Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  70731513

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   

This is table  38  of  222  ( 26535 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11234394--11234427
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2.0
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0
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29
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1.11
11237595--11237642
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2.5
19
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3
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12
4
6
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1.11
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0
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2.0
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19
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0
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26
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2.1
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2.2
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0
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2.0
17
88
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52
54
0
0
45
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11301373--11301692
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120
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2.4
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0
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2.3
27
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27
29
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2.0
28
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11
90
0
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0
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358
2.0
347
96
3
1315
32
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9
43
1.77
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3
20.0
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101
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33
1.15
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10
11.7
10
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18
50
62
0
5
31
1.19
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1.9
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27
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22
2.9
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29
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1.64
11326614--11326676
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1.64
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2.0
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2.3
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10
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0
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44
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21
27
1.97
11352995--11353029
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2.8
12
91
4
52
31
8
0
60
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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100
0
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0
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2.0
251
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19
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39
9
3
47
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11438694--11438782
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40
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20
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100
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17
7
36
1.79
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40
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82
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109
36
17
7
39
1.77
11438957--11439009
20
2.7
19
77
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52
37
11
7
43
1.69
11439045--11439119
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3.8
19
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13
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40
18
4
37
1.70
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186
1.9
186
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8
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38
16
5
39
1.73
11438917--11439298
147
2.6
146
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8
377
39
16
5
39
1.71
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1.9
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140
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1.71
11439192--11439523
40
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271
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16
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36
1.74
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39
15
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1.74
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15.6
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16
6
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11
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12
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48
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20
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13
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1.74
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80
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194
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12
8
41
1.73
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20
8.5
20
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100
0
50
60
0
0
40
0.97
11442264--11442329
28
2.4
26
74
18
62
60
7
3
28
1.39
11443830--11443879
22
2.3
21
76
6
55
20
20
34
26
1.96
11448370--11448430
26
2.3
26
91
0
95
36
8
13
42
1.74
11451052--11451147
21
4.6
21
70
0
75
15
21
18
43
1.87
11450995--11451147
42
3.6
42
79
0
144
17
21
17
43
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11456819--11456915
27
3.6
27
80
0
95
32
23
24
18
1.97
11458095--11458181
45
1.9
45
80
0
102
21
20
13
43
1.87
11465006--11465053
24
2.0
24
88
8
71
39
4
37
18
1.70
11465217--11465274
20
3.1
19
80
7
73
46
1
0
51
1.11
11469049--11469142
40
2.4
40
78
5
104
27
20
19
32
1.96
11469312--11469348
9
4.2
9
89
3
58
48
10
0
40
1.38
11470085--11470115
13
2.4
13
94
0
53
0
16
3
80
0.83
11475624--11475653
12
2.4
13
88
11
53
23
0
46
30
1.52
11477688--11477713
12
2.2
12
100
0
52
42
34
23
0
1.54
11480562--11480587
11
2.4
11
100
0
52
30
7
15
46
1.74
11508668--11508785
17
6.3
18
69
18
80
58
0
0
39
1.10
11508679--11508716
11
3.5
11
92
7
69
55
0
0
44
0.99
11508668--11508717
10
5.1
10
81
13
68
54
0
0
46
1.00
11508668--11508776
40
2.8
39
78
10
132
59
0
0
38
1.10
11509170--11509212
22
2.0
22
85
0
59
18
9
2
69
1.26
11512945--11512988
18
2.5
17
82
17
54
56
4
2
36
1.32
11518285--11518356
35
2.0
38
89
8
114
34
1
0
63
1.03
11522109--11522215
20
5.3
20
62
8
56
30
17
29
21
1.96
11521946--11522233
120
2.4
120
85
2
373
30
17
28
23
1.97
11521946--11522233
40
7.2
40
82
2
301
30
17
28
23
1.97
11524371--11524403
16
2.1
16
94
0
57
6
33
0
60
1.21
11530226--11530305
31
2.6
31
91
0
133
35
15
7
42
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11542576--11542779
46
4.5
46
93
1
342
33
16
23
26
1.95
11547448--11547708
46
5.7
46
94
1
447
28
22
15
33
1.94
11550622--11550701
38
2.1
37
88
2
115
32
1
2
63
1.15
11550622--11550717
9
10.4
9
70
10
70
31
2
3
63
1.21
11550633--11550702
19
3.7
19
77
7
79
31
1
2
64
1.17
11554455--11554516
23
2.5
25
80
15
67
45
8
19
27
1.78
11560228--11560276
17
2.9
17
90
0
71
10
38
28
22
1.87
11563564--11563723
44
3.7
43
76
5
133
25
23
20
30
1.98
11563969--11564387
87
4.8
87
92
0
703
25
24
21
28
1.99
11565976--11566027
27
1.9
27
84
0
68
3
23
0
73
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222