Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_D08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  65987480

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   

This is table  64  of  211  ( 25274 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19618023--19618075
25
2.1
25
82
6
63
67
9
0
22
1.19
19621196--19621230
17
2.1
17
100
0
70
40
11
17
31
1.85
19622319--19622377
25
2.4
25
91
0
91
25
18
5
50
1.67
19630756--19630812
17
3.4
17
75
4
53
50
1
3
43
1.29
19633630--19633674
21
2.1
21
100
0
90
35
31
13
20
1.91
19638071--19638104
15
2.3
15
94
0
59
38
0
23
38
1.55
19651114--19651168
29
2.0
27
82
13
67
60
10
14
14
1.60
19653561--19653611
23
2.2
23
79
6
59
37
1
3
56
1.29
19654174--19654224
3
17.0
3
100
0
102
33
0
0
66
0.92
19654409--19654458
13
3.7
13
76
7
55
52
0
2
46
1.12
19654524--19654574
26
2.0
26
84
3
68
68
1
5
23
1.22
19654591--19654940
173
2.0
174
90
0
549
25
18
21
34
1.96
19657555--19657616
32
1.9
32
100
0
124
48
12
12
25
1.77
19658715--19658757
16
2.8
15
79
6
50
20
0
9
69
1.15
19663088--19663164
15
4.9
17
72
20
69
63
2
2
31
1.21
19663072--19663164
14
6.4
14
71
12
53
62
2
3
32
1.23
19663299--19663447
23
6.6
21
73
11
93
53
4
7
34
1.50
19663294--19663431
47
3.0
47
80
6
142
55
5
5
33
1.48
19663934--19664716
45
17.3
45
74
9
515
30
20
17
32
1.95
19664095--19664254
44
3.7
42
77
8
144
30
23
18
27
1.98
19664038--19664716
89
7.5
89
73
11
493
30
21
16
31
1.95
19663934--19664715
225
3.4
227
83
3
973
30
20
17
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19664325--19664719
186
2.2
185
83
3
498
30
22
16
31
1.96
19669774--19669823
20
2.5
20
93
0
82
60
16
16
8
1.58
19669992--19670088
19
4.7
21
81
15
71
36
15
9
39
1.79
19669995--19670039
22
2.0
22
86
4
63
35
17
6
40
1.76
19670018--19670092
19
3.8
19
89
6
123
34
14
10
40
1.81
19670600--19670700
44
2.3
44
84
3
123
29
20
15
33
1.94
19670737--19671025
88
3.3
88
68
7
262
24
24
20
30
1.99
19670825--19670937
44
2.6
44
88
0
154
28
25
18
27
1.98
19670707--19671027
176
1.8
176
93
0
552
26
23
19
30
1.98
19671028--19671711
44
16.2
44
80
11
715
30
26
16
25
1.97
19671114--19671689
78
7.0
80
84
9
621
31
25
17
25
1.97
19671066--19671689
122
5.0
124
81
10
704
30
25
17
25
1.97
19672982--19673032
14
3.7
14
78
2
50
11
11
5
70
1.32
19674319--19674387
21
3.2
21
64
11
59
49
17
7
26
1.72
19674310--19674400
43
2.1
43
100
0
182
52
18
6
21
1.68
19674317--19674386
22
3.2
22
66
18
65
50
18
7
24
1.72
19676143--19676181
11
3.5
11
93
6
69
64
7
10
17
1.48
19678432--19678478
19
2.5
20
86
6
62
44
8
19
27
1.79
19679000--19679076
39
2.0
39
100
0
154
71
10
10
7
1.31
19680991--19681031
17
2.4
17
80
11
57
65
2
2
29
1.18
19681266--19681358
23
4.0
23
80
8
109
54
1
6
37
1.33
19681255--19681352
46
2.1
48
86
3
137
57
2
6
34
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19681270--19681377
46
2.3
45
76
17
105
55
2
5
36
1.38
19684688--19684720
14
2.3
15
94
5
59
18
0
6
75
1.00
19684823--19685016
61
3.2
60
74
12
216
42
1
4
52
1.27
19684819--19685051
121
1.9
121
97
0
439
43
0
4
51
1.27
19684983--19685029
18
2.6
18
90
6
69
42
0
0
57
0.98
19685188--19685280
44
2.1
44
84
9
118
35
26
4
33
1.76
19685262--19685299
16
2.4
16
90
0
58
26
31
2
39
1.70
19687020--19687053
6
5.7
6
100
0
68
64
0
0
35
0.94
19689047--19689101
25
2.2
25
90
6
85
32
27
23
16
1.96
19692818--19692859
21
2.0
21
95
0
75
40
4
16
38
1.70
19698820--19698854
3
11.7
3
100
0
70
68
0
0
31
0.90
19702523--19702584
31
2.0
31
100
0
124
38
6
35
19
1.77
19708664--19708701
14
2.7
14
84
11
51
26
0
7
65
1.19
19719692--19719734
3
14.3
3
100
0
86
65
0
0
34
0.93
19721326--19721658
88
3.8
88
90
