Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  64892201

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   

This is table  44  of  221  ( 26413 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.88
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2.1
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1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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16
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0
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20
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2
1
31
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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(0-2)
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1.13
12580345--12580434
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0
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25
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1.98
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126
2.5
126
84
3
402
27
24
17
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12601493--12601626
44
3.1
43
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18
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29
24
1.98
12601646--12601873
44
5.2
44
63
14
110
19
23
29
27
1.98
12601725--12601854
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45
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113
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0
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18
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5
65
63
0
0
36
0.94
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21
2.4
21
83
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59
66
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0
32
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1.34
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22
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17
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1.66
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2.0
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30
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1.38
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234
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1.62
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14
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55
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12
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129
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0
15
17
1.25
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24
2.2
24
90
0
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18
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1.93
12623764--12623809
7
6.6
7
97
0
83
41
10
30
17
1.84
12623785--12623907
51
2.4
51
95
0
219
33
14
22
29
1.94
12630000--12630283
142
2.0
142
99
0
559
38
10
15
35
1.82
12634231--12634375
23
6.2
23
85
3
191
27
13
19
40
1.88
12634231--12634386
71
2.2
69
84
4
179
28
13
19
38
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12639092--12639141
22
2.4
22
86
6
77
22
10
18
50
1.76
12640602--12640849
50
4.8
51
80
7
236
24
27
20
27
1.99
12642333--12642357
13
1.9
13
100
0
50
32
4
24
40
1.73
12643467--12643592
43
2.9
42
79
14
141
22
19
27
30
1.97
12645307--12645650
102
3.4
101
88
2
478
29
15
25
29
1.96
12645307--12645649
51
6.8
50
79
5
368
28
16
25
29
1.96
12647584--12647729
23
6.2
22
81
10
123
28
12
18
40
1.87
12647582--12647705
47
2.6
48
83
7
146
29
12
16
41
1.85
12647686--12647738
23
2.3
23
96
0
97
22
15
26
35
1.93
12654211--12654311
43
2.3
43
83
3
123
37
21
18
21
1.94
12654339--12654520
42
4.4
41
71
8
143
36
18
19
25
1.94
12656412--12656468
11
5.2
11
74
16
55
54
1
1
42
1.21
12662573--12662636
33
1.9
34
87
6
96
43
17
4
34
1.69
12663530--12663607
23
3.5
22
94
5
138
20
8
26
43
1.81
12664794--12664975
95
1.9
96
94
1
321
49
6
7
36
1.58
12664794--12664975
48
3.8
48
94
1
321
49
6
7
36
1.58
12668154--12668362
92
2.3
91
86
5
278
45
3
3
46
1.39
12668290--12668337
26
1.9
25
84
16
64
45
0
2
52
1.12
12668505--12668556
15
3.6
15
80
12
56
44
0
1
53
1.11
12668378--12668677
120
2.5
122
89
7
452
42
3
4
49
1.40
12668634--12668675
15
2.7
16
82
14
52
45
0
2
52
1.13
12668625--12668666
15
2.9
15
82
10
52
47
0
0
52
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12668609--12668922
157
2.0
154
93
1
529
47
4
3
45
1.38
12668778--12668812
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
12669045--12669080
16
2.2
16
95
0
63
38
33
0
27
1.57
12671367--12671423
28
2.0
28
100
0
114
36
7
14
42
1.72
12673951--12674113
50
3.3
50
88
1
247
25
22
30
21
1.99
12673951--12674134
50
3.7
50
86
1
244
25
21
30
22
1.99
12673955--12674183
49
4.6
49
81
5
151
26
20
29
22
1.99
12674386--12674428
20
2.2
20
87
8
61
58
2
27
11
1.46
12678603--12678637
17
2.0
18
88
5
54
14
42
25
17
1.86
12683611--12683647
18
2.1
19
90
10
60
29
13
0
56
1.37

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221