Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  70731513

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
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          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   

This is table  33  of  222  ( 26535 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9865583--9865620
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2.0
20
89
5
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2
2
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1.26
9865589--9865631
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2.3
19
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4
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1.41
9865719--9865803
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0
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2.0
22
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63
44
0
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1.44
9868395--9868438
20
2.1
21
84
12
56
45
0
13
40
1.44
9868432--9868589
63
2.5
62
83
11
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10
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1.82
9868732--9868888
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3.8
41
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6
183
20
19
28
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9868733--9868907
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4.3
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9870640--9870707
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3.3
21
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4
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14
23
16
45
1.84
9870879--9870927
21
2.4
21
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3
73
42
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1.80
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0
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0
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20
2.0
20
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20
20
2
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1.52
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1.9
19
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56
0
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1.12
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1.96
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120
33
20
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2.1
16
100
0
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42
6
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2.2
45
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9
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5
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26
2.6
28
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2
0
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2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9889519--9890075
120
4.7
120
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0
1032
49
5
0
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1.32
9889776--9889810
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2.0
17
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52
54
0
0
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9889896--9889930
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
9890016--9890050
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
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2.4
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0
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12
0
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1.42
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2.0
22
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4
26
1.70
9899681--9899795
23
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19
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21
1.97
9899690--9899830
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1.96
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0
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2.0
25
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2
0
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77
25
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2.1
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0
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0
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45
2.1
44
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138
34
4
27
33
1.76
9919023--9919057
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2.0
17
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54
0
0
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2.7
27
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51
4
0
44
1.20
9919159--9919200
17
2.5
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14
52
54
0
0
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0.99
9919166--9919200
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
9918943--9919212
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1.9
146
93
5
476
46
3
2
47
1.34
9919366--9919412
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2.9
16
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18
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46
2
6
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1.40
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17
2.0
17
94
0
59
50
0
5
44
1.26
9919451--9919643
91
2.1
92
89
4
293
46
4
4
45
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9933481--9933529
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2.4
22
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2
2
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1.15
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22
3.2
20
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16
55
28
4
4
62
1.34
9933943--9933998
22
2.7
20
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13
67
28
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3
62
1.34
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0
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0
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50
0
0
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0
0
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1.00
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0
0
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37
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0
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16
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0
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0
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0
0
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20
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2.0
39
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0
118
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12
18
25
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10027610--10027669
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2.0
30
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0
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16
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16
37
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9.2
52
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14
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4.7
98
91
1
680
28
22
14
34
1.93
10029473--10029929
150
3.0
151
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9
598
28
22
14
34
1.93
10033069--10033272
49
4.0
50
83
10
241
32
29
13
24
1.94
10033153--10033271
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2.0
59
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1
231
31
31
13
23
1.93
10033162--10033252
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28
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22
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31
15
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1.95
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37
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1
372
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21
16
37
1.93
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52
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52
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570
28
22
14
34
1.93
10034707--10035172
98
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98
91
1
680
28
22
14
34
1.93
10034708--10035164
150
3.0
151
85
9
598
28
22
14
34
1.93
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2.1
57
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13
145
46
7
16
29
1.74
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10
10.2
10
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19
79
46
0
0
52
1.07
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62
41
0
0
58
0.98
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11
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41
0
0
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25
2.0
25
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0
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20
20
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1.96
10040180--10040236
22
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21
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15
19
19
45
1.85
10051012--10051081
25
2.8
25
86
0
95
27
25
18
28
1.98
10052876--10052918
21
2.1
20
83
12
52
67
11
9
11
1.42
10054217--10054310
33
2.8
33
88
0
116
25
21
11
41
1.87
10057549--10057596
24
2.1
24
85
11
66
41
6
20
31
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10060409--10060451
12
3.4
13
84
12
54
27
2
2
67
1.15
10060409--10060447
14
2.9
14
88
7
55
28
2
2
66
1.18
10060388--10060617
84
2.6
88
81
15
278
35
3
8
53
1.47
10060423--10060613
84
2.3
82
87
5
287
35
2
7
54
1.43
10060504--10060535
14
2.4
14
94
5
57
31
3
0
65
1.08
10063471--10063796
46
7.6
46
88
8
394
29
21
14
34
1.93
10063652--10063760
36
3.0
36
93
0
182
30
20
11
37
1.88
10068605--10068651
24
2.0
24
95
0
85
38
17
10
34
1.84
10075107--10075214
10
11.7
9
68
17
53
65
0
3
29
1.16
10075385--10075561
10
18.3
10
68
16
88
32
5
0
62
1.21
10075390--10075510
11
12.2
11
66
18
52
30
4
0
64
1.18
10075385--10075559
19
9.0
20
69
11
105
32
5
0
62
1.21
10075385--10075548
49
3.4
48
73
13
129
32
4
0
61
1.22
10075430--10075559
29
4.5
28
79
12
122
32
5
0
61
1.24
10075763--10075976
89
2.5
85
80
5
243
35
11
14
37
1.83
10078535--10078569
18
2.0
17
88
5
52
31
17
22
28
1.96
10087709--10087750
21
2.0
22
86
9
61
50
7
9
33
1.62
10092238--10092289
24
2.2
24
89
0
77
50
9
3
36
1.54
10096408--10096459
24
2.2
24
89
0
77
50
9
3
36
1.54
10099295--10099333
20
2.0
20
85
10
53
53
5
0
41
1.23
10101673--10101940
96
2.8
98
84
6
341
41
2
16
39
1.63
10101673--10101973
96
3.1
95
82
7
322
39
2
17
40
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10102002--10102272
127
2.1
126
91
0
434
34
16
20
29
1.94
10104341--10104505
55
3.2
55
70
19
192
44
6
4
44
1.48
10104323--10104518
98
2.0
98
97
0
374
45
6
4
43
1.49
10104421--10104587
58
2.9
56
70
19
137
46
7
4
41
1.50
10105065--10105107
18
2.4
18
88
0
59
44
9
27
18
1.80
10105724--10105761
14
2.8
14
80
4
51
52
18
2
26
1.58
10107042--10107169
40
3.2
40
76
12
163
26
28
24
21
1.99
10107057--10107192
40
3.3
42
77
12
174
24
27
24
24
2.00
10107032--10107213
80
2.3
80
97
0
337
25
26
24
23
2.00
10107036--10107218
40
4.6
40
72
13
153
22
27
24
25
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222