2
508
22
22
26
28
1.99
19721331--19721654
177
1.8
177
94
0
576
21
23
26
28
1.99
19721703--19721900
88
2.2
88
87
3
274
24
24
20
30
1.99
19721955--19722227
45
6.1
45
88
0
393
31
23
15
30
1.95
19723539--19723576
13
3.0
13
84
3
51
15
5
0
78
0.91
19724572--19724611
21
1.9
21
89
0
62
12
2
10
75
1.15
19724844--19724881
17
2.2
17
95
0
67
39
15
15
28
1.89
19740090--19740115
13
2.0
13
100
0
52
30
0
38
30
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19742223--19742346
43
2.9
43
80
11
137
20
17
29
33
1.95
19758053--19758106
25
2.2
25
89
0
81
29
22
12
35
1.91
19758117--19758180
24
2.6
25
82
2
85
28
23
21
26
1.99
19766674--19766722
18
2.6
19
78
18
57
73
2
2
22
1.04
19773134--19773182
18
2.6
19
78
18
57
73
2
2
22
1.04
19784007--19784047
16
2.5
17
80
11
59
48
9
17
24
1.76
19785579--19785611
15
2.1
16
94
5
59
0
15
0
84
0.61
19786158--19786386
94
2.4
93
81
7
257
35
6
18
38
1.78
19786387--19786558
69
2.5
69
82
6
190
41
4
18
36
1.71
19787971--19788147
41
4.3
41
82
4
196
32
12
28
26
1.93
19789308--19789365
21
2.7
21
86
2
80
46
5
5
43
1.48
19789348--19789523
69
2.5
69
86
4
230
43
3
17
35
1.68
19789695--19789843
69
2.2
68
83
8
194
38
7
21
32
1.81
19789930--19789973
22
2.0
22
86
0
61
40
0
15
43
1.47
19791094--19791508
185
2.2
185
89
1
618
41
7
25
25
1.81
19791862--19791904
19
2.3
19
92
4
70
32
0
4
62
1.15
19793315--19793383
16
4.2
16
90
3
111
24
1
36
37
1.65
19793315--19793383
33
2.1
32
91
2
111
24
1
36
37
1.65
19793599--19793651
16
3.4
15
79
7
52
50
1
1
45
1.23
19793657--19793855
66
3.2
66
69
21
210
48
5
2
43
1.39
19793737--19793771
18
2.0
18
94
5
63
57
0
0
42
0.99
19793602--19795062
120
12.2
120
98
0
2791
47
5
2
44
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19799377--19799427
26
2.0
26
96
0
93
47
23
11
17
1.81
19806382--19806465
12
7.0
12
73
15
66
50
0
2
47
1.14
19815464--19815503
21
2.0
21
85
5
55
65
12
2
20
1.38
19815972--19816013
21
2.0
22
85
4
59
21
4
35
38
1.75
19815946--19816020
22
3.5
20
72
15
55
21
5
41
32
1.75
19816128--19816189
29
2.2
29
82
8
74
9
25
30
33
1.88
19819994--19820305
33
8.7
33
66
22
141
33
26
18
21
1.97
19819995--19820207
75
2.8
76
89
2
329
32
26
18
23
1.97
19820109--19820337
102
2.2
102
92
0
377
31
27
19
22
1.97
19821403--19821436
11
2.8
12
91
8
52
35
17
11
35
1.87
19829143--19829185
17
2.5
17
88
0
59
48
18
20
11
1.79
19830049--19830094
22
2.0
23
87
4
67
43
8
4
43
1.55
19831204--19831238
18
1.9
18
100
0
70
62
2
0
34
1.10
19831146--19831278
39
3.3
40
84
10
184
62
0
3
33
1.16
19831423--19831452
12
2.5
12
94
0
51
10
50
0
40
1.36
19832445--19832489
23
2.0
23
86
0
63
35
11
6
46
1.66
19834069--19834136
13
5.0
13
72
21
50
29
5
26
38
1.80
19840328--19840365
17
2.2
17
90
0
58
36
0
2
60
1.11
19843777--19843817
21
2.0
20
86
13
57
24
4
7
63
1.40
19844649--19844692
15
3.0
16
78
18
51
40
11
0
47
1.39
19856648--19856688
14
2.9
14
81
0
55
56
7
2
34
1.40
19858320--19858435
45
2.6
45
84
1
135
25
25
22
27
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19858456--19858606
44
3.4
44
78
6
128
29
21
19
29
1.98
19858269--19858693
173
2.4
173
83
3
507
27
23
19
30
1.98
19858704--19859095
98
4.0
99
90
1
581
27
22
21
29
1.99
19858704--19859095
197
2.0
198
89
1
599
27
22
21
29
1.99
19859111--19859310
100
2.0
100
97
0
373
28
30
19
22
1.98
19859422--19859659
88
2.7
87
88
1
332
28
23
19
28
1.98
19859512--19859647
44
3.1
44
70
12
134
28
23
18
29
1.98
19859443--19859656
44
4.9
44
66
14
118
28
23
18
28
1.98
19860890--19860920
13
2.3
14
94
5
55
12
16
0
70
1.16
19860889--19860921
7
4.7
7
85
14
50
12
15
0
72
1.12

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211