Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  64368997

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  193  of  208  ( 24943 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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63
1
2
31
1.17
60381406--60381465
27
2.3
27
85
8
79
60
1
3
35
1.23
60385136--60385412
46
6.0
46
91
2
423
36
10
25
28
1.88
60394817--60394855
9
4.2
9
84
15
53
66
0
0
33
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60399038--60399063
4
6.5
4
100
0
52
76
0
0
23
0.78
60405990--60406020
16
1.9
16
93
0
53
70
0
3
25
1.02
60406494--60406690
105
1.9
105
93
2
342
32
16
15
35
1.90
60409197--60409230
3
11.3
3
87
0
50
35
32
0
32
1.58
60412421--60412451
15
2.1
15
100
0
62
61
12
6
19
1.53
60419537--60419589
27
2.0
27
88
0
79
37
18
11
32
1.87
60432030--60433613
228
6.9
228
86
2
1526
29
21
26
22
1.99
60434847--60434937
9
9.7
9
69
19
53
28
3
0
68
1.06
60434849--60434928
29
2.8
29
85
11
94
27
3
0
68
1.06
60434847--60434969
39
3.2
38
81
14
128
32
3
0
64
1.10
60434895--60434969
11
7.2
11
75
22
56
36
2
0
61
1.10
60434866--60434987
39
3.0
40
89
7
174
36
2
0
61
1.09
60434877--60434937
9
6.4
9
75
17
61
27
1
0
70
0.97
60434906--60434959
28
1.9
28
81
7
65
35
3
0
61
1.14
60434928--60434986
21
2.8
21
73
2
64
38
1
0
59
1.08
60437111--60437136
8
3.2
8
100
0
52
38
0
0
61
0.96
60438868--60440430
228
6.9
227
83
2
1328
30
21
25
22
1.99
60438868--60440373
456
3.3
456
82
2
1610
30
22
24
22
1.99
60438962--60440463
684
2.2
684
80
2
1647
29
22
25
22
1.99
60442749--60442779
6
5.2
6
100
0
62
64
0
0
35
0.94
60446701--60446744
18
2.4
19
84
3
54
59
0
0
40
0.98
60447533--60447639
40
2.7
39
78
4
108
37
21
17
23
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60447694--60448022
41
8.0
41
85
4
396
22
20
27
28
1.99
60449793--60449832
17
2.4
17
91
0
62
50
15
20
15
1.79
60451851--60452429
23
25.3
23
73
10
321
29
7
23
39
1.81
60451873--60452403
137
3.9
136
87
3
633
29
6
23
39
1.80
60451834--60452241
160
2.5
160
96
0
762
29
7
23
39
1.81
60451834--60452424
160
3.7
159
86
5
757
29
6
23
39
1.81
60453035--60453297
43
6.1
43
89
0
373
19
18
31
30
1.96
60457866--60457900
10
3.5
10
88
0
52
0
8
60
31
1.27
60458646--60458713
14
4.8
14
71
13
50
57
1
1
39
1.17
60461672--60461700
2
15.0
2
92
7
51
51
0
0
48
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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