Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  64368997

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  203  of  208  ( 24943 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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54
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1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.84
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1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
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50
7
5
36
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62696170--62696205
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19
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1.15
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11
18
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1.87
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17
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1.82
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1.79
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19
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1.98
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12
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31
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0
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1.18
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19
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0
2
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131
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18
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18
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0
90
34
13
21
31
1.92
62768512--62768538
14
1.9
14
100
0
54
66
0
0
33
0.92
62774300--62774360
29
2.1
29
81
0
68
34
9
4
50
1.57
62775436--62775469
18
1.9
17
94
5
59
38
8
0
52
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62775864--62776182
108
3.0
106
85
7
412
31
15
17
35
1.91
62778745--62778792
24
2.0
24
100
0
96
41
4
29
25
1.74
62780524--62780577
10
5.1
10
81
16
56
83
0
16
0
0.65
62780522--62780575
20
2.7
20
85
0
81
85
0
14
0
0.61
62780522--62780575
7
8.1
7
82
10
69
85
0
14
0
0.61
62781860--62783097
99
12.5
99
87
1
1602
32
22
20
24
1.97
62781923--62783098
50
23.7
49
69
11
676
32
22
20
24
1.98
62784955--62785033
37
2.2
35
80
6
86
35
6
1
56
1.32
62785197--62785221
12
2.1
12
100
0
50
52
8
0
40
1.31
62785500--62785821
110
3.0
107
87
5
436
31
17
17
34
1.93
62796036--62796080
15
3.1
15
81
15
58
48
4
2
44
1.35
62799300--62799326
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
62799372--62799422
24
2.1
24
96
0
93
50
9
7
31
1.64
62801241--62801302
29
2.1
29
85
11
81
54
8
9
27
1.61
62805785--62805809
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
62806956--62806995
21
1.9
21
94
0
71
42
10
17
30
1.82
62811026--62811098
31
2.4
30
86
2
101
49
0
5
45
1.25
62811155--62811233
31
2.5
31
85
0
95
46
2
15
35
1.59
62812020--62812045
10
2.6
10
100
0
52
46
0
19
34
1.50
62813362--62813421
29
2.1
29
84
6
77
31
3
0
65
1.09
62813372--62813414
20
2.3
19
88
8
61
32
2
0
65
1.06
62814440--62814468
2
15.0
2
92
7
51
51
0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62817140--62817483
182
1.9
184
84
2
469
46
9
13
30
1.74
62819961--62820140
44
4.1
44
75
5
154
35
18
21
25
1.96
62820272--62820297
5
5.2
5
100
0
52
38
19
19
23
1.93
62820246--62820297
26
2.0
26
81
7
61
34
15
26
23
1.94
62821489--62821628
38
3.7
38
89
0
199
35
17
10
36
1.84
62842203--62842238
17
2.2
16
90
5
54
58
13
0
27
1.36
62842183--62842232
26
2.0
25
84
11
66
52
14
2
32
1.53
62845933--62845976
14
2.9
14
81
18
52
63
0
0
36
0.95
62848714--62848753
17
2.5
16
84
8
55
55
20
0
25
1.44
62848942--62849056
51
2.2
52
83
6
137
31
14
10
43
1.79

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208