Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  68668488

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   

This is table  27  of  230  ( 27491 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7404061--7404145
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0
28
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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7469909--7470248
44
7.9
42
82
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335
24
25
21
28
1.99
7469909--7470265
87
4.1
86
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321
25
25
20
28
1.99
7472371--7473043
9
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19
147
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2
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1.63
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34
0
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1.52
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2
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1.65
7472425--7472552
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2.0
62
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28
3
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1.68
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2.0
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2
18
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0
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1.47
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2.9
22
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2
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37
45
0
17
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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2.0
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26
22
24
2.00
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22
25
2.00
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18
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1.93
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22
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1.96
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49
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7
822
31
22
20
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7515512--7516418
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2.3
398
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2
1385
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21
24
1.98
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4.7
48
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7
160
32
24
20
22
1.98
7515512--7516460
100
9.5
99
91
2
1316
31
22
20
24
1.98
7516705--7516835
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3.0
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167
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19
19
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4.1
15
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8
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2.0
30
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3
8
62
1.39
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21
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2
20
1.10
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14
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0
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17
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0
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4
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24
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0
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25
2
6
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1.26
7550697--7550765
34
2.1
33
83
2
84
31
10
4
53
1.54
7554130--7554315
73
2.5
73
99
0
363
40
24
6
27
1.80
7554316--7554347
3
10.7
3
100
0
64
68
0
0
31
0.90
7558564--7558749
73
2.5
73
98
0
354
40
24
6
28
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7558750--7558778
3
9.7
3
100
0
58
68
0
0
31
0.89
7569608--7569641
2
17.0
2
87
0
50
50
0
50
0
1.00
7571324--7571383
18
3.3
17
81
11
66
33
0
0
66
0.92
7571323--7571375
27
2.0
26
85
10
72
30
0
0
69
0.88
7581339--7581489
59
2.5
60
75
7
139
41
21
15
21
1.90
7582423--7582469
24
2.0
24
86
0
67
27
44
17
10
1.81
7584958--7585002
21
2.1
21
88
8
65
60
0
0
40
0.97
7584958--7585005
23
2.1
23
88
7
71
62
0
0
37
0.95
7589609--7589827
114
1.9
115
79
12
245
20
8
19
52
1.72
7605433--7605694
93
2.8
90
77
12
269
30
18
19
32
1.96
7605857--7605888
15
2.1
15
94
0
55
21
6
34
37
1.79
7607905--7607964
6
10.0
6
100
0
120
33
0
0
66
0.92
7616276--7616301
13
2.0
13
100
0
52
30
0
15
53
1.42
7616945--7617016
20
3.8
20
77
14
80
43
2
1
52
1.24
7617002--7617118
62
1.9
59
86
8
164
43
2
3
50
1.32
7621647--7621774
9
13.9
9
68
16
50
32
7
3
57
1.42
7626242--7626322
29
2.8
29
74
18
80
23
16
3
56
1.55
7626611--7626644
16
2.1
16
88
0
50
41
2
11
44
1.56
7628988--7629030
22
2.0
22
95
0
77
44
11
4
39
1.62
7630613--7630661
5
9.0
5
79
16
53
20
2
4
73
1.10
7631425--7631623
109
1.8
109
81
4
249
27
24
19
29
1.98
7631900--7631947
16
3.0
15
76
11
51
83
4
8
4
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7643947--7643987
18
2.4
18
88
11
61
60
4
0
34
1.18
7644497--7644564
31
2.2
31
86
5
93
47
2
2
47
1.32
7644513--7644693
93
1.9
93
85
2
247
44
4
6
45
1.48
7651241--7651307
34
1.9
34
85
8
91
58
13
7
20
1.59
7651377--7651416
21
1.9
21
85
10
55
70
5
5
20
1.26
7656433--7656517
31
2.8
29
77
18
84
34
9
14
42
1.77
7659058--7659108
15
3.5
14
72
17
50
66
0
1
31
1.03
7659038--7659130
29
3.0
31
82
7
118
61
0
1
37
1.03
7659093--7659158
11
6.4
11
70
19
52
60
0
3
36
1.12
7659063--7659173
40
2.7
40
80
8
127
63
0
2
33
1.08

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230