Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_D08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  65987480

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   

This is table  6  of  211  ( 25274 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2052484--2052508
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0
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18
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10
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2.0
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2.0
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1.80
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2.5
46
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5
137
33
21
19
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2095347--2095878
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21
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1.98
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2.4
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231
29
20
24
25
1.99
2095561--2095881
129
2.5
128
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403
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22
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0
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0
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2.0
23
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25
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2.9
80
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303
19
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1.98
2107771--2108005
123
1.9
123
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346
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24
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123
2.2
123
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2
304
21
25
24
28
1.99
2110928--2111089
87
1.9
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5
256
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2111076--2111133
21
2.8
20
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43
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208
22
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1.99
2115667--2115703
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2.4
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48
0
0
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1.00
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2115892--2115925
16
2.1
16
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1.09
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2.5
39
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20
23
28
27
1.99
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39
2.2
40
82
5
110
55
5
1
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1.31
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16
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13
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35
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13
14
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1.84
2120760--2121024
132
2.0
132
99
0
521
25
19
24
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
21
90
0
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25
16
1.88
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20
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20
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20
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12
52
16
23
0
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18
2.0
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50
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0
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0
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0
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0
0
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29
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5
0
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1.22
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0
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1
31
1.23
2157439--2157508
30
2.4
31
80
9
83
62
4
1
31
1.23
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29
2.2
30
83
2
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46
10
4
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1.60
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22
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0
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0
0
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100
0
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0
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1.44
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24
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21
28
28
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1.99
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153
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215
20
20
17
41
1.91
2176605--2176753
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2.2
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21
20
18
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19
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14
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0
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3.4
13
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0
4
50
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2188442--2188467
3
8.7
3
100
0
52
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0
0
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0.93
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11.0
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100
0
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0
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16
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35
0
0
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2.3
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81
9
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41
0
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1.29
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14
2.4
14
95
0
59
47
0
14
38
1.45
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12.7
3
94
5
69
64
0
0
35
0.94
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30
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2
75
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14
13
37
1.85
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30
2.0
31
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77
45
10
11
33
1.74
2231915--2231948
17
1.9
18
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5
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5
2
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1.39
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25
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23
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62
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0
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1.24
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2.1
31
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0
0
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20
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19
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0
0
65
0.93
2244058--2244096
6
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6
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11
51
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0
0
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2.4
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0
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61
1.14
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35
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84
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35
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0
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14
17
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16
16
37
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23
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94
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1
1
48
1.20
2273130--2273170
16
2.6
16
96
0
73
46
2
4
46
1.37
2273236--2273339
44
2.4
44
100
0
208
44
6
2
46
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2276398--2276464
34
2.0
34
96
0
125
44
23
4
26
1.72
2276400--2276472
34
2.1
34
92
0
119
47
20
5
26
1.71
2279366--2279395
9
3.3
9
95
0
51
80
6
0
13
0.91
2280705--2280752
23
2.0
24
92
4
80
25
2
6
66
1.26
2320189--2320215
7
3.9
7
100
0
54
0
14
55
29
1.40
2321343--2321376
15
2.3
15
94
0
59
79
0
0
20
0.73
2323081--2323752
223
3.0
228
87
5
997
40
17
17
23
1.91
2327059--2327095
2
19.0
2
94
5
67
51
0
0
48
1.00
2327567--2327609
20
2.1
21
82
4
52
41
4
2
51
1.35
2329673--2329728
18
3.2
18
76
16
64
30
1
7
60
1.33
2329676--2329731
16
3.4
16
72
15
51
32
1
7
58
1.35
2346506--2346545
21
1.9
21
85
10
55
70
2
15
12
1.28
2350366--2350400
3
11.7
3
100
0
70
68
0
31
0
0.90
2364304--2364354
24
2.1
25
82
10
61
49
0
5
45
1.26
2364404--2364557
76
2.0
76
100
0
308
42
14
14
28
1.85
2392595--2392638
21
2.1
21
95
0
79
20
25
13
40
1.89
2405045--2405085
21
2.0
21
85
0
55
21
29
19
29
1.98
2408928--2408961
16
2.1
16
88
0
50
50
14
17
17
1.79
2411495--2412356
133
6.5
133
89
1
1196
17
12
17
51
1.76
2414289--2414324
4
9.0
4
93
0
63
25
0
27
47
1.52
2420801--2420841
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
2423966--2424015
24
2.1
24
85
7
66
40
0
0
60
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2424093--2424134
17
2.5
17
84
0
57
64
7
0
28
1.20
2432517--2432576
19
3.1
19
79
13
52
50
1
0
48
1.11
2432549--2432617
16
4.6
16
69
18
58
50
0
0
49
1.00
2437218--2437282
28
2.3
27
81
5
67
18
1
10
69
1.26
2442801--2442873
36
2.1
35
82
12
87
61
1
1
35
1.13
2448036--2448089
23
2.5
22
85
8
67
42
0
1
55
1.10
2448058--2448097
20
2.0
20
85
0
53
47
0
0
52
1.00
2449063--2449141
30
2.6
30
89
0
122
39
1
44
15
1.54
2456963--2457025
26
2.5
25
79
5
72
63
0
4
31
1.15
2471203--2471279
37
2.1
37
81
11
88
51
2
11
33
1.52

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211