Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  64473564

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   

This is table  84  of  213  ( 25468 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22999301--22999341
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2.3
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0
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18
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2
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1.57
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0
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21
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2.1
37
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0
0
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0
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2.0
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14
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23045950--23046245
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2.9
102
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25
14
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1.95
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1.9
152
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25
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100
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18
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19
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1.9
13
100
0
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40
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0
52
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.9
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17
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1.97
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20
3.3
20
65
12
55
25
13
34
25
1.93
23064572--23064727
79
2.0
80
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226
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17
29
23
1.97
23081396--23081459
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2.6
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5
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4
46
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2.1
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7
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20
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1.9
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86
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2.0
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19
1.75
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2.1
30
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115
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11
19
1.72
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2.0
154
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7
32
1.71
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2.2
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2.4
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1.86
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2.0
214
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1.9
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85
0
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0
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0.96
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2.0
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100
0
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21
43
1.86
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2.4
29
95
0
133
25
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14
49
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0
0
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17
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0
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1.34
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2.0
29
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71
50
10
10
29
1.70
23132786--23132858
33
2.2
33
88
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105
30
8
15
46
1.74
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10
8.2
9
73
22
63
34
16
27
21
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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2
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17
29
22
1.97
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2.1
70
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3
185
44
17
9
28
1.80
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41
2.9
41
92
2
191
33
25
18
22
1.97
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2.1
18
100
0
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10
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81
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11
31
1.74
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333
45
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11
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1.76
23148855--23149167
163
1.9
164
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413
46
11
10
31
1.74
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45
11
11
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1.76
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41
12
13
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1.82
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2
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16
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12
33
1.76
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40
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21
21
1.96
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1.73
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18
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23
1.74
23150372--23150438
27
2.5
27
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116
46
23
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1.74
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20
4.8
20
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39
1
3
56
1.22
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18
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19
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48
2
0
50
1.12
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21
2.2
21
85
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50
0
0
50
1.00
23163130--23163191
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19
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1
0
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1.10
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0
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32
18
18
30
1.95
23170528--23170578
15
3.4
15
74
15
52
52
15
5
25
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23171902--23171947
14
3.2
14
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14
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2
0
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1.03
23171892--23171947
29
2.0
29
82
3
69
35
1
0
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1.06
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31
1.9
31
85
3
82
43
12
5
39
1.64
23176026--23176087
16
3.9
16
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0
79
43
6
19
30
1.76
23176017--23176080
32
2.0
32
84
0
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43
4
20
31
1.72
23176329--23176377
21
2.3
21
86
13
66
59
2
2
36
1.21
23180609--23180636
13
2.2
13
100
0
56
28
7
28
35
1.84
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11
2.3
11
100
0
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16
36
1.77
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20
2.8
20
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54
0
0
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5.6
11
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15
54
55
0
0
44
0.99
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2.0
20
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14
55
55
17
2
25
1.55
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21
1.9
21
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10
64
37
0
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7
1.29
23196855--23196912
21
2.7
20
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12
53
34
0
58
6
1.25
23197256--23197527
69
4.0
69
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1
332
19
23
25
31
1.98
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40
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12
130
26
17
21
33
1.96
23213417--23213453
20
2.0
20
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51
70
0
5
24
1.08
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19
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19
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0
73
65
2
0
31
1.05
23213415--23213513
52
1.9
52
85
4
137
67
2
5
25
1.21
23213480--23213541
19
3.3
19
80
13
58
64
4
1
29
1.23
23213469--23213591
9
12.7
9
66
19
52
67
2
3
26
1.18
23214174--23214230
29
1.9
30
86
10
82
31
7
1
59
1.34
23214327--23214384
18
3.2
18
78
4
62
25
1
5
67
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23214250--23214377
27
4.6
27
71
15
84
28
3
4
63
1.30
23214297--23214384
9
9.6
9
72
13
54
25
3
4
67
1.26
23214930--23215053
9
12.7
10
68
17
57
56
0
6
36
1.31
23214883--23214983
19
5.4
18
70
16
64
62
3
3
29
1.31
23214868--23215056
20
9.8
19
67
16
70
57
2
5
34
1.37
23214868--23214996
65
1.9
66
83
7
163
60
3
3
31
1.33
23220991--23221056
33
2.1
32
91
5
107
21
22
15
40
1.90
23220842--23221175
173
1.9
174
90
1
537
21
25
11
41
1.87
23227410--23227489
10
7.8
10
79
6
72
61
0
3
35
1.14
23229831--23229912
29
2.8
29
81
7
76
59
1
1
37
1.13
23229831--23229912
30
2.7
30
74
12
62
59
1
1
37
1.13
23231975--23232078
26
4.0
26
82
0
109
22
14
33
29
1.93
23234781--23234807
13
2.1
13
100
0
54
29
40
22
7
1.81
23235714--23235755
22
2.0
22
85
4
59
16
19
11
52
1.74
23238291--23238321
11
2.7
11
95
5
53
58
6
0
35
1.24
23248462--23248520
25
2.4
25
82
0
73
62
15
11
10
1.54
23248484--23248532
20
2.5
20
82
0
62
61
16
14
8
1.56
23248507--23248577
15
4.7
15
75
0
52
59
14
14
12
1.62
23248464--23248650
30
6.4
30
69
9
91
57
14
16
11
1.65
23248464--23248586
25
4.7
25
69
16
70
57
15
14
12
1.65
23248594--23248725
55
2.4
55
84
2
158
60
12
18
8
1.56
23248689--23248780
15
6.2
15
72
6
62
60
14
17
7
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23251497--23251537
21
2.0
21
85
9
57
73
2
4
19
1.13
23268038--23268138
27
3.7
27
80
6
98
27
14
25
31
1.95
23282852--23282898
13
3.5
13
80
13
51
19
14
14
51
1.77
23290541--23290582
17
2.5
17
80
7
50
33
4
0
61
1.17
23296227--23296351
61
2.0
62
87
1
180
46
16
2
35
1.60
23302861--23302907
3
15.7
3
100
0
94
34
0
0
65
0.93
23303342--23303434
46
2.0
46
93
0
159
20
18
17
44
1.87
23310055--23310094
21
1.9
21
94
0
71
60
0
0
40
0.97
23310055--23310103
11
4.3
12
75
19
52
59
0
0
40
0.98
23310056--23310132
22
3.5
22
73
8
59
55
0
2
41
1.13

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213