Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  64892201

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   

This is table  47  of  221  ( 26413 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13327039--13327210
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2.2
79
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3
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27
26
1.99
13326986--13327208
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7
207
25
21
26
26
1.99
13327066--13327233
79
2.1
80
79
4
180
25
21
27
25
1.99
13327218--13327264
22
2.1
23
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31
23
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0
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2.0
76
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0
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0
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25
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3.7
58
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2
301
18
28
11
40
1.87
13354940--13355165
87
2.6
86
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292
19
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12
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1.88
13372873--13372932
25
2.4
25
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5
86
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28
16
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27
5.5
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80
6
144
28
28
16
26
1.97
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2.3
54
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2
160
26
26
26
20
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2.2
23
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2.1
34
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15
16
24
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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2.0
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2.0
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4
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2.0
106
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35
2.9
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0
137
18
13
27
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46
0
2
51
1.13
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25
2.2
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1
49
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111
39
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0
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1.07
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100
0
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46
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0
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1.00
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9
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1.45
13428645--13428695
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26
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11
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5
0
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1.19
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5
5.2
5
100
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0
0
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49
95
0
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19
20
29
1.97
13442482--13442558
29
2.7
29
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102
40
10
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2.0
32
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13
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39
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50
1.43
13442815--13442865
26
1.9
26
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31
5
0
62
1.19
13445153--13445311
43
3.7
43
85
5
198
30
23
16
28
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13450054--13450245
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63
42
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1
22
1.61
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21
5.8
21
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9
99
45
30
0
23
1.59
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2.6
15
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60
42
39
0
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1.50
13450054--13450250
14
13.8
14
69
13
80
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32
1
23
1.61
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4
188
27
21
18
33
1.96
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2.0
40
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22
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85
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0
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22
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1.84
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21
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35
1.81
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15
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44
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11
11
1.34
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13
1.03
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6.8
100
89
0
992
31
24
20
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13505252--13505296
23
2.1
20
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12
54
24
0
6
68
1.13
13521035--13521074
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4.4
9
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0
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20
2
35
42
1.65
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0
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22
0
0
77
0.76
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2.2
14
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0
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48
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19
1.78
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19
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53
2
0
44
1.13
13532541--13532579
19
2.1
19
85
0
51
64
20
10
5
1.44
13535815--13535867
4
13.2
4
82
7
54
22
3
1
71
1.12
13536489--13536542
28
1.9
28
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0
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5
24
29
1.77
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1.9
26
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4
12
4
80
1.00
13544413--13544669
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5.5
47
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0
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28
1.85
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14
2.9
14
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20
1.68
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100
0
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0
0
0.89
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16
1.9
16
93
0
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35
12
12
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1.82
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110
6.7
110
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2
944
33
21
12
32
1.91
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12
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51
44
0
0
55
0.99
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22
95
0
81
35
24
13
26
1.92
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27
2.8
28
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9
81
15
7
3
73
1.21
13599267--13599330
27
2.4
27
86
5
85
15
7
3
73
1.19
13599284--13599358
33
2.3
33
80
15
86
20
4
5
70
1.23
13601655--13601749
49
1.9
49
89
0
145
42
10
16
30
1.82
13609359--13609414
26
2.2
26
96
0
103
32
25
25
17
1.97
13615408--13615469
30
2.1
30
90
6
99
46
11
8
33
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13622458--13622523
30
2.1
33
83
11
84
36
3
4
56
1.35
13622613--13622664
20
2.5
22
75
15
56
36
5
0
57
1.23
13629255--13629537
117
2.4
117
83
1
354
27
19
26
26
1.99
13629506--13629863
50
7.2
50
65
5
195
30
21
23
24
1.99
13629506--13629929
199
2.1
199
92
2
717
30
22
23
24
1.99
13629506--13629929
99
4.3
100
91
1
683
30
22
23
24
1.99
13629892--13629965
36
2.1
36
100
0
148
37
18
21
21
1.94
13629940--13630099
50
3.2
50
68
3
142
30
20
24
25
1.99
13629792--13630065
136
2.0
136
93
1
469
31
21
22
24
1.98
13629932--13630120
100
1.9
100
94
0
333
30
19
23
26
1.98
13629693--13630122
236
1.8
235
90
1
700
30
21
23
24
1.98
13630327--13630450
45
2.8
45
86
2
151
29
24
24
21
1.99
13664850--13664927
34
2.3
34
79
0
93
44
14
17
23
1.85
13665776--13665862
42
2.1
42
100
0
174
42
12
19
25
1.86
13668354--13668418
19
3.2
19
68
16
58
16
29
29
24
1.97
13669550--13669631
22
3.8
22
73
14
64
29
4
1
64
1.22
13670358--13670404
20
2.3
20
100
0
94
42
19
12
25
1.86
13671894--13671946
23
2.2
24
77
9
56
47
11
20
20
1.81
13689823--13689862
18
2.2
18
86
4
53
12
27
0
60
1.33
13690927--13690963
14
2.6
14
95
0
65
21
13
5
59
1.54
13691004--13691058
12
4.6
12
80
6
58
16
1
5
76
1.06
13691002--13691058
24
2.4
24
88
5
80
17
1
5
75
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13701184--13701220
3
12.3
3
94
0
65
2
32
0
64
1.07
13702354--13702416
28
2.1
29
82
8
74
20
14
11
53
1.70
13704490--13704542
4
13.2
4
95
0
97
26
0
0
73
0.83
13706576--13706635
22
2.7
23
73
19
63
66
6
0
26
1.16
13706585--13706618
4
8.0
4
90
9
50
73
2
0
23
0.97
13707971--13708023
23
2.4
22
76
20
56
9
18
1
69
1.25
13732281--13732442
25
6.6
25
70
15
77
32
19
25
22
1.97
13732478--13732529
24
2.2
24
85
0
68
38
19
23
19
1.93
13739871--13740034
25
6.7
24
73
10
107
34
18
27
19
1.96
13739849--13740034
49
3.8
49
74
12
159
34
18
26
19
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221