Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  68668488

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   

This is table  205  of  230  ( 27491 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61247178--61247218
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0
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2.0
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0
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2.0
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0
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24
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24
24
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214
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2.0
27
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2.0
22
100
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20
17
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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28
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23
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2.3
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45
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3.5
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3
6
48
1.44
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120
2.4
120
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5
443
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3
5
49
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.13
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0
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1.00
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151
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3
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0
0
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5
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2
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1.36
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1
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0
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3.6
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12
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44
0
1
53
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
61386419--61386460
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45
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2
52
1.13
61386410--61386451
15
2.9
15
82
10
52
47
0
0
52
1.00
61386165--61386462
120
2.5
120
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42
2
4
50
1.37
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2.0
44
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5
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1.80
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16
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16
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0
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1.58
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0
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1.81
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1.9
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1.98
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0
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16
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16
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0
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3
41
1.45
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25
2.5
28
71
11
68
55
2
4
37
1.36
61429200--61429245
22
2.1
22
91
0
74
10
0
28
60
1.30
61429214--61429255
16
2.6
16
81
11
50
4
2
28
64
1.26
61430308--61430355
24
2.0
24
84
4
62
47
0
8
43
1.33
61432329--61432364
15
2.3
16
90
4
56
58
2
5
33
1.36
61433595--61433661
24
2.8
24
90
2
100
61
0
2
35
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61433585--61433702
11
10.9
11
70
20
72
60
0
2
37
1.11
61433645--61433678
17
2.0
17
88
0
50
64
0
0
35
0.94
61433621--61433751
41
3.2
41
94
3
230
61
0
3
34
1.17
61433989--61434028
17
2.4
17
87
8
55
55
2
0
42
1.13
61437092--61437120
14
2.1
14
100
0
58
6
20
13
58
1.58
61437269--61437306
17
2.2
17
95
0
67
55
0
0
44
0.99
61444228--61444282
28
2.0
28
89
7
85
67
0
3
29
1.08
61444760--61444802
4
10.8
4
94
0
77
23
2
23
51
1.60
61448653--61448694
13
3.2
13
77
12
50
57
0
0
42
0.99
61449306--61449330
12
2.1
12
100
0
50
32
8
0
60
1.26
61465556--61465591
7
5.1
7
93
0
63
44
11
0
44
1.39
61468790--61468850
27
2.2
30
77
16
69
32
8
9
49
1.66
61473596--61473667
31
2.4
31
80
11
80
23
13
6
55
1.63
61474342--61474418
34
2.4
31
78
16
77
35
1
2
61
1.18
61480580--61480768
61
3.1
61
70
14
183
49
6
2
41
1.40
61480638--61480694
16
3.6
16
76
11
55
56
1
0
42
1.10
61480791--61480827
16
2.2
17
86
13
51
54
0
2
43
1.14
61480530--61480828
120
2.5
120
94
1
517
49
5
1
43
1.34
61480767--61481098
91
3.5
95
79
15
352
48
2
2
46
1.28
61480844--61481141
91
3.3
91
95
0
524
46
3
3
47
1.33
61480946--61481111
10
18.2
9
65
25
57
47
2
2
47
1.28
61482355--61482436
39
2.1
39
97
0
155
54
8
2
34
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61492179--61492327
30
5.0
29
74
11
124
32
23
4
39
1.73
61492195--61492327
30
4.5
29
74
12
128
33
25
3
37
1.74
61492157--61492287
59
2.2
60
81
6
142
34
20
3
41
1.71
61492835--61492893
4
15.5
4
74
22
56
76
0
23
0
0.79
61492835--61492897
11
6.0
11
83
5
78
77
0
22
0
0.76
61493894--61494040
18
7.7
18
72
17
109
32
12
8
46
1.72
61493895--61493966
35
2.1
34
89
2
108
30
11
8
50
1.67
61493965--61494020
20
2.8
20
87
12
89
35
12
10
41
1.78
61501005--61501043
19
2.1
18
85
4
51
64
5
2
28
1.28
61509150--61509196
21
2.2
22
92
3
78
21
19
38
21
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230