Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  64473564

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   

This is table  76  of  213  ( 25468 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20604580--20604620
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2.0
20
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0
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2.0
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23
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100
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2.0
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18
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23
2.0
25
88
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73
14
16
16
52
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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26
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2.0
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53
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27
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3
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1.24
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1.16
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28
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1.98
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2.1
23
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35
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58
1.23
20846176--20846334
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23
15
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1.93
20848869--20848920
24
2.2
24
89
0
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55
9
1
32
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
24
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32
1.43
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17
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51
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0
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31
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0
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1.83
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35
73
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25
16
16
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1.89
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31
1.97
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32
0
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64
1.09
20940490--20940561
27
2.7
27
73
0
81
26
34
30
8
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20940593--20940692
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3
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1
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75
11
199
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4
11
49
1.60
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2.6
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11
122
33
3
10
52
1.54
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5.9
153
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1249
31
9
7
51
1.63
20944806--20945717
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3.0
301
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1273
31
9
7
51
1.63
20945497--20945532
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4.2
8
86
13
54
27
2
0
69
1.02
20945578--20945815
130
1.8
131
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3
318
29
11
6
52
1.63
20945960--20946014
26
2.1
27
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56
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3
32
1.44
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10
13.2
10
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0.97
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3.8
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0
32
0
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0.97
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13.2
10
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16
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0
32
0
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0.97
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0
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0
17
0
0.66
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0
0
31
0.90
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0
7
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44
12.8
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15
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134
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0
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21
15
31
1.95
20953750--20954323
45
12.9
45
81
1
413
31
21
15
31
1.95
20961019--20961044
4
6.5
4
100
0
52
76
0
0
23
0.78
20961284--20961316
3
11.0
3
93
0
57
63
0
3
33
1.10
20962291--20962733
99
4.5
99
86
0
564
22
20
24
32
1.98
20962439--20962718
50
5.7
49
66
5
168
20
21
25
32
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20975144--20975176
3
11.0
3
93
0
57
63
0
3
33
1.10
20983281--20983315
11
3.1
11
91
4
52
82
0
8
8
0.83
20995978--20996091
58
2.0
58
96
3
212
38
15
21
24
1.92
21005858--21005890
14
2.4
14
90
5
50
66
3
9
21
1.33
21013592--21013646
15
3.8
15
85
2
69
1
21
1
74
1.01
21017816--21018373
47
11.7
47
94
1
911
32
8
29
29
1.87
21017837--21018373
288
1.9
284
93
2
932
32
8
29
29
1.87
21018492--21018570
37
2.1
37
90
0
122
24
18
31
25
1.98
21019699--21019875
96
1.9
95
87
3
266
28
22
19
29
1.98
21019699--21020183
45
10.6
45
73
8
187
28
21
16
32
1.96
21019800--21020196
44
8.8
44
74
8
183
29
21
17
32
1.96
21019699--21019889
95
2.0
96
85
3
260
28
21
18
31
1.97
21019850--21020197
89
3.8
89
75
8
225
29
21
16
32
1.95
21020033--21020155
45
2.7
45
93
0
210
27
22
18
30
1.97
21029509--21029667
45
3.5
46
83
4
182
35
27
13
23
1.93
21029547--21029712
90
1.8
90
87
2
244
36
24
14
25
1.93
21029547--21029701
45
3.4
45
82
0
184
36
23
15
24
1.94
21030046--21030115
30
2.4
29
73
7
70
35
21
5
37
1.77
21032120--21032163
23
1.9
23
81
9
54
36
9
20
34
1.84
21032814--21032999
41
4.5
41
96
0
336
28
20
27
23
1.99
21036534--21036765
40
5.8
40
93
1
324
26
28
21
24
1.99
21043106--21043131
7
3.7
7
100
0
52
15
0
69
15
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21046800--21046843
5
9.2
5
81
18
58
40
15
20
22
1.90
21046790--21046843
9
5.8
9
79
18
58
40
14
20
24
1.90
21050492--21050525
4
8.2
4
96
3
59
73
0
0
26
0.83
21052444--21052499
17
3.2
17
87
2
76
55
14
3
26
1.55
21054452--21054486
18
1.9
18
100
0
70
45
14
0
40
1.45
21057756--21057843
44
2.0
44
95
0
158
57
5
18
18
1.59
21058756--21058789
17
2.0
17
100
0
68
23
35
5
35
1.79
21070482--21070665
101
1.8
101
89
2
289
34
15
22
27
1.95
21070488--21070631
33
4.3
33
68
8
94
35
17
20
27
1.94
21076069--21076235
30
5.5
30
74
4
138
26
26
10
36
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213