Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_D02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  67659327

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   

This is table  55  of  216  ( 25871 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16209262--16209317
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2.0
28
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0
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1.55
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18
2.1
18
90
0
58
28
2
13
55
1.51
16218515--16218555
17
2.3
18
84
12
50
43
0
12
43
1.41
16218513--16218556
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18
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25
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21
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1.99
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129
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0
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25
24
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1.98
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15
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11
11
0
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1.00
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16223864--16223927
10
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2.3
18
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52
40
0
15
43
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16228242--16228268
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1.99
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100
0
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0
0
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2.2
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16
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140
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6.5
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16258162--16258234
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3.6
19
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15
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63
19
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16
1.39
16258341--16258383
20
2.2
20
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52
39
4
9
46
1.57
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1.9
30
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20
52
34
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0
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1.26
16259177--16259231
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3.4
16
71
14
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47
0
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49
1.19
16272916--16273180
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9.8
27
79
6
232
24
25
8
41
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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17
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1.9
56
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1.95
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2.0
33
90
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0
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78
0
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2
0.87
16288312--16288348
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56
78
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2.0
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18
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1.91
16304164--16304234
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2.4
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1.91
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0
0
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0
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1.93
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2.1
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1.75
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21
14
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1.93
16349897--16350152
92
2.8
92
92
1
428
28
21
14
35
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16361978--16362051
37
2.0
37
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0
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27
1.82
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2.5
13
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5
57
18
6
9
66
1.40
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2.0
298
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21
26
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1.99
16373411--16373461
18
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18
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59
21
3
0
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0.98
16373415--16373461
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0
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25
3
0
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1.02
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11
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11
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0
0
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1.00
16377740--16377789
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2.2
22
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46
0
0
54
1.00
16377779--16377817
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15
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11
53
41
2
0
56
1.13
16377825--16377862
15
2.5
15
95
0
67
73
5
0
21
1.02
16377976--16378014
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1.9
21
94
5
71
30
25
10
33
1.89
16378309--16378367
20
3.0
21
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1
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1.43
16378309--16378367
19
3.1
19
90
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91
38
1
8
50
1.43
16378414--16378454
21
2.0
21
85
0
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36
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1.76
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0
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1.76
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389
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0
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12
35
1.88
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24
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91
38
0
0
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12
2.2
12
100
0
52
26
15
26
30
1.96
16408426--16408490
34
1.9
34
96
0
121
50
4
20
24
1.66
16412965--16413022
22
2.6
22
100
0
116
24
22
15
37
1.93
16417573--16417601
13
2.2
13
100
0
58
48
6
0
44
1.29
16417499--16417653
56
2.8
56
85
0
211
43
15
7
33
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16421145--16421302
57
2.8
56
92
1
262
43
16
8
31
1.78
16428391--16428526
29
4.6
29
72
7
96
39
19
13
27
1.89
16433954--16434021
32
2.1
32
86
0
91
41
5
7
45
1.56
16436161--16436495
87
3.8
86
79
2
373
22
25
13
38
1.90
16436161--16436473
29
10.8
29
80
4
326
21
25
13
38
1.91
16437872--16438027
73
2.1
74
90
1
242
41
10
25
21
1.86
16446310--16446491
97
1.9
97
91
2
303
34
22
9
32
1.87
16451226--16451258
17
2.1
17
88
11
52
54
9
0
36
1.32
16452270--16452317
21
2.3
20
82
6
60
6
4
20
68
1.28
16452276--16452317
21
2.0
21
90
0
66
4
2
21
71
1.16
16452499--16452540
21
2.0
21
100
0
84
38
19
0
42
1.51
16453349--16453428
20
3.9
20
71
15
65
31
18
35
15
1.92
16458311--16458814
126
4.0
126
94
0
891
36
16
17
29
1.92
16468959--16469029
35
2.0
35
91
0
115
30
29
8
30
1.87
16473998--16474048
26
2.0
26
88
0
75
27
17
19
35
1.94
16474109--16474166
29
2.0
29
89
0
89
24
13
22
39
1.90
16476060--16476099
6
6.7
6
91
0
62
55
0
25
20
1.44
16483599--16483638
6
6.7
6
85
0
53
52
0
25
22
1.47
16483780--16483840
26
2.3
26
82
0
77
44
14
11
29
1.81
16488760--16491271
836
3.0
836
99
0
4972
30
15
21
33
1.94
16495166--16495209
22
2.0
23
82
13
56
6
18
4
70
1.27
16495176--16495219
22
2.0
23
82
13
56
6
20
0
72
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16496050--16496105
10
6.2
9
80
10
53
21
1
3
73
1.08
16497470--16497504
16
2.2
16
89
0
52
22
14
20
42
1.88
16500034--16500060
12
2.2
12
100
0
54
14
7
7
70
1.32
16500757--16500810
8
7.2
8
80
16
55
75
11
0
12
1.04
16500743--16500811
22
3.2
20
82
11
68
73
11
0
14
1.09
16500743--16500811
14
5.4
14
75
22
71
73
11
0
14
1.09
16500831--16500865
6
5.7
6
86
6
52
80
0
20
0
0.72
16502135--16502625
88
5.6
88
93
0
752
29
21
25
23
1.99
16502819--16503002
50
3.7
49
69
8
129
28
19
27
24
1.98
16502823--16503019
100
2.0
101
88
1
297
27
20
26
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216