Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: D10 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 67973905

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   

This is table  215  of  228  ( 27298 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62890999--62891047
21
2.3
23
79
13
59
55
4
0
40
1.19
62893277--62893354
15
5.2
15
70
11
61
46
7
20
25
1.77
62893273--62893354
30
2.7
30
90
0
128
47
7
20
24
1.75
62897939--62898016
15
5.2
15
70
11
61
44
7
19
28
1.78
62897935--62898016
30
2.7
30
88
0
119
46
7
19
26
1.76
62898762--62898822
23
2.7
23
82
5
70
59
3
3
34
1.30
62899085--62899128
21
2.1
21
87
4
63
70
0
6
22
1.11
62906212--62906257
22
2.0
23
83
4
58
39
8
2
50
1.46
62906223--62906265
22
2.0
22
81
9
52
37
13
0
48
1.43
62906701--62906729
5
6.0
5
96
4
51
20
0
0
79
0.74
62908357--62908387
16
1.9
16
93
0
53
58
0
6
35
1.24
62920360--62920393
3
11.7
3
87
6
52
0
29
0
70
0.87
62920545--62920603
31
1.9
31
85
0
82
16
35
28
18
1.93
62927012--62927098
21
4.4
19
73
13
59
25
4
3
66
1.26
62933164--62933208
23
2.0
23
87
8
67
24
15
6
53
1.66
62935926--62936433
23
22.3
23
76
11
411
29
6
24
39
1.81
62935928--62936404
137
3.5
137
87
3
640
29
6
23
40
1.80
62936003--62936433
183
2.4
183
91
2
681
30
6
23
39
1.79
62937358--62937672
43
7.3
43
87
0
405
21
18
32
27
1.96
62937934--62938004
31
2.3
31
100
0
142
35
9
11
43
1.74
62941830--62941868
20
2.0
20
94
0
69
48
0
2
48
1.15
62943928--62944052
52
2.5
47
77
17
119
56
0
6
36
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62944069--62944123
24
2.2
24
87
3
74
41
3
12
41
1.60
62948023--62948151
62
2.1
63
88
1
188
42
13
10
32
1.80
62948593--62948635
21
2.1
21
86
4
61
25
4
16
53
1.62
62970383--62971093
88
8.0
89
84
6
836
25
24
18
31
1.98
62970390--62971109
181
4.1
178
86
5
908
25
24
18
31
1.98
62972430--62972519
45
2.0
45
88
0
135
12
23
15
48
1.78
62972434--62972531
45
2.2
45
81
1
106
13
25
14
46
1.80
62975223--62975262
19
2.0
20
85
4
55
47
7
17
27
1.74
62977179--62977268
34
2.6
34
80
7
92
53
5
7
33
1.53
62977382--62977422
3
14.0
3
94
5
75
68
0
0
31
0.90
62981327--62981382
16
3.6
16
73
9
53
67
1
8
21
1.27
62988973--62989000
6
4.7
6
100
0
56
46
0
0
53
1.00
62990818--62990863
3
15.0
3
95
4
83
65
0
34
0
0.93
62995762--62995786
3
8.3
3
100
0
50
36
0
0
64
0.94
63001696--63001776
37
2.2
37
80
10
87
40
0
2
56
1.12
63007556--63007589
17
2.0
18
88
11
54
44
8
0
47
1.34
63011195--63011258
32
2.0
32
84
0
83
43
1
7
46
1.42
63012488--63012546
29
2.0
29
86
0
82
25
8
30
35
1.86
63018160--63018184
3
8.3
3
100
0
50
36
0
0
64
0.94
63022464--63022522
23
2.4
26
77
11
70
32
1
5
61
1.28
63029782--63029838
5
11.4
5
100
0
114
40
0
0
59
0.97
63039481--63039531
20
2.6
20
75
3
59
41
0
3
54
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63040283--63040321
15
2.4
17
87
8
55
38
0
0
61
0.96
63040309--63040367
30
2.0
30
86
0
82
44
3
3
49
1.36
63044266--63044472
114
1.8
112
83
2
270
33
24
11
31
1.90
63048711--63048779
6
11.0
6
80
14
77
15
0
5
78
0.94
63048714--63048779
25
2.6
27
81
16
86
15
0
6
78
0.93
63048711--63048779
32
2.2
32
87
7
97
15
0
5
78
0.94
63049806--63049830
8
3.1
8
100
0
50
88
0
0
12
0.53
63049812--63049844
11
3.2
11
87
12
52
75
0
0
24
0.80
63051761--63051798
20
1.9
20
89
10
60
42
0
2
55
1.14
63051809--63051845
18
1.9
18
89
10
56
54
0
5
40
1.24
63053598--63053721
29
4.2
29
77
13
110
34
16
4
43
1.70
63054072--63054145
4
20.5
4
84
15
67
74
0
25
0
0.82
63054083--63054153
7
9.7
7
76
11
63
76
0
23
0
0.79
63054070--63054153
34
2.4
36
82
6
100
75
0
25
0
0.81
63054259--63054308
21
2.4
21
86
