Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  67973905

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   

This is table  173  of  228  ( 27298 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
51866117--51866176
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0
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2.0
171
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25
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25
20
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1.9
128
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25
20
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21
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0
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13
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13
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2.1
60
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1.81
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2.5
271
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2.0
16
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59
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25
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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1.94
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2.1
25
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0
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3.2
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10.4
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51940532--51940806
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300
23
14
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2.0
28
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0
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2.6
35
90
0
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14
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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7
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0
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2
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1
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2.9
15
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13
0
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0
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0
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13
45
1.64
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6.1
76
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5
47
1.53
52017772--52018228
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1.53
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52017772--52018228
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5
47
1.53
52018399--52018606
9
23.8
9
69
13
130
45
21
1
31
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
52018444--52018565
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2.0
61
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0
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1.56
52018466--52018606
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5.4
25
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13
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1
31
1.60
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17
31
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1.66
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401
22
22
21
34
1.97
52024558--52024849
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3.5
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399
22
21
20
35
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16
2.8
15
90
10
70
25
2
0
72
0.96
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40
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43
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1
154
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19
24
1.98
52033460--52033550
43
2.1
43
97
0
173
30
34
16
18
1.93
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100
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12
12
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1
17
1.60
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2
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23
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0
178
40
4
17
37
1.71
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17
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0
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18
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62
45
1
3
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1.29
52051069--52051105
19
1.9
19
100
0
74
21
24
0
54
1.45
52062329--52062380
7
7.4
7
80
0
50
21
1
30
46
1.62
52062335--52062402
29
2.4
28
82
2
82
23
1
29
45
1.62
52062457--52062502
21
2.2
21
84
7
58
30
0
21
47
1.51
52062464--52062509
21
2.2
21
88
7
67
30
0
17
52
1.45
52067318--52067364
24
2.0
24
95
0
85
40
17
17
25
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
52067670--52067708
18
2.2
18
86
9
53
12
25
46
15
1.81
52070658--52071036
40
9.7
40
91
5
632
30
19
27
22
1.98
52079608--52080075
40
11.7
40
96
0
855
30
20
27
22
1.98
52084656--52084681
12
2.2
12
100
0
52
11
15
15
57
1.65
52084771--52084940
85
2.0
85
98
0
331
19
20
16
44
1.87
52085608--52085769
66
2.5
66
95
0
288
41
16
26
16
1.88
52086100--52086212
42
2.7
42
88
0
163
21
19
30
29
1.97
52087689--52087752
27
2.4
27
84
2
76
51
3
4
40
1.38
52092163--52092257
26
3.7
25
81
2
100
38
24
20
16
1.92
52092461--52092757
27
11.0
27
88
2
357
22
17
19
40
1.92
52094747--52094783
5
7.4
5
93
0
65
62
2
0
35
1.10
52097019--52097063
6
7.7
6
87
5
56
26
0
0
73
0.84
52097016--52097063
17
2.8
17
87
3
60
27
0
0
72
0.84
52100652--52100685
17
2.0
17
88
11
52
23
0
5
70
1.09
52107742--52107775
15
2.4
14
90
5
50
79
0
5
14
0.91
52115489--52115548
29
2.0
29
83
9
75
25
1
5
68
1.19
52115524--52115561
19
2.0
19
85
10
51
34
0
5
60
1.19
52115681--52115754
22
3.5
22
68
22
68
67
0
2
29
1.04
52119395--52119545
10
15.4
10
71
18
88
67
0
31
0
0.96
52119407--52119539
28
4.8
28
76
12
121
69
0
30
0
0.94
52119401--52119503
38
2.7
38
85
7
145
67
0
32
0
0.90
52119453--52119544
6
14.0
6
74
15
58
71
0
27
1
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
52120078--52120107
16
1.9
15
93
6
51
70
0
3
26
1.03
52119870--52120668
317
2.5
317
92
1
1323
51
7
10
30
1.65
52125914--52126048
40
3.2
40
78
13
139
51
12
3
32
1.57
52134099--52134128
12
2.5
12
94
0
51
6
0
40
53
1.27
52134906--52135120
111
1.9
115
89
6
341
41
13
15
28
1.85
52138494--52138540
20
2.3
21
85
3
60
25
6
6
61
1.44
52138535--52138568
16
2.1
16
89
10
52
5
5
0
88
0.64
52140844--52140980
67
2.0
68
98
1
267
32
5
1
59
1.30
52140948--52140995
17
2.7
18
74
6
53
50
0
2
47
1.12
52140850--52141000
67
2.2
67
91
3
223
34
4
1
58
1.30

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228