18
43
1.79
18404211--18404241
14
2.1
15
94
5
55
25
3
12
58
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18404198--18404243
13
3.4
14
77
19
53
26
8
13
52
1.69
18407366--18407442
38
2.0
38
97
0
145
25
18
9
46
1.78
18408594--18408618
13
1.9
13
100
0
50
28
0
24
48
1.52
18410283--18410346
28
2.3
28
75
5
67
42
14
17
26
1.87
18410511--18410548
17
2.2
18
85
4
51
21
2
10
65
1.35
18410532--18410571
21
1.9
21
89
0
62
27
0
12
60
1.33
18416864--18416924
25
2.4
25
88
0
95
31
24
18
26
1.97
18417329--18417458
65
2.0
65
95
0
233
43
12
6
38
1.67
18422053--18422383
29
11.4
29
79
8
208
36
12
27
22
1.91
18422054--18422383
58
5.7
58
80
8
237
36
13
27
23
1.91
18422115--18422325
87
2.4
85
77
4
233
37
12
27
22
1.91
18422285--18422398
59
1.9
59
83
0
147
41
15
24
18
1.89
18439664--18440172
49
10.6
49
92
2
761
33
7
29
29
1.85
18439863--18439943
27
3.2
27
60
22
66
37
7
28
27
1.84
18439664--18440172
145
3.5
144
89
3
758
33
7
29
29
1.85
18447724--18447901
27
6.6
27
82
7
173
28
28
15
26
1.96
18448381--18448406
12
2.2
12
100
0
52
42
0
7
50
1.31
18449507--18449531
11
2.3
11
100
0
50
28
32
8
32
1.86
18455894--18456071
27
6.6
27
82
7
173
28
28
15
26
1.96
18456551--18456577
12
2.2
12
100
0
54
40
0
7
51
1.30
18457678--18457702
11
2.3
11
100
0
50
28
32
8
32
1.86
18459733--18459776
20
2.3
19
92
4
70
68
0
2
29
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18460817--18460849
7
4.7
7
92
0
57
0
18
12
69
1.18
18467192--18467236
21
2.1
22
83
4
56
57
0
4
37
1.19
18471069--18471100
17
1.9
16
93
6
55
25
12
6
56
1.59
18472924--18472955
15
2.1
15
94
0
55
56
21
9
12
1.64
18473073--18473110
20
1.9
20
84
10
51
52
23
0
23
1.47
18477525--18477585
28
2.2
28
85
2
79
32
21
21
24
1.98
18477693--18477773
26
3.1
26
89
0
126
34
23
22
19
1.96
18477939--18478049
27
4.1
27
89
0
159
18
18
23
40
1.91
18478906--18478947
19
2.3
18
80
15
50
73
0
23
2
0.94
18483149--18483190
20
2.0
20
82
13
50
50
23
2
23
1.61

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222