Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  67973905

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   

This is table  91  of  228  ( 27298 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26542215--26542294
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22
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379
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26547382--26548186
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18.5
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1
26
46
1.60
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9.0
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21
0
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9.2
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21
0
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1.52
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14
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0
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45
1.52
26547514--26547581
15
4.6
15
73
14
61
22
0
32
45
1.52
26547547--26548215
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14.8
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1
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5.1
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482
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1
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31
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0
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73
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0
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16
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61
17
0
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1.45
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2.0
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1.64
26550606--26550665
22
2.7
23
84
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79
46
0
26
26
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26550606--26550665
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12
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26
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1.51
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2.0
21
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1.57
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178
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23
22
28
1.99
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23
2.0
24
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50
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19
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18
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0
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2.0
17
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52
45
0
0
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50
1.11
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16
4.2
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92
0
109
38
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18
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3.1
10
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4
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30
0
0
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0.88
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50
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0
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51
0
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3
5
53
1.40
26588825--26588895
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2.0
35
97
0
133
36
7
5
50
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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1
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1.31
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0
0
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22
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2
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1.90
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22
3.0
21
74
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27
15
16
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1.89
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3.2
14
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22
31
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25
29
23
21
1.99
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2.1
28
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0
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24
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1.94
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3
13
1.18
26598284--26598334
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15
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7
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13
1.18
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12
33
1.67
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3.1
20
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11
4
44
1.61
26605565--26605686
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21
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14
4
36
1.67
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100
0
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1.70
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3.5
11
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0
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5
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52
1.66
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1.18
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45
3
4
46
1.39
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2.6
49
74
11
123
43
2
2
51
1.27
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16
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2
0
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1.13
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5
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1.39
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1.12
26608104--26608155
15
3.6
15
80
12
56
44
0
1
53
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26608224--26608275
15
3.6
15
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0
1
53
1.11
26608349--26608395
15
3.3
15
82
11
55
44
0
2
53
1.12
26608464--26608515
15
3.6
15
80
12
56
44
0
1
53
1.11
26608589--26608635
15
3.3
15
82
11
55
44
0
2
53
1.12
26607932--26608838
38
22.7
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65
18
189
41
2
6
49
1.40
26608704--26608755
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3.6
15
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12
56
44
0
1
53
1.11
26608834--26608875
15
2.7
16
82
14
52
45
0
2
52
1.13
26608825--26608866
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0
0
52
1.00
26609016--26609110
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5
120
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27
4
30
1.76
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16
3.1
16
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0
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26
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2.1
12
100
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8
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52
1.60
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16
1.9
16
93
0
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25
19
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48
1.72
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25
2.4
25
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26
15
13
45
1.83
26632195--26632244
17
2.9
17
87
0
82
46
4
26
24
1.70
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17
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17
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0
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1.65
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6
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24
19
24
30
1.98
26650819--26651006
81
2.3
80
87
0
259
26
21
23
29
1.99
26651308--26651384
28
2.6
30
71
18
74
23
2
25
48
1.64
26652022--26652071
21
2.4
21
86
6
75
20
0
46
34
1.51
26652022--26652071
7
7.1
7
80
8
57
20
0
46
34
1.51
26652025--26652107
7
11.7
7
77
6
51
19
1
45
33
1.58
26652104--26652130
7
3.9
7
100
0
54
25
0
29
44
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26652810--26652854
23
1.9
24
90
4
74
55
8
13
22
1.65
26655007--26655031
11
2.3
11
100
0
50
24
52
0
24
1.48
26661591--26661651
28
2.2
28
85
5
81
45
0
3
50
1.17
26661509--26661651
44
3.2
43
69
20
121
46
2
3
48
1.31
26661488--26661676
91
2.1
91
92
0
315
44
2
4
48
1.36
26661826--26662133
59
5.2
57
66
22
159
40
2
5
51
1.37
26661692--26662231
120
4.5
121
95
1
865
41
2
5
50
1.39
26662059--26662110
15
3.6
15
80
12
56
44
0
1
53
1.11
26662188--26662229
15
2.7
16
82
14
52
45
0
2
52
1.13
26662179--26662220
15
2.9
15
82
10
52
47
0
0
52
1.00
26662443--26662496
16
3.4
16
92
0
90
27
35
1
35
1.68
26663867--26663959
42
2.2
43
82
1
107
26
11
29
32
1.92
26663954--26664002
20
2.5
20
90
9
75
51
0
4
44
1.20
26676786--26676817
3
10.7
3
93
0
55
71
0
0
28
0.86
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23
2.3
23
83
6
63
30
16
16
35
1.92
26678478--26678577
49
2.1
48
83
5
121
29
18
32
21
1.96
26678523--26678744
96
2.3
96
85
0
318
30
18
31
20
1.96
26678453--26678741
48
6.0
48
71
3
177
30
18
30
20
1.96
26695955--26696000
14
3.4
14
77
17
51
34
0
10
54
1.36
26695943--26696000
27
2.1
28
87
3
82
36
0
10
53
1.35
26696708--26696745
17
2.3
17
86
4
51
39
2
2
55
1.28
26698686--26698752
23
2.8
25
76
13
70
52
0
0
47
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26698669--26698778
20
5.1
21
68
19
75
53
0
0
45
1.06
26700905--26700936
14
2.2
15
94
5
57
25
6
0
68
1.12
26701021--26701061
21
2.0
21
85
4
57
36
0
7
56
1.27
26701046--26701110
25
2.5
25
80
5
67
30
4
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58
1.43
26701078--26701134
27
2.1
27
86
0
78
29
5
3
61
1.35
26706789--26706861
29
2.5
29
95
0
137
45
17
13
23
1.84
26706887--26706949
32
2.0
32
87
0
90
25
19
15
39
1.91
26706987--26707040
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2.0
27
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10
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29
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40
1.85
26709062--26709091
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2.5
12
94
0
51
76
13
3
6
1.11
26709443--26710002
107
5.2
101
77
15
491
59
15
0
24
1.41

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228