Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  64368997

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  82  of  208  ( 24943 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28840686--28840784
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1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
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28964550--28964674
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12
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2.0
23
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0
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6
33
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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138
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3.0
22
87
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84
66
0
1
32
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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1.98
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1.99
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0
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14.7
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17
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82
0
16
1
0.74
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11
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9
91
82
0
16
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0.74
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87
0
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24
22
23
1.99
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14
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6
6
6
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12
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28
5
2
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1.32
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23
2.2
24
89
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42
5
1
50
1.37
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2.0
74
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1
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17
18
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1.92
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34
2.0
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0
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19
19
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28
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0
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20
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0
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17
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108
1.8
108
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6
265
23
19
9
47
1.79
29060438--29060893
45
10.1
45
84
6
613
28
16
24
29
1.97
29060438--29060899
135
3.4
135
88
3
675
28
16
24
29
1.97
29063311--29063526
107
2.0
107
93
0
369
30
17
18
34
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29065108--29065147
7
5.7
7
90
0
62
77
0
0
22
0.77
29065107--29065148
13
3.2
13
86
6
57
76
0
0
23
0.79
29066172--29066274
30
3.5
29
82
5
100
36
12
0
49
1.47
29066172--29066286
30
3.9
28
79
5
95
37
13
1
47
1.52
29066680--29066704
10
2.5
10
100
0
50
76
0
16
8
1.02
29066806--29066840
17
2.0
18
88
5
54
74
5
17
2
1.14
29066895--29066939
21
2.0
23
87
12
67
24
44
28
2
1.66
29067389--29067433
18
2.5
18
81
0
54
33
8
2
55
1.43
29068956--29069009
27
1.9
29
85
7
76
37
7
5
50
1.54
29069006--29069041
16
2.2
17
90
5
56
36
11
0
52
1.37
29069013--29069073
32
2.0
30
84
9
79
39
6
1
52
1.37
29069520--29069557
20
1.9
20
89
10
60
23
13
5
57
1.56
29069585--29069913
109
3.0
109
88
1
482
31
17
17
34
1.93
29075353--29075406
16
3.4
16
94
0
90
33
0
35
31
1.58
29075385--29075494
45
2.6
43
80
9
129
33
5
29
31
1.80
29075616--29075670
25
2.2
25
84
9
69
52
1
0
45
1.11
29075938--29075990
27
2.1
27
82
10
67
43
0
0
56
0.99
29079361--29079433
20
3.4
20
68
17
65
27
12
2
57
1.49
29079380--29079452
20
3.3
22
67
17
69
26
16
1
56
1.49
29079359--29079454
45
2.1
45
100
0
192
25
14
2
58
1.48
29081267--29081341
38
2.0
38
92
5
125
17
18
18
45
1.86
29082823--29082915
45
2.1
44
92
6
152
36
25
4
33
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29089374--29089404
9
3.6
9
95
4
55
70
6
0
22
1.09
29094998--29095052
9
6.3
9
83
8
51
54
0
10
34
1.36
29094998--29095035
3
12.3
3
88
5
58
60
0
2
36
1.11
29095791--29095818
2
14.0
2
100
0
56
0
0
50
50
1.00
29096587--29097172
44
13.7
44
68
10
336
26
20
21
31
1.98
29096564--29097177
129
4.8
129
88
2
905
26
19
22
31
1.98
29096564--29097177
256
2.4
254
88
3
899
26
19
22
31
1.98
29096531--29097177
85
7.6
85
70
11
372
26
19
22
31
1.98
29097281--29097375
44
2.2
44
84
3
120
28
25
13
32
1.94
29097297--29097394
44
2.2
44
85
3
126
28
22
20
28
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208