Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  67973905

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   

This is table  213  of  228  ( 27298 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62272502--62272579
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0
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3
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0
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1.93
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0
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2
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1.35
62292398--62292471
36
2.1
35
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2
130
16
5
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1.35
62292617--62292662
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3.1
15
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2.1
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2.0
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4
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6
0
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12
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0
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23
100
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14
85
0
50
0
47
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52
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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62347512--62347572
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3.0
20
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27
11
19
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1.86
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14
2.4
14
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57
15
0
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53
1.43
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2.0
25
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2.1
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10
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1.70
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2.0
21
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9
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1.70
62362148--62362193
22
2.1
22
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4
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23
10
0
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2.0
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2.5
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1.80
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100
0
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0
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0.90
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2.5
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15
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34
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19
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1.71
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2.2
15
94
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33
3
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2.1
71
97
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14
14
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2.0
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14
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100
0
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0
0
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2.6
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88
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16
11
40
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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0
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119
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2.0
23
82
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0
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0
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0
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1.11
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12
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34
0
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1.17
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2.0
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19
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0
0
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4
54
1.38
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1.16
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3
4
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1.35
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1
1
55
1.21
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29
1.9
30
82
13
73
44
0
19
35
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62436076--62436138
25
2.6
25
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25
23
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1.98
62440321--62440371
21
2.5
20
75
6
57
33
3
0
62
1.13
62440492--62440532
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3.2
13
83
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63
2
0
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1.08
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6.0
10
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51
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3
0
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1.11
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22
3.2
21
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21
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53
4
1
40
1.29
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22
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23
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8
69
58
0
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39
1.10
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2.0
20
85
10
53
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2
15
60
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1.36
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2.0
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43
1.68
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30
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21
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1.78
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3.1
30
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1
134
25
23
6
44
1.77
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15
5.2
15
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11
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25
20
7
46
1.77
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29
2.0
27
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74
21
12
9
56
1.64
62494312--62494350
17
2.3
17
90
0
60
38
5
0
56
1.22
62495068--62495469
109
3.7
109
91
3
650
30
16
19
33
1.94
62495073--62495469
217
1.8
217
95
0
722
29
16
19
34
1.94
62499188--62499227
6
6.3
6
83
11
53
77
0
22
0
0.77
62499188--62499225
10
3.7
10
83
16
51
78
0
21
0
0.74
62499188--62499226
20
2.0
19
95
5
69
79
0
20
0
0.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62501508--62501841
87
3.8
87
72
9
257
30
18
21
29
1.97
62501596--62502235
44
14.8
43
70
8
334
31
16
22
30
1.96
62501595--62502180
85
6.8
88
69
12
311
31
16
22
30
1.95
62501485--62501966
175
2.8
175
86
2
659
31
17
21
30
1.96
62501720--62501841
46
2.7
46
83
5
151
29
18
22
30
1.97
62501767--62502344
129
4.5
129
91
0
850
30
16
21
30
1.96
62504128--62504166
17
2.3
17
90
0
60
38
5
0
56
1.22
62505708--62505883
87
2.0
87
96
0
325
22
17
22
38
1.93
62507876--62507956
34
2.4
32
72
13
74
56
1
4
37
1.29
62517985--62518030
19
2.2
22
88
11
71
43
2
0
54
1.12
62519128--62519162
16
2.1
17
89
5
54
68
0
0
31
0.90
62521228--62521269
21
2.0
22
95
4
77
28
23
7
40
1.81
62526961--62527092
48
2.7
48
79
9
135
37
21
20
21
1.95
62527024--62527199
90
2.0
87
83
3
217
34
19
22
23
1.97
62526941--62527336
50
8.4
50
75
11
266
34
18
22
24
1.96
62530450--62530511
33
1.9
32
90
3
97
16
14
46
22
1.83
62531228--62531294
22
3.1
22
79
14
77
26
7
0
65
1.19
62531228--62531303
22
3.5
22
74
16
68
25
9
0
65
1.21
62531227--62531347
44
2.7
44
78
10
111
26
10
1
61
1.38
62531246--62531410
90
1.8
90
82
8
210
27
12
1
59
1.40
62534485--62534841
49
7.2
49
77
7
303
24
23
18
33
1.97
62534485--62534796
150
2.1
145
82
7
360
24
23
19
33
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62536250--62536335
42
2.0
42
100
0
172
43
18
2
36
1.63
62537291--62537341
19
2.7
19
84
3
59
68
3
5
21
1.27
62537332--62537380
23
2.1
23
100
0
98
57
0
4
38
1.18
62537331--62537394
23
3.0
22
86
8
87
56
1
3
39
1.25
62537380--62537441
27
2.3
27
83
5
72
62
6
1
29
1.29
62538017--62538051
9
3.9
9
85
14
54
77
0
2
20
0.90
62538216--62538268
22
2.3
23
84
9
65
37
0
7
54
1.29
62538327--62538380
21
2.7
20
82
5
65
25
5
5
62
1.39
62538349--62538395
20
2.3
20
85
3
58
25
2
6
65
1.27
62538344--62538391
11
4.3
12
77
17
50
27
2
8
62
1.35

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228