Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  64892201

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   

This is table  31  of  221  ( 26413 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8514562--8514613
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55
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2.0
22
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0
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20
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58
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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200
2.0
200
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1.97
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2.3
114
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338
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23
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2.5
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38
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1.50
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0
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72
1.13
8611210--8611246
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51
13
0
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2.1
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3.7
17
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29
29
21
18
1.97
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2.4
44
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3
144
29
23
13
33
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
19
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70
55
0
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41
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0
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27
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1.8
138
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48
23
0
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1.51
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100
0
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0
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2.0
174
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7
510
51
14
16
16
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8722427--8722459
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1.9
17
93
0
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36
3
6
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1.41
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2.2
17
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9
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16
22
0
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1.35
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20
39
1.77
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4
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1
19
37
1.62
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2
671
35
17
20
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1.95
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2.2
21
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14
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6
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36
1.78
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17
18
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3
95
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10
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10
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10
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11
50
63
0
0
36
0.95
8782729--8782769
17
2.3
19
83
8
50
70
7
7
14
1.31
8786579--8786619
21
2.0
21
85
0
55
43
19
9
26
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8788050--8788117
25
2.7
25
79
0
73
25
23
19
32
1.97
8793825--8793954
40
3.3
40
80
8
153
32
20
25
21
1.98
8795766--8795794
13
2.1
14
93
6
51
62
0
0
37
0.96
8795862--8795923
19
3.2
19
80
8
54
46
16
19
17
1.84
8795881--8795923
20
2.2
20
87
8
61
51
18
16
13
1.77
8796548--8796647
31
3.3
31
73
8
114
37
2
8
53
1.42
8801669--8801794
63
2.0
63
90
0
198
33
19
13
34
1.90
8803946--8803991
22
2.1
20
84
15
56
54
0
10
34
1.36
8809524--8809594
28
2.6
28
80
8
83
35
23
21
19
1.96
8809571--8809635
29
2.2
29
86
0
85
26
16
26
30
1.97
8810649--8810682
17
1.9
18
88
5
52
58
11
26
2
1.47
8822591--8822640
24
2.1
24
81
7
57
20
18
0
62
1.34
8823777--8823820
22
2.0
22
81
4
52
47
0
18
34
1.49
8825073--8825148
9
8.4
9
86
0
98
42
23
7
26
1.81
8825246--8825295
18
2.7
18
81
3
55
14
2
42
42
1.56
8828118--8828244
25
5.1
25
72
6
89
34
21
24
19
1.96
8828183--8828281
50
2.0
50
84
4
128
31
17
28
23
1.97
8828209--8828281
25
2.9
26
73
8
78
30
16
27
26
1.97
8831826--8831896
24
2.9
24
81
6
70
16
23
0
59
1.38
8838457--8838501
21
2.1
22
84
12
58
71
0
2
26
0.98
8844555--8844597
9
4.9
9
80
5
52
62
4
0
32
1.15
8847699--8847775
9
8.4
9
76
2
64
24
10
23
41
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8851609--8851768
54
3.0
52
69
15
146
29
15
22
33
1.94
8852244--8852277
3
11.3
3
100
0
68
32
0
32
35
1.58
8863983--8864034
15
3.5
15
70
19
54
15
34
26
23
1.94
8863973--8864039
30
2.2
30
100
0
134
19
37
25
17
1.94
8868048--8868149
43
2.3
43
88
1
141
31
23
17
27
1.97
8869332--8869414
40
2.1
40
95
0
148
33
27
12
26
1.92
8881071--8881095
11
2.3
11
100
0
50
44
0
0
56
0.99
8881033--8881086
22
2.5
20
77
16
54
42
0
3
53
1.18
8881400--8881450
8
6.6
8
76
14
54
60
1
0
37
1.08
8881400--8881450
15
3.3
15
81
8
59
60
1
0
37
1.08

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221