Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  70731513

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   

This is table  37  of  222  ( 26535 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11025958--11026447
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3.7
132
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3
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23
18
29
1.97
11026430--11026670
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2.7
88
88
0
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22
28
1.99
11026504--11026641
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3.1
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19
124
21
23
26
27
1.99
11026518--11026663
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3.3
45
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115
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11027971--11028015
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2
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2.0
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2.7
27
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18
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2.0
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0
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18
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0
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2
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2.0
346
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1.9
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83
2
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20
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2.0
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21
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2.4
23
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3
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2.4
16
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1.48
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2.0
52
96
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25
26
13
33
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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0
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11
0
44
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2.1
45
92
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13
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0
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53
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3.1
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67
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0
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0
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1.49
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24
2.5
24
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20
54
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1.68
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2.1
20
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40
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16
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1.85
11078458--11078488
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100
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26
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5
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47
0
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1
11
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1.49
11103297--11103409
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1
11
34
1.48
11103496--11103531
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0
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2
2
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21
3.7
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98
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10
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120
47
8
15
27
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11105156--11105228
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3.2
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69
10
20
9
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2.0
13
100
0
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53
15
7
23
1.67
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18
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12
56
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11
22
35
1.89
11112818--11112875
29
2.0
29
100
0
116
37
17
20
24
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11113716--11113819
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2.1
49
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3
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6
10
50
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11115202--11115244
21
2.0
21
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52
37
0
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40
0
3
56
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4.0
120
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1
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1
4
52
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3.5
16
87
0
76
28
26
1
42
1.65
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10
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15
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82
0
0
17
0.67
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14
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0
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63
3
0
33
1.11
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58
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1.40
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22
21
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1.97
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23
21
21
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1.98
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21
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1
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2
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1.59
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32
2
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10
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4
15
44
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15
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1.60
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2.4
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2.1
116
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0
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5
12
43
1.65
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16
2.4
16
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4
51
52
5
2
39
1.38
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30
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69
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29
1.46
11140238--11140270
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2.2
15
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45
21
24
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1.80
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20
51
37
45
1
16
1.57
11142624--11142711
28
3.1
27
76
9
86
36
42
2
19
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11142857--11142910
27
2.0
28
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3
74
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46
1
22
1.62
11142862--11142910
13
3.7
13
78
5
53
30
46
2
20
1.62
11142905--11142950
21
2.1
22
88
4
67
34
36
0
28
1.58
11143585--11143887
114
2.6
114
79
7
292
30
22
18
28
1.97
11143730--11143937
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1.8
114
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6
249
29
22
18
29
1.98
11151806--11151843
19
2.0
19
85
10
51
73
7
7
10
1.24
11151788--11151842
25
2.2
25
80
6
67
72
9
9
9
1.28
11151832--11151876
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15
80
9
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75
0
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6
1.01
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44
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125
25
20
30
24
1.99
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4.4
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10
289
25
18
28
27
1.98
11153942--11154653
218
3.2
218
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5
912
26
17
26
28
1.98
11154355--11154595
129
1.9
130
83
6
319
24
19
26
29
1.98
11154306--11154639
174
1.9
173
80
9
394
26
19
26
27
1.99
11154268--11154649
44
8.7
44
76
9
291
25
18
28
27
1.98
11162774--11162854
25
2.9
29
78
16
107
24
23
7
44
1.79
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35
2.7
35
80
0
111
23
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13
53
1.69
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16
2.0
15
93
6
53
29
0
0
70
0.87
11165917--11165962
22
2.1
22
84
8
58
56
2
4
36
1.31
11167043--11167067
13
1.9
13
100
0
50
40
48
0
12
1.40
11167090--11167138
12
3.9
12
82
10
53
71
10
0
18
1.13
11167108--11167137
6
5.0
6
100
0
60
66
16
0
16
1.25
11175744--11175923
91
2.0
90
86
5
256
26
7
22
42
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11176925--11177081
43
3.7
43
75
10
160
25
16
25
32
1.96
11180734--11180775
21
2.0
21
100
0
84
28
14
14
42
1.84
11181631--11181730
9
11.0
9
72
19
75
61
2
4
33
1.26
11181693--11181729
16
2.2
16
90
9
56
64
2
0
32
1.07
11182221--11182424
10
21.7
9
65
14
74
33
1
2
61
1.22
11182250--11182424
19
9.4
19
67
10
83
33
1
2
62
1.18
11186093--11186165
36
2.0
36
97
0
137
42
19
15
23
1.88
11188129--11188515
193
2.0
193
96
0
720
31
24
15
28
1.96
11192829--11192861
17
2.0
17
88
5
50
66
3
12
18
1.36
11193979--11194043
21
3.1
20
74
24
62
81
1
4
12
0.91
11193981--11194043
15
4.3
15
76
15
60
80
1
4
12
0.93
11193980--11194043
6
10.7
6
85
9
62
81
1
4
12
0.92
11194765--11194818
22
2.5
21
81
3
63
51
1
1
44
1.22
11194794--11194833
16
2.5
16
91
0
62
47
2
7
42
1.45
11194800--11195013
59
3.5
64
88
8
242
41
4
8
45
1.56
11194844--11195013
59
2.9
57
98
0
277
40
5
9
44
1.59
11195078--11195130
23
2.3
24
81
15
67
58
1
0
39
1.09
11195080--11195129
24
2.1
23
85
10
66
62
2
0
36
1.07
11198165--11198208
2
22.0
2
100
0
88
50
0
50
0
1.00
11201405--11201443
19
2.1
19
85
0
51
46
0
0
53
1.00
11201402--11201479
40
2.0
40
85
10
106
43
0
0
56
0.99
11202604--11202709
56
1.9
56
86
5
153
28
36
0
34
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11204134--11204182
2
24.5
2
100
0
98
0
48
0
51
1.00
11210326--11210366
6
6.8
6
100
0
82
48
34
0
17
1.47
11212571--11212610
22
1.9
20
85
10
53
35
5
20
40
1.74
11213736--11213864
45
2.9
45
85
2
179
41
12
20
25
1.87
11219382--11219497
62
1.9
61
89
5
180
52
3
4
39
1.38
11220943--11221013
30
2.4
30
86
6
92
26
18
11
43
1.83
11228272--11228324
25
2.1
25
100
0
106
22
18
15
43
1.87
11230794--11230856
22
2.9
23
79
9
69
47
9
23
19
1.78
11230975--11231009
17
2.0
18
88
5
54
40
28
5
25
1.78
11234328--11234410
33
2.5
33
80
7
89
24
31
25
19
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222