Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  68668488

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   

This is table  38  of  230  ( 27491 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10156115--10156169
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3
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1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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Percent
Indels
Score
A
C
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1.43
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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30
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1.86
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1.87
10299834--10299956
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2.6
47
94
5
221
30
29
8
31
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.58
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1.80
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21
2.1
20
91
8
68
40
4
14
40
1.67
10372887--10372942
19
2.9
19
84
10
71
41
7
16
35
1.75
10372892--10372957
23
3.0
23
80
12
68
39
6
16
37
1.74
10373275--10373313
3
13.0
3
88
0
51
28
2
5
64
1.28
10373433--10373467
17
2.1
17
88
0
52
37
8
0
54
1.31
10373602--10373656
25
2.2
25
84
9
69
29
1
9
60
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10373628--10373687
31
1.9
31
86
3
84
33
3
5
58
1.36
10373833--10373867
8
4.6
8
86
13
56
22
0
8
68
1.16
10373833--10373859
14
1.9
14
100
0
54
22
0
7
70
1.12
10376157--10376199
16
2.9
16
80
13
56
23
18
13
44
1.86
10378273--10378810
44
12.2
45
77
4
524
26
14
27
31
1.95
10378262--10378795
132
4.0
132
93
0
897
26
14
27
31
1.95
10378262--10378810
265
2.1
264
91
0
900
26
14
27
31
1.95
10378791--10379108
88
3.6
88
86
0
465
27
29
23
19
1.98
10378380--10378924
265
2.1
264
81
4
614
27
17
26
27
1.98
10379108--10379317
44
4.8
44
86
3
280
27
17
26
29
1.98
10380105--10380130
12
2.2
12
100
0
52
34
7
15
42
1.75
10380117--10380164
19
2.4
20
93
6
80
37
10
14
37
1.81
10380122--10380187
19
3.0
22
82
12
66
37
7
16
37
1.77
10380507--10380554
3
16.0
3
91
0
60
31
6
2
60
1.33
10380460--10380524
23
2.9
22
77
9
69
24
1
7
66
1.27
10380675--10380718
17
2.6
17
85
3
63
40
11
0
47
1.39
10380630--10380865
117
2.0
117
99
0
463
36
11
2
49
1.53
10380792--10380835
17
2.6
17
85
3
63
40
11
0
47
1.39
10380667--10380866
60
3.4
60
77
13
252
37
12
2
49
1.51
10380996--10381052
30
1.9
30
89
7
89
36
3
3
56
1.34
10382313--10382349
17
2.2
17
90
4
58
48
8
2
40
1.47
10384730--10384762
17
1.9
17
93
0
57
39
0
3
57
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10384900--10384945
7
6.6
7
100
0
92
86
0
0
13
0.56
10388912--10388955
22
1.9
22
86
9
61
38
15
2
43
1.60
10389166--10389238
25
2.9
25
74
11
78
30
23
23
23
1.99
10391855--10391910
24
2.5
22
86
11
78
32
37
16
14
1.88
10391868--10391916
24
2.0
24
100
0
98
32
38
16
12
1.86
10394757--10394996
51
4.8
48
80
7
212
26
17
25
31
1.97
10394758--10395033
101
2.7
101
81
4
297
27
15
24
31
1.96
10397413--10397503
47
1.9
48
84
6
123
24
14
28
32
1.94
10400601--10400839
51
4.8
49
79
7
239
24
17
27
29
1.98
10400601--10400876
101
2.7
102
84
4
344
26
16
27
30
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230