Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  68668488

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   

This is table  196  of  230  ( 27491 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
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1.9
105
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3.9
108
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0
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0
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20
22
1.97
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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18
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2
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0
74
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0
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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100
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5
100
0
52
19
0
61
19
1.35
59239190--59239238
22
2.2
23
88
3
73
36
10
0
53
1.35
59239336--59239381
21
2.1
22
84
11
60
45
0
10
43
1.39
59239853--59239898
22
2.1
22
91
0
74
41
15
13
30
1.85
59239853--59240063
95
2.2
93
91
2
332
40
14
11
33
1.82
59239853--59240063
47
4.5
47
91
3
318
40
14
11
33
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59240315--59240346
14
2.2
15
94
5
57
53
25
0
21
1.46
59241032--59241114
43
1.9
43
83
9
107
33
30
19
16
1.94
59242038--59242068
12
2.6
12
89
0
53
54
3
0
41
1.16
59243105--59243134
15
1.9
16
93
6
53
26
10
16
46
1.78
59244821--59244852
12
2.5
13
95
5
57
34
6
0
59
1.23
59244835--59244870
18
2.0
18
89
10
56
27
2
0
69
1.02
59251535--59251588
21
2.6
21
77
13
58
55
3
1
38
1.28
59265959--59266034
22
3.5
22
81
5
73
14
30
21
34
1.93
59272884--59272918
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
59273066--59273170
44
2.5
40
76
15
113
31
29
4
34
1.78
59273064--59273173
45
2.6
44
81
8
131
31
29
5
33
1.80
59273152--59273221
16
4.4
16
96
0
104
32
35
0
31
1.58
59276683--59276788
50
2.1
51
85
8
144
33
10
10
45
1.73
59278037--59278245
91
2.3
91
90
0
319
45
3
3
46
1.37
59278071--59278212
47
3.1
46
66
24
118
44
2
3
50
1.31
59278159--59278219
28
2.2
28
85
5
81
45
0
3
50
1.17
59278298--59278866
61
9.4
62
67
21
359
42
1
6
49
1.39
59278260--59278916
120
5.5
120
97
0
1210
43
1
5
49
1.36
59278385--59278436
15
3.6
15
80
12
56
44
0
1
53
1.11
59278505--59278556
15
3.6
15
80
12
56
44
0
1
53
1.11
59278634--59278680
16
3.0
16
78
12
53
46
0
2
51
1.13
59278754--59278799
15
3.0
15
84
9
58
47
0
2
50
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59278873--59278917
16
2.8
16
83
10
56
48
0
2
48
1.13
59279128--59279160
16
2.1
16
94
0
57
24
36
3
36
1.71
59280742--59280793
16
3.2
16
94
0
86
28
0
34
36
1.58
59281008--59281049
15
2.7
16
82
14
52
52
2
0
45
1.13
59281017--59281058
15
2.9
15
82
10
52
52
0
0
47
1.00
59281006--59281274
120
2.2
121
93
3
456
49
4
2
42
1.37
59281124--59281169
16
2.9
16
78
12
51
52
2
0
45
1.13
59281124--59281178
15
3.7
15
79
13
53
52
1
0
45
1.11
59281056--59281243
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3.1
61
68
14
181
48
6
2
42
1.42
59285941--59285971
10
3.1
10
95
0
53
67
0
0
32
0.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230