Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_D08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  65987480

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   

This is table  86  of  211  ( 25274 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26767601--26767655
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2.3
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
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1.93
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1.01
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1.96
26882884--26882940
20
2.8
20
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71
28
15
31
24
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.12
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15
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1.14
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1.97
26909883--26909929
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17
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1.97
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16
3.1
15
77
11
53
14
26
6
53
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26911796--26911861
12
5.8
12
68
12
50
15
24
1
59
1.45
26911796--26911859
21
2.9
22
84
11
87
15
25
1
57
1.47
26911891--26911937
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15
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12
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1.17
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20
2.0
20
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35
17
20
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1.95
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22
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2.2
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0
100
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11
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49
1.62
26921772--26921823
23
2.3
22
75
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23
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12
23
0
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1.29
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18
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4
51
10
23
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1.39
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20
2.2
20
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14
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28
4
13
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1.59
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100
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14
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1.76
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10
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10
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13
24
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1.93
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16
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1.13
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9
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10
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10
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12
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13
24
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20
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20
83
9
79
32
13
26
27
1.93
26948988--26949016
10
2.7
11
94
5
51
10
3
6
79
1.04
26959804--26959854
21
2.4
22
83
6
61
7
21
1
68
1.25
26969598--26969827
40
5.8
40
92
1
336
25
21
28
24
1.99
26978147--26978336
40
4.8
40
90
1
247
25
22
28
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26978147--26978356
80
2.6
80
86
3
280
24
21
28
25
1.99
26981386--26981430
18
2.5
19
82
10
58
71
2
17
8
1.23
26981346--26981442
30
3.3
30
74
12
94
67
3
18
11
1.35
26985578--26985604
4
6.8
4
100
0
54
77
0
0
22
0.76
26992055--26992081
4
6.8
4
100
0
54
77
0
0
22
0.76
26995835--26995947
19
6.1
19
74
12
108
45
13
10
30
1.77
26995887--26995946
20
3.0
20
92
2
95
43
15
11
30
1.82
26995963--26996295
170
2.0
170
96
0
612
32
15
22
29
1.95
26998488--26998530
10
4.2
10
82
5
59
32
25
9
32
1.88
26998491--26998530
21
2.0
20
90
5
62
32
25
10
32
1.89
26998492--26998536
20
2.2
20
84
7
56
31
26
13
28
1.94
27004257--27004312
10
5.6
10
76
19
55
26
16
28
28
1.97
27004249--27004319
20
3.6
20
88
5
101
30
16
26
25
1.97
27008793--27008817
13
1.9
13
100
0
50
32
8
16
44
1.76
27011041--27011078
19
2.0
20
94
5
69
18
34
10
36
1.85
27011043--27011088
20
2.3
19
85
7
56
23
34
10
30
1.89
27013301--27013347
25
1.9
24
86
4
67
51
10
19
19
1.75
27016053--27016108
30
1.9
30
86
13
82
60
8
14
16
1.57
27020384--27020439
30
1.9
28
82
13
69
60
10
14
14
1.58
27023226--27023293
20
3.4
20
81
4
75
26
14
35
23
1.94
27025016--27025055
18
2.2
18
86
0
53
10
27
0
62
1.27
27025016--27025109
24
3.9
24
71
0
80
10
22
2
64
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27025049--27025091
18
2.4
18
88
0
68
9
20
2
67
1.30
27025064--27025109
12
3.8
12
82
0
56
8
17
4
69
1.31
27025005--27025085
30
2.7
29
77
7
90
12
24
1
61
1.38
27025058--27025112
24
2.3
24
90
0
83
7
18
3
70
1.25
27025105--27025175
36
1.9
36
83
8
90
18
25
1
54
1.51
27027331--27027440
10
10.9
10
75
13
91
20
28
14
36
1.92
27027331--27027440
30
3.6
30
77
8
116
20
28
14
36
1.92
27030687--27030777
40
2.3
40
82
3
112
26
13
32
27
1.93
27030689--27030771
20
4.2
20
75
6
87
24
13
34
27
1.92
27032220--27032250
12
2.6
12
94
0
53
12
3
3
80
0.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211