Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  64473564

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   

This is table  190  of  213  ( 25468 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57161854--57161930
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2.3
33
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1.98
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1.65
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82
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1.94
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0
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21
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27
1.99
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1
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39
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0
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21
25
26
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0
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0
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10.1
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1448
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14
16
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528
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1.84
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2.0
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30
0
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7
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15
0
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1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
26
88
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2.2
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12
0
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32
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14
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17
94
0
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1.58
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21
2.2
22
92
3
78
21
19
38
21
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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6
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2.0
22
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2.0
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1.98
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30
21
21
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2.0
218
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19
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1.97
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17
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0
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12
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1.80
57272265--57272314
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2.1
24
88
0
73
34
20
2
44
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57282323--57282383
5
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1
0
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52
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1
0
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2.0
31
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25
3
0
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1.02
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0
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4
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0.95
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2.3
20
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17
1.06
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0
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12
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1.80
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15
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23
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0
17
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138
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139
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0
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0
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19
19
1.96
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23
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14
390
22
18
23
35
1.96
57353022--57353215
57
3.6
57
79
12
253
20
17
25
37
1.94
57352978--57353272
105
2.8
104
93
2
479
22
18
23
36
1.95
57353235--57353311
39
2.0
39
97
0
145
22
23
20
33
1.97
57355947--57355985
20
2.0
20
89
0
60
15
17
28
38
1.91
57356311--57356395
38
2.2
39
87
2
127
27
12
20
40
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57357857--57357893
2
18.5
2
100
0
74
48
0
51
0
1.00
57361236--57361466
48
4.8
48
84
2
284
35
17
20
25
1.95
57361430--57361505
39
1.9
39
94
0
134
30
18
27
23
1.98
57365757--57365824
4
16.5
4
73
19
52
22
4
0
73
1.01
57365763--57365824
17
3.8
16
80
14
65
22
4
0
72
1.03
57368642--57368885
48
4.9
48
79
9
247
34
22
19
22
1.96
57368501--57368840
105
3.3
103
87
2
443
36
22
18
22
1.95
57369021--57369123
53
1.9
53
92
0
170
49
12
0
37
1.41
57371212--57371262
2
25.5
2
100
0
102
0
50
0
49
1.00
57372724--57372808
38
2.2
38
87
2
125
40
20
12
27
1.89
57390107--57390131
2
12.5
2
100
0
50
52
0
48
0
1.00
57390306--57390442
57
2.4
56
78
6
141
24
21
11
43
1.85
57407415--57407650
68
3.4
70
83
4
266
25
19
17
37
1.94
57407415--57407650
69
3.4
70
83
4
257
25
19
17
37
1.94
57408164--57408204
21
2.0
21
85
4
57
24
29
17
29
1.97
57414161--57414280
43
2.8
43
75
13
129
25
21
25
27
1.99
57421518--57421553
10
3.8
9
92
7
54
88
8
2
0
0.59
57421518--57421555
9
3.8
10
89
10
60
86
10
2
0
0.66
57421584--57421661
27
2.9
27
90
0
111
26
25
30
16
1.97
57422080--57422108
14
2.1
14
100
0
58
55
0
6
37
1.27
57422935--57422963
14
2.1
14
100
0
58
37
6
0
55
1.27
57423458--57423503
12
3.8
12
81
18
51
2
2
10
84
0.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57423459--57423498
16
2.5
15
88
4
53
2
2
7
87
0.71
57428525--57428657
62
2.1
62
98
0
257
30
19
7
42
1.79
57430436--57430478
22
1.9
23
85
4
61
18
18
9
53
1.70
57450960--57451019
30
2.0
31
83
3
77
40
0
41
18
1.50
57458942--57459004
30
2.1
31
82
11
78
39
0
7
52
1.31
57465973--57466062
42
2.2
43
88
6
132
16
21
17
44
1.87
57467892--57467980
45
2.0
45
90
0
142
33
23
16
25
1.96
57467982--57468177
51
3.9
50
81
4
223
30
28
16
23
1.97
57467989--57468173
101
1.8
101
90
3
300
30
28
17
23
1.97
57473281--57473397
20
6.0
19
66
14
60
61
0
5
32
1.24

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213