Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  67973905

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   

This is table  216  of  228  ( 27298 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63217924--63218054
36
3.6
36
75
8
138
55
0
5
38
1.28
63217858--63218051
74
2.6
74
90
1
280
54
0
6
38
1.31
63223202--63223271
28
2.6
28
84
4
81
60
2
10
27
1.43
63225464--63225501
17
2.2
17
90
0
58
52
5
2
39
1.38
63238104--63238147
23
2.0
22
86
4
61
31
0
0
68
0.90
63239491--63239520
7
4.3
7
100
0
60
56
0
0
43
0.99
63240612--63240667
18
3.1
18
70
14
51
50
7
0
42
1.30
63246090--63246823
366
2.0
366
99
0
1459
24
26
16
33
1.96
63258554--63258582
5
5.8
5
100
0
58
82
0
0
17
0.66
63258732--63258761
14
2.1
15
93
6
53
33
0
6
60
1.23
63262673--63262711
19
2.1
19
90
0
60
33
12
15
38
1.85
63266075--63266103
14
2.0
15
93
6
51
48
17
0
34
1.47
63268760--63268839
33
2.4
33
85
0
106
21
32
7
38
1.81
63287045--63287128
19
4.1
19
79
14
80
52
7
0
40
1.29
63292713--63292743
15
2.1
15
93
0
53
25
3
19
51
1.62
63303708--63303751
3
14.7
3
100
0
88
68
0
0
31
0.90
63305024--63305094
36
2.0
36
97
0
133
33
18
28
19
1.95
63306660--63306694
11
3.2
11
100
0
70
25
0
0
74
0.82
63312159--63312201
18
2.4
18
84
0
50
46
23
2
27
1.64
63323724--63324147
44
9.8
43
70
11
231
27
20
19
32
1.97
63323774--63324150
87
4.4
85
73
13
281
26
20
20
32
1.97
63323733--63324022
133
2.2
134
90
4
444
27
19
20
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63324112--63324490
87
4.4
84
84
5
279
23
22
23
30
1.99
63324306--63324443
44
3.2
43
68
7
134
28
23
21
26
1.99
63324190--63324500
87
3.6
86
89
6
425
22
21
23
32
1.98
63326632--63326660
8
3.6
8
100
0
58
13
0
13
72
1.13
63329195--63329243
19
2.5
20
80
6
57
42
12
18
26
1.85
63343597--63343622
3
8.7
3
100
0
52
69
0
0
30
0.89
63344213--63344249
12
2.9
13
84
8
58
56
8
0
35
1.29
63345566--63345592
3
9.0
3
100
0
54
66
0
0
33
0.92
63347426--63347463
19
2.1
19
95
5
69
65
0
0
34
0.93
63349914--63349950
19
1.9
19
88
0
56
51
0
0
48
1.00
63349980--63350016
16
2.3
16
85
0
56
32
0
0
67
0.91
63350041--63350079
16
2.3
17
91
8
62
43
0
0
56
0.99
63350124--63350156
13
2.4
14
85
10
50
45
0
0
54
0.99
63355296--63355338
17
2.6
17
81
3
52
60
0
4
34
1.17
63356474--63356523
17
2.7
20
78
18
70
10
0
44
46
1.37
63361114--63361163
17
2.7
20
78
18
70
10
0
44
46
1.37
63362558--63362632
28
2.6
28
93
2
132
53
2
6
37
1.41
63363239--63363540
42
7.2
42
84
5
328
33
20
21
24
1.97
63363249--63363540
85
3.5
84
82
7
353
33
20
21
24
1.97
63364787--63364821
14
2.5
14
95
0
61
45
25
8
20
1.79
63365047--63365103
25
2.4
24
76
5
62
43
1
0
54
1.10
63366502--63366566
32
2.0
32
100
0
130
24
15
29
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63368053--63368107
25
2.3
24
75
6
58
45
0
0
54
0.99
63370155--63370204
24
2.1
23
88
3
73
10
24
26
40
1.86
63372909--63372951
18
2.3
18
80
11
52
48
20
0
30
1.50
63373955--63374084
56
2.3
56
97
0
242
36
10
21
31
1.87
63375922--63375980
29
2.0
30
86
3
84
49
15
6
28
1.70
63375932--63376001
29
2.3
29
83
9
79
44
15
7
32
1.74
63376576--63376609
13
2.5
13
85
4
50
38
0
0
61
0.96
63379047--63379095
23
2.0
26
84
11
68
59
0
12
28
1.34
63379195--63379249
25
2.3
24
75
6
58
45
0
0
54
0.99
63387172--63387206
17
2.1
17
94
0
61
74
0
0
25
0.82
63403605--63403719
55
2.1
54
85
4
151
26
12
6
55
1.59
63405182--63405219
15
2.4
16
86
4
51
78
2
18
0
0.86
63405315--63405351
19
2.1
17
90
10
56
83
2
5
8
0.88
63405318--63405351
17
1.9
18
88
5
52
85
2
5
5
0.83
63415868--63415917
16
3.1
17
74
8
50
50
14
10
26
1.73
