Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  64892201

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   

This is table  201  of  221  ( 26413 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Copy
Number
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Indels
Score
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Score
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0
23
0.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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19
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4
53
57
2
2
37
1.26
59283677--59283727
15
3.5
15
72
5
59
56
3
3
35
1.36
59283677--59283736
29
2.1
29
100
0
120
53
6
6
33
1.53
59292037--59292148
42
2.6
42
82
12
138
25
19
25
29
1.99
59292053--59292165
42
2.7
42
78
14
124
24
21
28
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59293263--59293436
87
2.0
87
95
0
312
28
10
13
47
1.76
59302627--59302651
5
5.0
5
100
0
50
60
0
0
40
0.97
59305877--59305990
56
2.0
56
100
0
228
42
19
15
21
1.88
59307012--59307073
3
20.7
3
90
6
90
64
0
30
4
1.14
59307186--59307220
3
11.7
3
100
0
70
0
34
0
65
0.93
59313231--59313257
11
2.5
11
100
0
54
22
7
18
51
1.70
59314657--59314847
92
2.1
89
88
6
278
45
4
4
46
1.42
59314825--59314923
52
2.0
52
80
11
118
45
6
2
46
1.39
59314880--59314913
17
2.0
17
94
0
59
44
5
0
50
1.26
59314885--59314932
17
3.0
16
79
17
55
45
6
2
45
1.40
59314982--59315021
16
2.5
17
76
15
50
47
0
0
52
1.00
59315098--59315132
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
59315098--59315139
17
2.5
17
85
14
52
45
0
0
54
0.99
59315086--59315355
143
1.9
146
93
5
476
47
2
3
46
1.34
59315241--59315275
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
59315436--59315530
45
2.1
44
88
1
136
32
27
5
34
1.79
59315509--59315541
16
2.1
16
94
0
57
30
36
0
33
1.58
59316852--59316904
21
2.5
21
78
0
61
33
35
5
24
1.79
59319703--59319765
17
3.5
17
71
12
63
49
14
3
33
1.59
59319697--59319768
37
1.9
37
97
0
135
47
16
2
33
1.61
59319701--59319785
37
2.3
37
88
8
120
48
15
3
32
1.62
59319897--59319973
38
2.0
38
94
0
136
18
2
25
53
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59320348--59320393
20
2.3
20
88
7
67
50
15
6
28
1.69
59321109--59321141
14
2.3
15
89
5
50
30
3
33
33
1.73
59322658--59323106
147
3.1
147
79
3
370
25
15
22
35
1.94
59322771--59323106
146
2.3
147
83
3
399
26
16
22
35
1.94
59325374--59325539
13
12.5
13
71
8
111
40
9
4
45
1.57
59325401--59325548
53
2.8
53
93
1
242
41
9
4
44
1.58
59325398--59325548
54
2.8
54
92
1
250
41
9
4
45
1.57
59325744--59325798
16
3.7
16
74
18
64
47
16
1
34
1.57
59325879--59326147
9
31.0
9
73
15
210
46
20
1
31
1.62
59325879--59326143
16
15.9
16
70
17
159
46
20
1
31
1.61

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221