Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  64368997

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  65  of  208  ( 24943 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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370
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Indels
Score
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C
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30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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24
22
19
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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19
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128
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21
28
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132
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24
24
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13
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20
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0
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0
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24378916--24378967
12
4.1
12
80
11
52
1
23
0
75
0.91
24383057--24383253
98
2.0
98
95
0
358
37
25
10
27
1.88
24383913--24383969
24
2.3
26
82
11
75
56
3
7
33
1.43
24384380--24384405
13
2.0
13
100
0
52
84
0
0
15
0.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24384729--24384799
19
3.6
21
87
11
105
40
12
8
38
1.74
24391402--24391430
3
9.7
3
100
0
58
0
31
0
68
0.89
24403996--24404022
11
2.5
11
100
0
54
22
7
18
51
1.70
24405422--24405615
92
2.1
92
88
5
286
44
4
4
46
1.41
24405593--24405691
52
2.0
52
80
11
118
45
6
2
46
1.39
24405648--24405681
17
2.0
17
94
0
59
44
5
0
50
1.26
24405653--24405700
17
3.0
16
79
17
55
45
6
2
45
1.40
24405750--24405789
16
2.5
17
76
15
50
47
0
0
52
1.00
24405866--24405900
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
24405866--24405907
17
2.5
17
85
14
52
45
0
0
54
0.99
24405854--24406124
143
1.9
147
93
4
478
46
2
3
46
1.34
24406009--24406043
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
24406205--24406299
45
2.1
45
88
1
138
32
27
5
34
1.79
24406278--24406310
16
2.1
16
94
0
57
30
36
0
33
1.58
24406291--24406333
21
2.0
21
90
0
68
34
37
2
25
1.69
24412468--24412541
29
2.5
27
79
16
76
50
12
17
20
1.78
24417877--24417907
4
7.8
4
92
0
53
74
0
3
22
0.96
24419267--24419319
23
2.4
22
76
20
56
9
18
1
69
1.25
24431849--24431883
9
3.9
9
84
0
52
37
14
37
11
1.82
24431997--24432032
16
2.2
16
100
0
72
25
0
36
38
1.56
24432266--24432300
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
24432182--24432463
151
1.9
151
96
0
528
46
3
3
47
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24432397--24432438
15
2.7
16
82
14
52
52
2
0
45
1.13
24432406--24432447
15
2.9
15
82
10
52
52
0
0
47
1.00
24432219--24432447
76
3.0
76
63
15
184
47
3
3
46
1.35
24432395--24432693
120
2.5
121
91
4
480
48
4
3
43
1.40
24432734--24432781
24
1.9
25
83
8
62
50
2
2
45
1.25
24432689--24432898
92
2.3
92
82
7
223
49
3
2
44
1.35
24432728--24432917
92
2.1
92
87
5
269
46
4
4
45
1.42
24435409--24435670
46
5.4
45
76
18
210
35
14
22
28
1.93
24435364--24435670
52
6.1
51
82
10
382
34
14
22
28
1.93
24435350--24435671
98
3.3
98
95
0
563
34
14
22
28
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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