63431836--63432244
218
1.9
216
85
7
562
44
5
10
38
1.64
63432908--63432966
23
2.6
22
82
10
75
44
20
3
32
1.68
63440671--63440695
13
1.9
13
100
0
50
20
16
0
64
1.30
63443662--63443712
24
2.1
24
85
7
68
43
5
0
50
1.26
63444520--63444580
31
2.0
31
90
6
97
27
13
13
45
1.80
63445740--63445823
39
2.2
39
82
4
98
38
10
10
40
1.75
63448800--63448968
89
1.9
89
86
0
239
44
12
17
24
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63450260--63450439
84
2.1
84
82
6
222
48
11
7
31
1.68
63450457--63450500
23
1.9
23
90
0
70
63
2
0
34
1.07
63450822--63450878
30
1.9
30
92
0
96
35
15
3
45
1.64
63451248--63451485
97
2.5
98
79
9
251
36
19
6
36
1.77
63451563--63451712
50
3.1
50
73
14
159
32
19
6
42
1.77
63451545--63451699
47
3.2
47
73
12
152
32
19
7
40
1.80
63453052--63453091
15
2.5
17
84
12
57
30
7
0
62
1.23
63455472--63455521
23
2.2
23
89
7
75
48
2
0
50
1.12
63458874--63458959
30
2.8
31
80
1
111
37
6
17
38
1.77
63460069--63460114
23
2.0
23
100
0
92
26
17
4
52
1.63
63460150--63460209
31
1.9
31
86
0
84
35
13
8
43
1.74
63460761--63460861
33
3.2
33
76
13
131
37
13
15
32
1.87
63460747--63460861
61
1.9
61
96
0
212
39
15
14
30
1.88
63460747--63460839
28
3.1
28
78
14
114
39
15
16
29
1.88
63461021--63461068
22
2.2
22
92
0
78
43
16
10
29
1.81
63461583--63461632
26
1.9
26
91
0
82
36
22
4
38
1.73
63470780--63470853
37
2.0
37
100
0
148
29
13
8
48
1.71
63491549--63491600
9
5.8
9
95
0
95
36
30
9
23
1.87
63492871--63492909
21
1.9
20
84
5
51
71
5
10
12
1.28
63508688--63509070
134
2.8
134
88
3
540
36
12
19
32
1.88
63511039--63511097
32
1.9
30
82
6
73
35
0
11
52
1.38
63513840--63513895
27
2.1
26
83
3
67
35
5
3
55
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63517330--63517364
6
5.8
6
100
0
70
85
0
14
0
0.59
63535032--63535114
31
2.7
30
71
15
73
46
7
7
38
1.59
63542413--63542466
25
2.3
25
75
18
62
53
7
3
35
1.47
63546716--63546759
22
2.0
22
86
8
63
29
18
18
34
1.94
63557230--63557270
19
2.2
19
95
0
73
31
0
17
51
1.46
63557481--63557532
19
2.8
19
94
5
90
38
0
11
50
1.39
63557230--63557737
260
1.9
262
97
0
957
45
9
5
39
1.59
63557696--63557752
27
2.1
27
90
0
87
49
14
1
35
1.53
63557810--63557905
27
3.7
27
83
13
148
33
1
12
53
1.46
63557795--63557958
49
3.4
48
84
7
199
32
1
14
52
1.49
63558186--63558217
12
2.8
12
86
13
50
71
0
0
28
0.86
63558210--63558242
17
1.9
17
88
11
50
57
3
0
39
1.14
63569481--63569533
27
2.0
27
96
0
97
39
5
15
39
1.70
63573276--63573314
12
3.2
12
85
0
51
56
2
2
38
1.27
63575005--63575034
13
2.3
13
94
0
51
33
3
13
50
1.58
63575129--63575321
50
3.8
50
86
0
260
26
23
29
20
1.99
63585679--63585717
12
3.2
12
85
0
51
56
2
2
38
1.27
63592125--63592189
32
2.1
32
94
2
114
30
10
10
47
1.73
63597845--63597890
17
2.6
17
86
3
56
19
4
2
73
1.10
63606451--63606489
12
3.2
12
85
0
51
56
2
2
38
1.27
63612902--63612966
32
2.1
32
94
2
114
30
10
10
47
1.73
63613508--63613577
12
6.4
11
70
16
56
77
8
11
2
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63618625--63618670
17
2.6
17
86
3
56
19
4
2
73
1.10
63631974--63632252
51
5.5
51
91
2
427
29
24
13
31
1.94
63632223--63632280
7
8.3
7
84
0
62
22
31
5
41
1.76
63632223--63632280
14
4.1
14
84
0
71
22
31
5
41
1.76
63632223--63632280
21
2.8
21
81
0
71
22
31
5
41
1.76
63632243--63632377
58
2.3
58
96
0
234
25
23
15
35
1.94
63632180--63632332
79
1.9
79
91
0
252
26
25
12
35
1.91
63632301--63632332
7
4.6
7
96
0
55
18
31
9
40
1.83
63635551--63635588
19
2.1
19
90
5
60
52
15
0
31
1.43
63638356--63638397
18
2.3
18
87
0
66
40
26
26
7
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228