Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  67973905

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   

This is table  59  of  228  ( 27298 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17663730--17663800
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2.9
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23
17
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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17723597--17724375
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0
9
36
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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2.0
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1.74
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1.71
17848111--17848195
21
4.0
22
79
14
81
37
7
16
38
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17848161--17848205
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23
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266
28
15
25
30
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4.3
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25
25
1.97
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44
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13
150
32
20
22
24
1.98
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2.0
263
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2
790
31
20
22
25
1.98
17854903--17854979
19
3.8
19
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11
100
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6
16
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4
15
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1.66
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3.6
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4
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20
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1.98
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11
125
30
22
17
28
1.97
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2.6
181
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2
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19
17
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10
19
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1.70
17868636--17868670
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0
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0
17
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3
0
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10
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18
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2
30
1.19
17875873--17875916
19
2.3
19
88
7
63
68
2
4
25
1.20
17876168--17876214
19
2.4
20
85
3
60
31
2
2
63
1.18
17876615--17876664
22
2.3
22
80
12
59
60
0
38
2
1.09
17876603--17876680
27
2.8
27
81
14
88
61
0
35
2
1.10
17877246--17877310
21
3.1
21
70
12
62
53
0
3
43
1.16
17887095--17887141
21
2.2
22
88
3
69
23
36
19
21
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17890089--17890347
87
3.0
86
84
4
351
35
24
14
25
1.93
17890076--17890347
43
6.3
43
78
3
260
35
24
14
25
1.93
17896129--17896155
13
2.1
13
100
0
54
48
29
0
22
1.51
17897015--17897060
16
2.9
16
78
12
51
45
0
2
52
1.13
17896955--17897165
107
2.0
108
96
0
388
43
1
6
49
1.36
17897122--17897163
15
2.7
16
82
14
52
45
0
2
52
1.13
17897113--17897154
15
2.9
15
82
10
52
47
0
0
52
1.00
17897293--17897326
16
2.1
16
94
0
59
29
35
0
35
1.58
17898301--17898460
14
11.2
14
73
8
81
45
30
0
23
1.57
17898300--17898411
7
15.7
7
77
7
73
44
34
0
20
1.52
17898301--17898411
50
2.2
50
80
0
114
45
34
0
20
1.52
17898875--17898979
40
2.6
40
86
0
138
30
20
20
29
1.97
17898767--17899243
147
3.2
145
84
6
589
28
21
19
30
1.98
17898778--17899243
149
3.1
146
85
6
580
28
21
19
29
1.98
17899028--17899243
40
5.6
39
71
12
151
29
22
19
28
1.98
17899067--17899337
114
2.4
114
90
0
418
29
21
17
32
1.96
17901562--17901606
12
3.4
12
78
21
54
75
2
8
13
1.13
17901649--17901717
32
2.2
32
94
2
122
39
5
10
44
1.62
17902527--17902787
97
2.7
98
85
6
345
50
1
7
40
1.41
17902952--17902999
22
2.2
22
85
7
62
20
2
2
75
1.02
17907837--17907868
14
2.3
14
94
0
55
37
0
15
46
1.46
17908090--17908156
22
3.0
22
73
20
66
20
1
2
74
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17908092--17908138
21
2.2
20
85
11
58
21
0
2
76
0.89
17912973--17913026
27
2.0
27
100
0
108
22
11
11
55
1.66
17934193--17934228
3
12.0
3
100
0
72
66
0
0
33
0.92
17939575--17939653
13
6.0
13
72
8
52
41
17
0
40
1.50
17939575--17939646
27
2.7
25
76
16
65
43
18
0
38
1.50
17939629--17939695
13
5.0
13
77
13
73
35
10
1
52
1.45
17939626--17939695
28
2.6
27
74
14
81
34
11
1
52
1.46
17939611--17939698
41
2.1
41
91
0
140
35
15
1
47
1.53
17947009--17947122
40
2.9
39
77
6
113
39
20
19
21
1.93
17947009--17947147
40
3.5
38
74
10
109
41
20
17
20
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228