Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  68668488

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   

This is table  29  of  230  ( 27491 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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0
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0
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1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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Entropy
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16
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1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8019433--8019470
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0
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0
0
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8063763--8063809
3
15.7
3
78
8
51
31
6
0
61
1.21
8063763--8063808
12
3.8
12
86
11
67
32
6
0
60
1.22
8063774--8063820
19
2.5
19
80
16
53
31
6
0
61
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8064735--8064832
4
22.8
4
79
12
72
71
3
4
21
1.17
8064779--8064849
5
14.4
5
82
10
69
73
2
2
21
1.09
8066728--8066940
44
4.9
43
78
9
173
28
21
19
30
1.97
8066770--8066955
44
4.3
43
78
10
182
26
20
20
31
1.98
8066785--8066975
44
4.4
44
75
15
148
27
19
22
30
1.98
8067029--8067077
25
2.0
25
87
0
71
28
16
18
36
1.92
8066950--8067423
125
3.8
125
93
1
797
26
20
18
34
1.96
8067402--8069140
100
17.4
100
94
0
2951
27
20
20
32
1.97
8071628--8071679
9
5.8
9
85
14
72
11
0
11
76
1.01
8071611--8071677
19
3.6
19
81
18
88
11
0
10
77
0.99
8071611--8071679
28
2.5
29
90
6
108
13
0
11
75
1.05
8072392--8072428
17
2.1
18
90
5
58
45
0
24
29
1.53
8072902--8072950
19
2.5
20
80
6
57
42
12
18
26
1.85
8074620--8074717
4
22.8
4
79
12
72
71
3
4
21
1.17
8074664--8074734
5
14.4
5
82
10
69
73
2
2
21
1.09
8075077--8075108
12
2.7
12
100
0
64
59
0
6
34
1.23
8080006--8080351
125
2.8
122
89
3
514
33
21
13
31
1.92
8081600--8081647
19
2.5
19
89
3
78
60
0
0
39
0.97
8081609--8081656
26
1.9
24
83
8
60
54
0
0
45
0.99
8084123--8084177
4
13.8
4
100
0
110
50
23
0
25
1.49
8097924--8097986
33
1.9
33
90
0
99
42
11
4
41
1.61
8100986--8101034
3
16.7
3
78
4
55
59
4
2
34
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8102661--8104369
99
17.3
99
85
1
2060
25
21
22
31
1.98
8105181--8105398
108
2.0
107
82
2
258
48
9
16
25
1.76
8116848--8116894
20
2.4
19
76
13
51
51
0
10
38
1.37
8116939--8116983
21
2.1
21
87
4
63
53
2
11
33
1.49
8117065--8117112
3
16.0
3
82
0
60
62
2
2
33
1.18
8119004--8119060
29
2.0
29
86
6
80
54
7
8
29
1.58
8123361--8123881
44
11.7
44
73
10
335
28
23
18
29
1.98
8123361--8123843
134
3.6
132
75
10
370
27
24
18
29
1.98
8123493--8123844
178
2.0
178
90
0
551
26
25
19
29
1.99
8123501--8123881
45
8.6
45
77
6
325
27
24
19
28
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230