Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  64473564

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   

This is table  72  of  213  ( 25468 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19460628--19460826
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102
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0
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2.5
26
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24
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0
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2
0
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1.13
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2.6
16
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26
1.51
19464119--19464177
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3.9
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4
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52
1
11
33
1.48
19464121--19464183
30
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3
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0
0
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0
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535
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10
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1
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25
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19472598--19472651
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52
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0
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0
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0
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0
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115
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2.5
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9
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0
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57
0
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0
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19515613--19515653
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0
0
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15
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2.0
15
93
0
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6
26
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63
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4
9
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72
1.26
19522820--19522965
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2.0
73
95
0
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29
11
25
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1.91
19522839--19522983
73
2.0
73
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1
193
35
10
21
33
1.87
19526722--19526764
19
2.2
20
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4
20
1.46
19526760--19527637
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27
0
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1.49
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27
2.0
26
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10
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38
0
11
50
1.38
19535188--19535220
16
2.1
16
88
11
50
39
18
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36
1.75
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27
3.0
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1
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20
14
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2.0
169
92
0
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21
28
20
1.98
19559760--19559801
15
2.7
16
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14
52
52
2
0
45
1.13
19559769--19559810
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15
82
10
52
52
0
0
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1.00
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0
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1
0
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1.09
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3.4
120
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5
2
42
1.38
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2.2
28
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81
51
3
0
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1.17
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2.3
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0
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0
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1.00
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1.9
13
100
0
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20
16
8
56
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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100
0
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0
0
67
0.91
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3.0
50
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1
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3.3
33
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125
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1.78
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0
0
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44
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156
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0
0
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0
1
54
1.10
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2.0
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27
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0
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1.56
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221
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0
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0
0
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1.14
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21
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0
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1.10
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0
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0
0
0.98
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2.0
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1.36
19622630--19622670
22
1.9
22
95
5
75
46
2
7
43
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19622651--19622828
71
2.5
69
78
9
191
43
4
16
35
1.69
19622807--19622979
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2.0
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83
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215
33
9
20
36
1.85
19622971--19623026
19
2.8
20
86
10
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48
5
7
39
1.54
19629552--19629708
43
3.7
42
79
11
187
23
18
28
29
1.98
19629553--19629708
84
1.9
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85
10
221
23
17
28
29
1.97
19632922--19633098
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2.6
68
81
7
207
41
6
19
32
1.76
19635038--19635075
8
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100
0
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0
0
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0
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0
0
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12
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67
0
3
29
1.07
19648331--19648398
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13
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20
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0
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27
1.03
19649005--19649048
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22
100
0
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4
13
31
1.62
19649456--19649513
29
2.0
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55
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5
15
1.61
19662376--19662417
20
2.1
20
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59
71
4
0
23
1.05
19664453--19664485
8
4.1
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100
0
66
51
0
24
24
1.48
19667046--19667110
30
2.1
31
85
2
87
35
10
7
46
1.68
19667405--19667453
25
1.9
26
84
12
66
67
4
2
26
1.19
19673575--19673682
21
5.1
21
87
0
153
40
17
25
16
1.90
19677565--19677693
37
3.5
37
85
3
154
37
17
16
27
1.91
19681006--19681047
19
2.3
19
83
4
50
40
9
19
30
1.83
19683820--19683861
18
2.3
19
91
4
68
64
2
2
30
1.19
19683792--19683843
28
1.9
28
84
7
72
57
3
5
32
1.40
19684092--19684120
14
2.0
15
93
6
51
62
0
0
37
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19684174--19684220
19
2.5
19
75
3
51
31
4
6
57
1.43
19684495--19684565
20
3.7
20
70
24
53
40
2
1
54
1.23
19684500--19684584
38
2.2
38
77
6
91
36
4
2
56
1.33
19685021--19685098
20
4.1
19
78
6
77
41
2
0
56
1.13
19685021--19685066
19
2.3
20
85
3
58
50
2
0
47
1.13
19689145--19689185
9
4.4
9
84
6
55
29
0
0
70
0.87
19689194--19689259
31
2.1
31
88
0
96
24
25
18
31
1.97
19689884--19689956
31
2.4
30
80
10
78
52
1
4
42
1.29
19700436--19700463
6
4.7
6
100
0
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0
0
32
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14
2.0
15
93
6
51
68
0
17
13
1.20
19730312--19730350
20
1.9
21
85
15
55
33
7
2
56
1.41
19741998--19742104
52
2.1
52
92
0
178
25
22
15
36
1.94
19752550--19752587
19
1.9
20
89
10
60
34
7
0
57
1.28
19752983--19753031
22
2.4
20
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10
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42
14
10
32
1.79
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3
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3
100
0
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0
32
0
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2.4
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2
4
46
1.33
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6
5.8
6
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10
54
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0
0
31
0.90
19758542--19758566
11
2.3
11
100
0
50
68
0
0
32
0.90
19758540--19758573
17
1.9
18
94
5
61
67
0
0
32
0.91
19762841--19762889
19
2.5
20
78
15
57
40
0
6
53
1.26
19763149--19763189
21
2.0
21
85
9
57
53
4
0
41
1.22
19763201--19763257
23
2.5
23
81
13
73
50
1
0
47
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19763201--19763255
11
4.8
11
81
14
67
50
1
0
47
1.11
19765795--19765843
20
2.5
20
80
6
55
44
14
10
30
1.78
19766361--19766425
28
2.2
30
76
15
73
20
1
10
67
1.28
19770595--19770638
3
15.7
3
78
21
51
63
2
0
34
1.07
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20
1.9
20
100
0
76
65
2
0
31
1.06
19770589--19770671
10
8.4
9
75
17
60
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1
3
27
1.15
19774202--19774256
27
2.0
28
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25
27
21
25
2.00
19774709--19774747
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19774813--19774881
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15
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9
3.0
9
100
0
54
66
0
0
33
0.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213