6
66
74
6
18
2
1.12
63054456--63054489
10
3.3
10
92
8
59
79
0
20
0
0.73
63054443--63054489
11
4.2
11
83
10
60
78
0
21
0
0.75
63054976--63055030
18
2.9
19
75
24
62
29
14
7
49
1.70
63054976--63055023
20
2.5
20
78
21
57
33
14
6
45
1.70
63055011--63055096
36
2.4
36
84
11
113
31
9
8
51
1.63
63054963--63055096
36
3.7
35
76
16
112
34
10
8
47
1.68
63055034--63055099
18
3.7
18
68
8
53
39
7
6
46
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63057219--63057248
15
2.0
15
100
0
60
40
0
6
53
1.27
63057762--63057812
25
2.0
25
88
0
75
25
15
17
41
1.89
63062723--63062765
11
3.7
11
79
11
50
37
2
13
46
1.57
63062718--63062770
24
2.2
25
93
3
90
37
1
11
49
1.50
63068912--63068941
6
5.0
6
95
0
51
20
16
0
63
1.31
63079292--63079426
67
2.0
67
95
0
243
27
30
19
22
1.98
63079545--63079662
57
2.1
57
85
3
157
23
22
22
31
1.98
63083328--63083376
21
2.3
23
79
13
59
55
4
0
40
1.19
63088466--63088759
99
3.0
99
81
4
290
34
18
20
26
1.96
63090268--63090373
54
2.0
54
86
0
149
31
28
15
25
1.95
63090484--63090526
6
7.2
6
89
0
68
18
20
44
16
1.87
63094820--63094845
4
6.5
4
100
0
52
76
0
0
23
0.78
63097606--63097643
20
1.9
20
84
10
51
7
2
50
39
1.46
63097721--63097757
17
2.2
17
90
0
56
40
10
21
27
1.86
63101345--63101382
20
1.9
20
94
0
67
31
0
5
63
1.17
63104915--63104940
4
6.5
4
100
0
52
76
0
0
23
0.78
63105268--63105304
17
2.2
17
90
0
56
40
10
21
27
1.86
63106351--63106388
20
1.9
20
94
0
67
31
0
5
63
1.17
63106843--63106880
16
2.4
17
82
13
53
60
0
7
31
1.25
63107643--63107685
16
2.7
16
86
10
61
44
0
2
53
1.13
63113452--63113639
103
1.8
104
88
1
288
31
11
24
32
1.91
63113628--63113660
14
2.4
14
90
10
50
84
0
15
0
0.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63113628--63113678
27
2.0
25
84
7
66
80
1
15
1
0.89
63118724--63118766
20
2.2
20
84
8
54
39
0
2
58
1.11
63122001--63122034
15
2.2
16
89
5
52
2
23
2
70
1.15
63141475--63141550
31
2.5
30
85
8
100
28
5
14
51
1.64
63142150--63142219
29
2.4
27
74
21
63
37
4
2
55
1.34
63142166--63142240
29
2.6
30
81
12
86
40
2
1
56
1.22
63142664--63142721
30
1.9
31
85
3
82
56
0
1
41
1.09
63145521--63145566
25
1.9
25
82
8
60
41
2
0
56
1.11
63150027--63150061
11
3.2
11
87
0
52
68
2
0
28
1.04
63150020--63150061
22
2.0
20
86
9
57
64
4
0
30
1.14
63152915--63152944
14
2.1
14
93
0
51
56
6
0
36
1.26
63154087--63154132
21
2.2
21
84
7
58
67
2
0
30
1.03
63160437--63160482
19
2.4
18
82
10
56
23
19
8
47
1.77
63164768--63165054
50
5.7
49
71
5
207
31
20
22
26
1.98
63164818--63165129
50
6.2
50
73
3
135
29
20
25
25
1.99
63164760--63165129
100
3.7
100
83
2
447
29
20
24
25
1.99
63168366--63168402
19
1.9
19
89
10
58
21
5
10
62
1.48
63168826--63168860
7
5.0
7
100
0
70
57
0
28
14
1.38
63175932--63176081
44
3.4
44
77
1
174
26
24
16
33
1.95
63175849--63176108
44
5.8
45
73
4
161
29
23
17
29
1.97
63175905--63176108
89
2.3
89
84
3
284
28
24
18
28
1.98
63186328--63186358
16
1.9
16
93
0
53
32
16
19
32
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63188706--63188748
10
4.6
9
80
8
50
74
0
11
13
1.07
63190781--63190849
34
2.0
34
100
0
138
26
20
8
44
1.80
63193311--63193349
9
4.3
9
83
9
53
43
0
2
53
1.14
63193390--63193446
27
2.1
28
83
3
71
36
3
1
57
1.26
63193907--63193956
24
2.1
24
85
14
68
36
6
4
54
1.44
63194163--63194210
22
2.2
22
82
10
64
35
0
6
58
1.23
63210804--63210838
18
1.9
18
88
0
52
28
20
31
20
1.97
63210482--63210996
201
2.6
198
87
3
712
28
17
29
25
1.97
63211864--63211918
20
2.7
21
80
11
69
36
3
21
38
1.71
63216861--63216890
15
2.0
15
93
0
51
50
13
30
6
1.67

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228