Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_D02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  67659327

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   

This is table  202  of  216  ( 25871 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62764222--62764310
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12
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12
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1
1
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1.04
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2.2
28
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1
0
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1.03
62764205--62764258
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3.4
17
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69
33
1
0
64
1.04
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2.0
98
94
0
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1.89
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2.0
27
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3
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3
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1.45
62767644--62767733
19
4.8
19
84
10
116
37
16
7
37
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62767670--62767732
21
3.1
21
88
9
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3.5
132
95
0
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1.99
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2.0
98
93
0
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36
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2.0
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1.46
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16
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37
1.78
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3.1
21
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9
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38
1.75
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35
3.7
35
68
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95
29
24
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22
1.99
62779160--62779331
75
2.3
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224
27
22
25
24
1.99
62781306--62781402
37
2.6
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1.87
62781387--62781443
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2.8
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17
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1.87
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24
2.0
24
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0
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20
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1.9
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2
15
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1.61
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87
4
58
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0
2
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2.3
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0
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33
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1.88
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21
2.2
21
92
4
74
51
17
6
24
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62810497--62810543
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2.5
19
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10
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51
2
0
46
1.13
62810509--62810656
68
2.1
70
80
6
158
47
8
6
38
1.58
62810666--62810706
16
2.7
15
85
10
57
65
2
2
29
1.18
62810871--62810910
14
2.7
15
81
18
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62
5
0
32
1.17
62813959--62813999
19
2.1
20
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4
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56
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1.45
62824582--62824650
16
4.2
16
94
3
120
39
37
0
23
1.55
62824582--62824650
33
2.1
32
94
2
120
39
37
0
23
1.55
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17
1.9
18
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58
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14
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1.63
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0
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0
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1.52
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0
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1.41
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13
3.2
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0
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62841503--62841562
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0
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1.9
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40
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50
0
0
50
1.00
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4.4
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224
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17
26
30
1.97
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20
2.6
20
78
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61
38
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5
46
1.61
62857808--62857892
25
3.3
25
80
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91
30
22
28
18
1.97
62857915--62857969
24
2.2
25
87
3
76
36
21
21
20
1.95
62857907--62857969
24
2.6
24
82
5
74
39
20
20
19
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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30
21
1.97
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43
2.6
43
85
0
145
24
23
23
28
2.00
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4.3
42
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11
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25
29
19
25
1.99
62859074--62859260
86
2.2
86
81
3
207
25
29
19
25
1.98
62865114--62865200
9
10.3
9
75
14
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33
3
19
43
1.68
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18.7
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3
16
44
1.65
62865114--62865200
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3.5
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33
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19
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15
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1.61
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1.67
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1.60
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0
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1.45
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0
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1
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1.60
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1.40
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5
42
1.48
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12
3.3
12
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57
12
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22
1.60
62867527--62867552
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100
0
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57
11
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23
1.59
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2.1
17
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54
31
5
2
60
1.35
62868831--62868971
7
20.1
7
77
9
74
34
48
1
15
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62868829--62868857
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1.9
15
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0
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41
0
20
1.53
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20
70
14
63
37
46
0
15
1.51
62868923--62868995
13
5.5
13
76
11
67
34
46
1
17
1.57
62868864--62868995
7
19.1
7
71
18
55
37
46
0
15
1.51
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22
14
21
1.89
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11
2.8
12
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18
50
53
0
21
25
1.46
62875102--62875143
18
2.3
18
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0
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30
11
30
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1.92
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59
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2
1
64
1.15
62886486--62886540
28
2.0
28
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23
12
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54
1.66
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2.7
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13
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21
22
27
1.99
62904322--62905172
44
19.6
43
71
12
426
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19
23
27
1.98
62904308--62905303
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4.6
217
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0
1526
28
20
22
28
1.98
62905650--62905676
5
5.4
5
100
0
54
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0
18
1.32
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20
2.5
20
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59
23
1
1
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1.05
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5
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20
23
28
28
1.99
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27
2.1
27
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0
76
58
1
7
32
1.35
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23
2.2
22
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10
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6
4
22
1.29
62914859--62914974
44
2.7
42
83
11
146
22
19
30
27
1.98
62914860--62914974
43
2.7
42
83
14
137
22
20
29
27
1.98
62915772--62915817
23
2.0
23
83
8
58
39
6
17
36
1.76
62920161--62920223
24
2.8
22
75
24
69
39
20
1
38
1.62
62920161--62920204
12
3.7
12
87
6
63
40
18
2
38
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62931536--62931570
15
2.3
15
90
0
52
8
14
20
57
1.63
62943416--62943470
26
2.4
22
76
23
67
5
30
3
60
1.37
62943424--62943477
26
2.1
26
100
0
108
7
25
3
62
1.38
62948127--62948328
50
4.1
50
87
6
247
28
24
16
30
1.97
62953301--62953325
13
1.9
13
100
0
50
32
4
8
56
1.47
62953425--62953673
50
4.8
50
80
8
216
27
21
28
22
1.99
62953425--62953674
100
2.4
103
79
9
242
27
21
28
22
1.99
62956594--62956637
23
2.0
22
86
4
61
54
4
0
40
1.21
62956911--62956964
25
2.0
28
82
10
69
35
0
0
64
0.94
62959564--62959609
16
2.7
18
77
16
53
43
0
4
52
1.21
62975333--62975366
17
2.0
17
88
0
50
55
2
11
29
1.50
62977318--62978331
132
7.7
131
90
1
1438
29
23
17
29
1.97
62977362--62978127
44
17.4
44
65
9
157
29
23
16
30
1.96
62979131--62979155
13
1.9
13
100
0
50
56
8
24
12
1.62
62985435--62985460
13
2.0
13
100
0
52
46
15
7
30
1.74
63002663--63002695
16
2.1
16
100
0
66
24
0
36
39
1.56
63002934--63002968
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
63002828--63003137
157
2.0
157
97
0
584
44
2
4
48
1.38
63003071--63003112
15
2.7
16
82
14
52
52
2
0
45
1.13
63003080--63003123
15
3.1
15
83
9
56
52
0
0
47
1.00
63003130--63003327
66
3.2
63
67
22
168
49
6
3
40
1.44
63003181--63003241
15
4.4
14
76
15
56
57
1
0
40
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63003069--63003364
119
2.5
121
92
5
494
50
5
2
42
1.37
63003330--63003363
17
2.0
17
88
11
52
52
0
2
44
1.16
63003302--63003377
28
2.9
27
70
21
70
56
0
2
40
1.13
63003394--63003586
91
2.1
92
86
2
264
47
3
4
45
1.39
63003429--63003567
47
3.0
46
69
17
126
50
2
2
43
1.31
63004999--63005025
11
2.5
11
100
0
54
51
18
7
22
1.70
63007264--63007293
15
2.0
15
93
0
51
46
10
10
33
1.71
63013343--63013384
16
2.6
17
81
11
52
2
28
4
64
1.26
63015309--63015367
19
3.1
19
78
9
66
52
0
1
45
1.10
63016495--63016541
23
2.0
23
95
0
85
23
8
25
42
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216